Badania metagenomiczne plazmidów pochodzących z próbek środowiskowych
2011/01/D/NZ2/04817
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ2_7: Bioinformatyka
Panel
NZ2 – Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca
Uniwersytet Gdański, Wydział Biologii
woj. pomorskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 2
Konkurs
SONATA 1 – ogłoszony 2011-03-15
- Przyznana kwota
- 907 500 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2011-12-21
- Zakończenie projektu
- 2016-12-20
- Planowany czas trwania projektu
- 60 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Blok grzejny. Za kwotę 3 500 PLN
- Komputer. Za kwotę 4 000 PLN
- System dod dokumentacji żeli. Za kwotę 25 000 PLN
- Termocykler gradientowy.
- Wirówka z chłodzeniem. Za kwotę 20 000 PLN
- Wytrząsarka mikrobiologiczna. Za kwotę 10 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (6)
-
The Arctic soil bacterial communities in the vicinity of a little auk colony
- Autorzy:
- Sylwia Zielińska, Dorota Kidawa, Lech Stempniewicz, Marcin Łoś, Joanna M. Łoś
- Czasopismo:
- Frontiers in Microbiology (rok: 2016, tom: 7, strony: 46031), Wydawca: Frontiers Media S.A.
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3389/fmicb.2016.01298 – link do publikacji
-
DNA extracted from faeces as a source of information about endemic reindeer from the High Arctic: detection of Shiga toxin genes and the analysis of reindeer male-specific DNA
- Autorzy:
- Sylwia Zielińska, Dorota Kidawa, Lech Stempniewicz, Marcin Łoś, Joanna M. Łoś
- Czasopismo:
- Polar Biology (rok: 2016, tom: nie dotyczy, strony: nie dotyczy), Wydawca: Springer Link
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s00300-016-1990-2 – link do publikacji
-
New Insights into the Microbiota of the Svalbard Reindeer Rangifer tarandus platyrhynchus
- Autorzy:
- Sylwia Zielińska, Dorota Kidawa, Lech Stempniewicz, Marcin Łoś and Joanna M. Łoś
- Czasopismo:
- Frontiers in Microbiology (rok: 2016, tom: 7, strony: 170), Wydawca: Frontiers Media S.A.
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3389/fmicb.2016.00170 – link do publikacji
-
Sampling, metadata and DNA extraction – important steps in metagenomics studies
- Autorzy:
- Agnieszka Felczykowska, Anna Krajewska, Sylwia Zielińska, Joanna M. Łoś
- Czasopismo:
- Acta Biochimi. Pol. (rok: 2015, tom: 62, strony: brak), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
- Status:
- Opublikowana
-
The most widespread problems in the function-based microbal metagenomics
- Autorzy:
- Agnieszka Felczykowska, Anna Krajewska, Sylwia Zielińska, Joanna M. Łoś, Sylwia Bloch, Bożena Nejman-Faleńczyk
- Czasopismo:
- Acta Biochimi. Pol. (rok: 2015, tom: 62, strony: brak), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.18388/abp.2014_917 – link do publikacji
-
Environmental DNA as a valuable and unique source of information about ecological networks in Arctic terrestrial ecosystems
- Autorzy:
- Sylwia Zielińska, Dorota Kidawa, Lech Stempniewicz, Marcin Łoś, Joanna M. Łoś
- Status:
- Przyjęta do publikacji
Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (7)
-
Metagenomic approaches as tool to finding the origin of replication directly from enviromental samples
- Autorzy:
- S. Zielińska
- Konferencja:
- 7th International Conference of PhD Students of Szczecin University (rok: 2014, strony: brak), Wydawca: Uniwersytet Szczeciński
- Data:
- konferencja 17,1
- Status:
- Opublikowana
-
Novel methods for extraction and purification of plasmid DNA from aquatic environments
- Autorzy:
- Aleksandra Małachowska, Anna Krajewska, Marcin Łoś, Joanna M. Łoś
- Konferencja:
- 6th International Weigl Conference on Microbiology (rok: 2015, strony: 136), Wydawca: brak
- Data:
- konferencja 8-10.07
- Status:
- Opublikowana
-
Possible problems that young scientist can meet when extracting DNA from soil sample
- Autorzy:
- S. Zielińska, M. Łoś, J.M. Łoś
- Konferencja:
- BioTech Conference (rok: 2014, strony: brak), Wydawca: Politechnika Gdańska
- Data:
- konferencja 04-05.07
- Status:
- Opublikowana
-
Soil and feces as a valuable source of information about Arctic ecosystem
- Autorzy:
- Sylwia Zielińska
- Konferencja:
- International Sopot Youth Conference (rok: 2016, strony: nie dotyczy), Wydawca: brak
- Data:
- konferencja 20.05.
- Status:
- Opublikowana
-
Cellulolytic bacteria from digestive tract of Svalbard reindeer (Rangifer tarandus platyrhynchus)
- Autorzy:
- Sylwia Zielińska, Dorota Kidawa, Lech Stempniewicz, Marcin Łoś, Joanna M. Łoś
- Konferencja:
- 6th International Weigl Conference on Microbiology (rok: 2015, strony: 148), Wydawca: brak
- Data:
- konferencja 8-10.07
- Status:
- Opublikowana
-
Applications, advantages and disadvantages of metagenomic approaches
- Autorzy:
- Sylwia Zielińska, Marcin Łoś, Joanna M. Łoś
- Konferencja:
- Symbiose, 18th Symposium for Biology Students in Europe (rok: 2015, strony: 55), Wydawca: brak
- Data:
- konferencja 23-31.07
- Status:
- Opublikowana
-
Advantages and disadvantages of metagenomic approaches – the young scientist point of view
- Autorzy:
- S. Zielińska, M. Łoś, J.M. Łoś
- Konferencja:
- BioTech Conference (rok: 2014, strony: brak), Wydawca: Politechnika Gdańska
- Data:
- konferencja 04-05.07
- Status:
- Opublikowana