Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Synteza i analiza fragmentacyjna koniugatów peptydów z analogami betainy w poszukiwaniu nowych izobarycznych znaczników do proteomiki ilościowej

2013/09/B/ST4/00277

Słowa kluczowe:

białka i peptydy spektrometria mas projektowanie i synteza znaczników jonizacyjnych ilościowa analiza proteomu iTRAQ

Deskryptory:

  • ST4_3: Metody spektroskopowe i spektrometryczne
  • NZ2_3: Proteomika
  • ST5_23: Chemia organiczna

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Chemii

woj. dolnośląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Zbigniew Szewczuk 

Liczba wykonawców projektu: 10

Konkurs: OPUS 5 - ogłoszony 2013-03-15

Przyznana kwota: 940 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2014-02-10

Zakończenie projektu: 2017-07-09

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Wirówka. Za kwotę 35 000 PLN
  2. Zestaw do chromatografii typu "flash". Za kwotę 110 000 PLN
  3. Mała stołowa wirówka laboratoryjna.
  4. Zestaw do odparowywania rozpuszczalników (wyparka rotacyjna, system próżniowy, cyrkulator chłodzący). Za kwotę 38 000 PLN
  5. Cyrkulator chłodzący do wyparki.
  6. Generator wodoru. Za kwotę 11 008 PLN
  7. Dwustopniowa olejowa pompa próżniowa odporna chemicznie. Za kwotę 15 000 PLN
  8. Zestaw komputerowy.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (11)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (5)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Peptides Labeled with Pyridinium Salts for Sensitive Detection and Sequencing by Electrospray Tandem Mass Spectrometry IF: 5,228
    Autorzy:
    Waliczek M., Kijewska M., Rudowska M., Setner B., Stefanowicz P., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2016, tom: 6, strony: 37720:1-12), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/srep37720 - link do publikacji
  2. Preparation of novel deuterated cyclosporin A standards for quantitative LC‐MS analysis IF: 2,11
    Autorzy:
    Bąchor R., Kluczyk A., Stefanowicz P., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Journal of Mass Spectrometry (rok: 2017, tom: 52, strony: 817-822), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/jms.4025 - link do publikacji
  3. Analysis for trace amounts of analytes by electrospray mass spectrometry
    Autorzy:
    Wierzbicka M., Setner B., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Acta Physica Polonica B Proceedings Supplement (rok: 2016, tom: 9, strony: 345-350), Wydawca: Uniwersytet Jagielloński i Polska Akademia Umiejętności
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.5506/APhysPolBSupp.9.345 - link do publikacji
  4. Convenient preparation of deuteriumlabeled analogs of peptides containing N-substituted glycines for a stable isotope dilution LC-MS quantitative analysis IF: 1,705
    Autorzy:
    Bąchor R., Dębowski D., Łęgowska A., Stefanowicz P., Rolka K., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Journal of Peptide Science (rok: 2015, tom: 21, strony: 819-825), Wydawca: WILEY-BLACKWELL
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/psc.2823 - link do publikacji
  5. Facile synthesis of deuterium-labeled denatonium cation and its application in the quantitative analysis of Bitrex by liquid chromatography-mass spectrometry IF: 3,565
    Autorzy:
    Bąchor, R., Kluczyk A., Stefanowicz P., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Analytical and Bioanalytical Chemistry (rok: 2015, tom: 407, strony: 6557-6561), Wydawca: SPRINGER
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00216-015-8815-y - link do publikacji
  6. Hydrogen-deuterium exchange of α-carbon protons and fragmentation pathways in N-methylated glycine and alanine-containing peptides derivatized by quaternary ammonium salts. IF: 3,017
    Autorzy:
    Bąchor R., Rudowska M., Kluczyk A., Stefanowicz P., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Journal of Mass Spectrometry (rok: 2014, tom: 49, strony: 529-536), Wydawca: John Wiley & Sons
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/jms.3371 - link do publikacji
  7. Quaternary ammonium isobaric tag for a relative and absolute quantification of peptides IF: 2,11
    Autorzy:
    Setner B., Stefanowicz P., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Journal of Mass Spectrometry (rok: 2018, tom: 53, strony: 115-123), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/jms.4040 - link do publikacji
  8. Sensitive detection of charge derivatized peptides at the attomole level using nano-LC-ESI-MRM analysis IF: 2,082
    Autorzy:
    Bąchor R., Mielczarek P., Rudowska M., Silberring J., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    International Journal of Mass Spectrometry (rok: 2014, tom: 362, strony: 32-38), Wydawca: Elsevier Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.ijms.2014.02.018 - link do publikacji
  9. The 5-azoniaspiro[4.4]nonyl group for improved MS peptide analysis: A novel non-fragmenting ionization tag for mass spectrometric sensitive sequencing of peptides* IF: 5,123
    Autorzy:
    Setner B., Rudowska M., Kluczyk A., Stefanowicz P., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Analytica Chimica Acta (rok: 2017, tom: 986, strony: 71-81), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.aca.2017.07.029 - link do publikacji
  10. The unexpected racemization and hydrogen– deuterium exchange of the hydrogen at the α-carbon of proline analogs containing the 5-azoniaspiro[4.4]nonyl-group IF: 3,423
    Autorzy:
    Setner B., Wierzbicka M., Jerzykiewicz L., Lisowski M., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Organic & Biomolecular Chemistry (rok: 2018, tom: 16, strony: 825-831), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c7ob02926h - link do publikacji
  11. Peptides derivatized with bicyclic quaternary ammonium ionization tags. Sequencing via tandem mass spectrometry. IF: 3,017
    Autorzy:
    Setner B., Rudowska M., Klem E., Cebrat M., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Journal of Mass Spectrometry (rok: 2014, tom: 49, strony: 995-1001), Wydawca: John Wiley & Sons
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/jms.3410 - link do publikacji
  1. Preparation Of Deuterated Analogs Of Peptides With The 5-Azoniaspiro[4.4]Nonyl-Carbonyl Ionization Tag
    Autorzy:
    Setner B., Wierzbicka M., Lisowski M., Szewczuk Z.
    Konferencja:
    34th European Peptide Symposium and the 8th International Peptide Symposium (rok: 2017, ), Wydawca: European Peptide Society
    Data:
    konferencja 04 – 09.09.2016
    Status:
    Opublikowana
  2. Application Of Pyrylium Salts For Sensitive Sequencing Of Peptides By Electrospray Tandem Mass Spectrometry
    Autorzy:
    Waliczek M., Kijewska M., Rudowska M., Setner B.
    Konferencja:
    34th European Peptide Symposium and the 8th International Peptide Symposium (rok: 2017, ), Wydawca: European Peptide Society
    Data:
    konferencja 04 – 09.09.2016
    Status:
    Opublikowana
  3. Deuteration in methylene group of N,N,N-trialkylglycines: markers based on co-elution of isotopomers in chromatographic and mass spectrometric studies
    Autorzy:
    Kluczyk A., Bąchor R., Setner B., Szewczuk Z.
    Konferencja:
    33rd European Peptide Symposium (rok: 2015, ), Wydawca: Bulgarian Peptide Society, European Peptide Society
    Data:
    konferencja 31.08.2014-5.09.2014
    Status:
    Opublikowana
  4. Peptides labeled by 5-azoniaspiro[4.4]nonyl group for sensitive sequencing by electrospray tandem mass spectrometry
    Autorzy:
    Setner B., Rudowska M., Wojewska D., Kluczyk A., Stefanowicz P., Szewczuk Z.
    Konferencja:
    33rd European Peptide Symposium (rok: 2015, ), Wydawca: Bulgarian Peptide Society, European Peptide Society
    Data:
    konferencja 31.08.2014-5.09.2014
    Status:
    Opublikowana
  5. The Consequences Of Hydrogen-Deuterium Exchange In Phosphoniumacetyl-Modified Peptides
    Autorzy:
    Kluczyk A., Dambinova A., Bachor R., Setner B., Kijewska M., Biernat M., Stefanowicz P., Szewczuk Z.
    Konferencja:
    34th European Peptide Symposium and the 8th International Peptide Symposium (rok: 2017, ), Wydawca: European Peptide Society
    Data:
    konferencja 04 – 09.09.2016
    Status:
    Opublikowana
  1. Derivatization of peptides for improved detection by mass spectrometry
    Autorzy:
    Stefanowicz P., Kluczyk A., Szewczuk Z.
    Książka:
    Amino Acids, Peptides and Proteins (rok: 2016, tom: 40, strony: 36-74), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana