Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Synteza i analiza fragmentacyjna koniugatów peptydów z analogami betainy w poszukiwaniu nowych izobarycznych znaczników do proteomiki ilościowej

2013/09/B/ST4/00277

Słowa kluczowe:

białka i peptydy spektrometria mas projektowanie i synteza znaczników jonizacyjnych ilościowa analiza proteomu iTRAQ

Deskryptory:

  • ST4_3: Metody spektroskopowe i spektrometryczne
  • NZ2_3: Proteomika
  • ST5_23: Chemia organiczna

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna, m.in.:

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Chemii

woj. dolnośląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Zbigniew Szewczuk 

Liczba wykonawców projektu: 10

Konkurs: OPUS 5 - ogłoszony 2013-03-15

Przyznana kwota: 940 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2014-02-10

Zakończenie projektu: 2017-07-09

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Zestaw do odparowywania rozpuszczalników (wyparka rotacyjna, system próżniowy, cyrkulator chłodzący). Za kwotę 38 000 PLN
  2. Cyrkulator chłodzący do wyparki. Za kwotę 0 PLN
  3. Generator wodoru. Za kwotę 11 008 PLN
  4. Mała stołowa wirówka laboratoryjna. Za kwotę 0 PLN
  5. Dwustopniowa olejowa pompa próżniowa odporna chemicznie. Za kwotę 15 000 PLN
  6. Zestaw do chromatografii typu "flash". Za kwotę 110 000 PLN
  7. Zestaw komputerowy. Za kwotę 0 PLN
  8. Wirówka. Za kwotę 35 000 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (11)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (5)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Convenient preparation of deuteriumlabeled analogs of peptides containing N-substituted glycines for a stable isotope dilution LC-MS quantitative analysis IF: 1,705
    Autorzy:
    Bąchor R., Dębowski D., Łęgowska A., Stefanowicz P., Rolka K., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Journal of Peptide Science (rok: 2015, tom: 21, strony: 819-825), Wydawca: WILEY-BLACKWELL
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1002/psc.2823 - link do publikacji
  2. The 5-azoniaspiro[4.4]nonyl group for improved MS peptide analysis: A novel non-fragmenting ionization tag for mass spectrometric sensitive sequencing of peptides* IF: 5,123
    Autorzy:
    Setner B., Rudowska M., Kluczyk A., Stefanowicz P., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Analytica Chimica Acta (rok: 2017, tom: 986, strony: 71-81), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1016/j.aca.2017.07.029 - link do publikacji
  3. Peptides Labeled with Pyridinium Salts for Sensitive Detection and Sequencing by Electrospray Tandem Mass Spectrometry IF: 5,228
    Autorzy:
    Waliczek M., Kijewska M., Rudowska M., Setner B., Stefanowicz P., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2016, tom: 6, strony: 37720:1-12), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1038/srep37720 - link do publikacji
  4. Quaternary ammonium isobaric tag for a relative and absolute quantification of peptides IF: 2,11
    Autorzy:
    Setner B., Stefanowicz P., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Journal of Mass Spectrometry (rok: 2018, tom: 53, strony: 115-123), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1002/jms.4040 - link do publikacji
  5. Analysis for trace amounts of analytes by electrospray mass spectrometry
    Autorzy:
    Wierzbicka M., Setner B., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Acta Physica Polonica B Proceedings Supplement (rok: 2016, tom: 9, strony: 345-350), Wydawca: Uniwersytet Jagielloński i Polska Akademia Umiejętności
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.5506/APhysPolBSupp.9.345 - link do publikacji
  6. Hydrogen-deuterium exchange of α-carbon protons and fragmentation pathways in N-methylated glycine and alanine-containing peptides derivatized by quaternary ammonium salts. IF: 3,017
    Autorzy:
    Bąchor R., Rudowska M., Kluczyk A., Stefanowicz P., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Journal of Mass Spectrometry (rok: 2014, tom: 49, strony: 529-536), Wydawca: John Wiley & Sons
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1002/jms.3371 - link do publikacji
  7. Peptides derivatized with bicyclic quaternary ammonium ionization tags. Sequencing via tandem mass spectrometry. IF: 3,017
    Autorzy:
    Setner B., Rudowska M., Klem E., Cebrat M., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Journal of Mass Spectrometry (rok: 2014, tom: 49, strony: 995-1001), Wydawca: John Wiley & Sons
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1002/jms.3410 - link do publikacji
  8. Facile synthesis of deuterium-labeled denatonium cation and its application in the quantitative analysis of Bitrex by liquid chromatography-mass spectrometry IF: 3,565
    Autorzy:
    Bąchor, R., Kluczyk A., Stefanowicz P., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Analytical and Bioanalytical Chemistry (rok: 2015, tom: 407, strony: 6557-6561), Wydawca: SPRINGER
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1007/s00216-015-8815-y - link do publikacji
  9. Preparation of novel deuterated cyclosporin A standards for quantitative LC‐MS analysis IF: 2,11
    Autorzy:
    Bąchor R., Kluczyk A., Stefanowicz P., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Journal of Mass Spectrometry (rok: 2017, tom: 52, strony: 817-822), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1002/jms.4025 - link do publikacji
  10. Sensitive detection of charge derivatized peptides at the attomole level using nano-LC-ESI-MRM analysis IF: 2,082
    Autorzy:
    Bąchor R., Mielczarek P., Rudowska M., Silberring J., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    International Journal of Mass Spectrometry (rok: 2014, tom: 362, strony: 32-38), Wydawca: Elsevier Science
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1016/j.ijms.2014.02.018 - link do publikacji
  11. The unexpected racemization and hydrogen– deuterium exchange of the hydrogen at the α-carbon of proline analogs containing the 5-azoniaspiro[4.4]nonyl-group IF: 3,423
    Autorzy:
    Setner B., Wierzbicka M., Jerzykiewicz L., Lisowski M., Szewczuk Z.
    Czasopismo:
    Organic & Biomolecular Chemistry (rok: 2018, tom: 16, strony: 825-831), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowane
    Doi:
    10.1039/c7ob02926h - link do publikacji
  1. Deuteration in methylene group of N,N,N-trialkylglycines: markers based on co-elution of isotopomers in chromatographic and mass spectrometric studies
    Autorzy:
    Kluczyk A., Bąchor R., Setner B., Szewczuk Z.
    Konferencja:
    33rd European Peptide Symposium (rok: 2015, ), Wydawca: Bulgarian Peptide Society, European Peptide Society
    Data:
    konferencja 31.08.2014-5.09.2014
    Status:
    Opublikowane
  2. Peptides labeled by 5-azoniaspiro[4.4]nonyl group for sensitive sequencing by electrospray tandem mass spectrometry
    Autorzy:
    Setner B., Rudowska M., Wojewska D., Kluczyk A., Stefanowicz P., Szewczuk Z.
    Konferencja:
    33rd European Peptide Symposium (rok: 2015, ), Wydawca: Bulgarian Peptide Society, European Peptide Society
    Data:
    konferencja 31.08.2014-5.09.2014
    Status:
    Opublikowane
  3. Preparation Of Deuterated Analogs Of Peptides With The 5-Azoniaspiro[4.4]Nonyl-Carbonyl Ionization Tag
    Autorzy:
    Setner B., Wierzbicka M., Lisowski M., Szewczuk Z.
    Konferencja:
    34th European Peptide Symposium and the 8th International Peptide Symposium (rok: 2017, ), Wydawca: European Peptide Society
    Data:
    konferencja 04 – 09.09.2016
    Status:
    Opublikowane
  4. The Consequences Of Hydrogen-Deuterium Exchange In Phosphoniumacetyl-Modified Peptides
    Autorzy:
    Kluczyk A., Dambinova A., Bachor R., Setner B., Kijewska M., Biernat M., Stefanowicz P., Szewczuk Z.
    Konferencja:
    34th European Peptide Symposium and the 8th International Peptide Symposium (rok: 2017, ), Wydawca: European Peptide Society
    Data:
    konferencja 04 – 09.09.2016
    Status:
    Opublikowane
  5. Application Of Pyrylium Salts For Sensitive Sequencing Of Peptides By Electrospray Tandem Mass Spectrometry
    Autorzy:
    Waliczek M., Kijewska M., Rudowska M., Setner B.
    Konferencja:
    34th European Peptide Symposium and the 8th International Peptide Symposium (rok: 2017, ), Wydawca: European Peptide Society
    Data:
    konferencja 04 – 09.09.2016
    Status:
    Opublikowane
  1. Derivatization of peptides for improved detection by mass spectrometry
    Autorzy:
    Stefanowicz P., Kluczyk A., Szewczuk Z.
    Książka:
    Amino Acids, Peptides and Proteins (rok: 2016, tom: 40, strony: 36-74), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowane