Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Badania metagenomiczne plazmidów pochodzących z próbek środowiskowych

2011/01/D/NZ2/04817

Słowa kluczowe:

metagenomika plazmid origin replikacji

Deskryptory:

  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
  • NZ2_7: Bioinformatyka

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Gdański, Wydział Biologii

woj. pomorskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Joanna Łoś 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: SONATA 1 - ogłoszony 2011-03-15

Przyznana kwota: 907 500 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2011-12-21

Zakończenie projektu: 2016-12-20

Planowany czas trwania projektu: 60 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Blok grzejny. Za kwotę 3 500 PLN
  2. System dod dokumentacji żeli. Za kwotę 25 000 PLN
  3. Termocykler gradientowy.
  4. Wirówka z chłodzeniem. Za kwotę 20 000 PLN
  5. Komputer. Za kwotę 4 000 PLN
  6. Wytrząsarka mikrobiologiczna. Za kwotę 10 000 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (7)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (7)
  1. Sampling, metadata and DNA extraction – important steps in metagenomics studies IF: 1,389
    Autorzy:
    Agnieszka Felczykowska, Anna Krajewska, Sylwia Zielińska, Joanna M. Łoś
    Czasopismo:
    Acta Biochimi. Pol. (rok: 2015, tom: 62, strony: brak), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
    Status:
    Opublikowana
  2. The most widespread problems in the function-based microbal metagenomics IF: 1,389
    Autorzy:
    Agnieszka Felczykowska, Anna Krajewska, Sylwia Zielińska, Joanna M. Łoś, Sylwia Bloch, Bożena Nejman-Faleńczyk
    Czasopismo:
    Acta Biochimi. Pol. (rok: 2015, tom: 62, strony: brak), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.18388/abp.2014_917 - link do publikacji
  3. Environmental DNA as a valuable and unique source of information about ecological networks in Arctic terrestrial ecosystems IF: 4,63
    Autorzy:
    Sylwia Zielińska, Dorota Kidawa, Lech Stempniewicz, Marcin Łoś, Joanna M. Łoś
    Czasopismo:
    Environmental Reviews (rok: 2017, tom: nie dotyczy, strony: nie dotyczy), Wydawca: NRC Research Press
    Status:
    Przyjęta do publikacji
    Doi:
    10.1139/er-2016-0060 - link do publikacji
  4. The Arctic soil bacterial communities in the vicinity of a little auk colony IF: 4,165
    Autorzy:
    Sylwia Zielińska, Dorota Kidawa, Lech Stempniewicz, Marcin Łoś, Joanna M. Łoś
    Czasopismo:
    Frontiers in Microbiology (rok: 2016, tom: 7, strony: 44570), Wydawca: Frontiers Media S.A.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fmicb.2016.01298 - link do publikacji
  5. Microbial community composition in a phosphogypsum waste heap soil IF: 3,53
    Autorzy:
    Sylwia Zielińska, Piotr Radkowski, Tadeusz Ossowski, Agnieszka Ludwig-Gałęzowska, Joanna M Łoś, Marcin Łoś
    Czasopismo:
    FEMS Microbiology Ecology (rok: 2017, tom: nie dotyczy, strony: nie dotyczy), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Złożona
  6. DNA extracted from faeces as a source of information about endemic reindeer from the High Arctic: detection of Shiga toxin genes and the analysis of reindeer male-specific DNA IF: 1,711
    Autorzy:
    Sylwia Zielińska, Dorota Kidawa, Lech Stempniewicz, Marcin Łoś, Joanna M. Łoś
    Czasopismo:
    Polar Biology (rok: 2016, tom: nie dotyczy, strony: nie dotyczy), Wydawca: Springer Link
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00300-016-1990-2 - link do publikacji
  7. New Insights into the Microbiota of the Svalbard Reindeer Rangifer tarandus platyrhynchus IF: 3,989
    Autorzy:
    Sylwia Zielińska, Dorota Kidawa, Lech Stempniewicz, Marcin Łoś and Joanna M. Łoś
    Czasopismo:
    Frontiers in Microbiology (rok: 2016, tom: 7, strony: 170), Wydawca: Frontiers Media S.A.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fmicb.2016.00170 - link do publikacji
  1. Advantages and disadvantages of metagenomic approaches – the young scientist point of view
    Autorzy:
    S. Zielińska, M. Łoś, J.M. Łoś
    Konferencja:
    BioTech Conference (rok: 2014, ), Wydawca: Politechnika Gdańska
    Data:
    konferencja 04-05.07
    Status:
    Opublikowana
  2. Possible problems that young scientist can meet when extracting DNA from soil sample
    Autorzy:
    S. Zielińska, M. Łoś, J.M. Łoś
    Konferencja:
    BioTech Conference (rok: 2014, ), Wydawca: Politechnika Gdańska
    Data:
    konferencja 04-05.07
    Status:
    Opublikowana
  3. Metagenomic approaches as tool to finding the origin of replication directly from enviromental samples
    Autorzy:
    S. Zielińska
    Konferencja:
    7th International Conference of PhD Students of Szczecin University (rok: 2014, ), Wydawca: Uniwersytet Szczeciński
    Data:
    konferencja 17,1
    Status:
    Opublikowana
  4. Applications, advantages and disadvantages of metagenomic approaches
    Autorzy:
    Sylwia Zielińska, Marcin Łoś, Joanna M. Łoś
    Konferencja:
    Symbiose, 18th Symposium for Biology Students in Europe (rok: 2015, ), Wydawca: brak
    Data:
    konferencja 23-31.07
    Status:
    Opublikowana
  5. Novel methods for extraction and purification of plasmid DNA from aquatic environments
    Autorzy:
    Aleksandra Małachowska, Anna Krajewska, Marcin Łoś, Joanna M. Łoś
    Konferencja:
    6th International Weigl Conference on Microbiology (rok: 2015, ), Wydawca: brak
    Data:
    konferencja 8-10.07
    Status:
    Opublikowana
  6. Soil and feces as a valuable source of information about Arctic ecosystem
    Autorzy:
    Sylwia Zielińska
    Konferencja:
    International Sopot Youth Conference (rok: 2016, ), Wydawca: brak
    Data:
    konferencja 20.05.
    Status:
    Opublikowana
  7. Cellulolytic bacteria from digestive tract of Svalbard reindeer (Rangifer tarandus platyrhynchus)
    Autorzy:
    Sylwia Zielińska, Dorota Kidawa, Lech Stempniewicz, Marcin Łoś, Joanna M. Łoś
    Konferencja:
    6th International Weigl Conference on Microbiology (rok: 2015, ), Wydawca: brak
    Data:
    konferencja 8-10.07
    Status:
    Opublikowana