Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Analiza transkryptomów ogórka w rozwiązaniu zagadnienia determinacji płci roślin

2011/01/B/NZ2/01631

Słowa kluczowe:

transkryptom Cucumis sativus deterrminacja płci sekwencjonowanie Illumina

Deskryptory:

  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
  • NZ3_10: Genetyka rozwoju roślin
  • NZ9_4: Naukowe podstawy ogrodnictwa

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie, Wydział Ogrodnictwa i Architektury Krajobrazu, Katedra Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Magdalena Pawełkowicz 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: OPUS 1 - ogłoszony 2011-03-15

Przyznana kwota: 699 600 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2011-12-06

Zakończenie projektu: 2015-12-05

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. komputer przenośny. Za kwotę 8 000 PLN
  2. zestaw komputerowy. Za kwotę 17 000 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (5)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (12)
  1. Next generation sequencing and omics in cucumber (Cucumis sativusL.) breeding directed research IF: 3,61
    Autorzy:
    Magdalena Pawełkowicza, Konrad Zielinski, Dorota Zielinska, Wojciech Plader,Kouhei Yagi, Michał Wojcieszek, Ewa Siedlecka, Grzegorz Bartoszewski,Agnieszka Skarzynska, Zbigniew Przybecki
    Czasopismo:
    Plant Science (rok: 2016, tom: 242, strony: 77-88), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.plantsci.2015.07.025 - link do publikacji
  2. Comparative analysis of novel CsABI1 and CsABI2 genes in monoecious and gynoecious cucumber lines IF: 0,596
    Autorzy:
    Magdalena Pawełkowicz,Tomasz Krzywkowski, Paweł Osipowski, Michał Wojcieszek, Kouhei Yagi, Wojciech Pląder, Zbigniew Przybecki
    Czasopismo:
    Genes and Genomics , Wydawca: Springer Link
    Status:
    Złożona
  3. Identification and characterization of genes connected with flower morphogenesis in cucumber
    Autorzy:
    M. Pawełkowicz, P. Osipowski, M. Wojcieszek, R. Wóycicki, J. Witkowicz, D. Hincha, Z. Przybecki
    Czasopismo:
    BioTechnologia (rok: 2012, tom: 93 (2), strony: 123-134), Wydawca: Scientific Publishers OWN -BioTechnologia - Comittee on Biotechnology Polish Academy of Scince; Institute of Bioorganic Chemistry Polish Academy of Sciences
    Status:
    Opublikowana
  4. GENETIC AND MOLECULAR BASES OF CUCUMBER (Cucumis sativus L.) SEX DEVELOPMENT IF: 2,237
    Autorzy:
    MAGDALENA EWA PAWEŁKOWICZ, AGNIESZKA SKARZYŃSKA, WOJCIECH PLĄDER, ZBIGNIEW PRZYBECKI
    Czasopismo:
    Journal of Plant Growth Regulation , Wydawca: Springer
    Status:
    Złożona
  5. Plant microRNAs—their significance and potential applications IF: 3,145
    Autorzy:
    Maria Szwacka*, Zbigniew Przybecki, Magdalena Pawełkowicz, Paweł Osipowski, Michał Wojcieszek, Wojciech Pląder
    Czasopismo:
    Functional Plant Biology , Wydawca: CSIRO Publishing
    Status:
    Złożona
  1. Genomic identyfication and characterization of GY/gy gene in cucumber
    Autorzy:
    OSIPOWSKI P., WÓYCICKI R., WITKOWICZ J., PAWEŁKOWICZ M., WOJCIESZEK M., SIEDLECKA E., GUTMAN W., PRZYBECKI Z.,
    Konferencja:
    IV POLSKI KONGRES GENETYKI (rok: 2013, ), Wydawca: Fundacja Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
    Data:
    konferencja 10-13 września
    Status:
    Opublikowana
  2. The differential expression of genes potentially involved in cucumber floral buds development
    Autorzy:
    Pawełkowicz M; Osipowski P; Przybecki Z
    Konferencja:
    XIII conference on Molecular biology in diagnostics of infectious diseases and biotechnology (rok: 2012, ), Wydawca: Committee on Microbiology; Committee of Veterinary Scinces Division II Biological & Agriclutural Sciences Polish Academy of Sciences
    Data:
    konferencja 24.11.2012
    Status:
    Opublikowana
  3. The genome-wide overview of genes connected with flower morphogenesis in cucumber
    Autorzy:
    M. Pawełkowicz, M.Wojcieszek, J. Witkowicz, P.Osipowski, R.Wóycicki, D. Hincha, Z.Przybecki
    Konferencja:
    XIII Overall Polish in vitro Culture and Plant Biotechnology Conference (rok: 2012, ), Wydawca: BioTechnologia - Comittee on Biotechnology Polish Academy of Scince; Institute of Bioorganic Chemistry Polish Academy of Sciences
    Data:
    konferencja 24-27.09.2013
    Status:
    Opublikowana
  4. Computational structural variation discovery in genomes | state of the art and challenges
    Autorzy:
    Paweł Osipowski, Magdalena Pawełkowicz, Zbigniew Przybecki
    Konferencja:
    XXXIV-th IEEE-SPIE Joint Symposium on Photonics, Web Engineering, Electronics for Astronomy and High Energy Physics Experiment (rok: 2014, ), Wydawca: SPIE
    Data:
    konferencja 26.05.2014 - 01.06.2014
    Status:
    Opublikowana
  5. Identification and analysys of WUSCHEL (WUS/WOX) and CLAVATA genes in cucumber (Cucumis sativus L.).
    Autorzy:
    WOJCIESZEK M., PAWEŁKOWICZ M., OLSZAK M.L., JĘDRZEJUK A., PRZYBECKI Z., BURZA W.
    Konferencja:
    5th Central European Congress of Life Science EUROBIOTECH 2013 (rok: 2013, ), Wydawca: Polish Ministry of Science and Higher Education
    Data:
    konferencja 8th-11th October
    Status:
    Opublikowana
  6. The role of ubiquitins in cucumber (C. sativus L.) flower morphogenesis.
    Autorzy:
    PAWEŁKOWICZ M., KOWALCZUK C., OSIPOWSKI P., WOJCIESZEK M., KOJDER G., KOSIK K., PRZYBECKI Z.
    Konferencja:
    5th Central European Congress of Life Science EUROBIOTECH 2013 (rok: 2013, ), Wydawca: Polish Ministry of Science and Higher Education
    Data:
    konferencja 8th-11th October
    Status:
    Opublikowana
  7. Advantages and disadvantages in usage of bioinformatic programs in promoter region analysis
    Autorzy:
    Magdalena Ewa Pawełkowicz, Agnieszka Skarzyńska, Kacper Posyniak, Karolina Ziąbska, Wojciech Pląder, Zbigniew Przybecki
    Konferencja:
    XXXVIth IEEE-SPIE Joint Symposium on Photonics, Web Engineering, Electronics for Astronomy and High Energy Physics Experiment (rok: 2015, ), Wydawca: SPIE
    Data:
    konferencja 25-31 V 2015
    Status:
    Opublikowana
  8. Comparative Analysis of Transcriptomes Connected with Sex Expression in Cucumber.
    Autorzy:
    Pawelkowicz M. Pryszcz L. Wojcieszek, M. Osipowski P. Plader W. Przybecki Z
    Konferencja:
    Pawelkowicz M. Pryszcz L. Wojcieszek, M. Osipowski P. Plader W. Przybecki Z. (2015, January). Comparative Analysis of Transcriptomes Connected with Sex Expression in Cucumber. In Plant and Animal Genome XXIII Conference. Plant and Animal Genome.USA San Diego P0476 (rok: 2015, ), Wydawca: PAG
    Data:
    konferencja 10- 14. I
    Status:
    Opublikowana
  9. Automated functional annotation using classification and data fusion algorithms for genomic, transcriptomic and proteomic science
    Autorzy:
    Nowotka M, Pawełkowicz M, Wojcieszek M, Przybecki Z, Nowak R
    Konferencja:
    XIII conference on Molecular biology in diagnostics of infectious diseases and biotechnology (rok: 2012, ), Wydawca: Committee on Microbiology; Committee of Veterinary Scinces Division II Biological & Agriclutural Sciences Polish Academy of Sciences
    Data:
    konferencja 24.11.2012
    Status:
    Opublikowana
  10. Genomes correction and assembling - present methods and tools
    Autorzy:
    Michał Wojcieszek, Magdalena Pawełkowicz, Robert Nowak, Zbigniew Przybecki
    Konferencja:
    XXXIV-th IEEE-SPIE Joint Symposium on Photonics, Web Engineering, Electronics for Astronomy and High Energy Physics Experiment (rok: 2014, ), Wydawca: SPIE
    Data:
    konferencja 26.05.2014 - 01.06.2014
    Status:
    Opublikowana
  11. Identification and characterization of novel CsABI1 and CsABI2 genes in cucumber genome using comprarative analysis
    Autorzy:
    PAWEŁKOWICZ M., KRZYWKOWSKI T., KOWALCZUK C., WÓYCICKI R., OSIPOWSKI P., PRZYBECKI Z.
    Konferencja:
    IV POLSKI KONGRES GENETYKI (rok: 2013, ), Wydawca: Fundacja Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
    Data:
    konferencja 10-13 września
    Status:
    Opublikowana
  12. The discrepancies in the results of bioinformatics tools for genomic structural annotation
    Autorzy:
    Magdalena Pawełkowicz, Robert Nowak, Paweł Osipowski, Jacek Rymuszka, Katarzyna Świerkula, Michał Wojcieszek1, Zbigniew Przybecki
    Konferencja:
    XXXIV-th IEEE-SPIE Joint Symposium on Photonics, Web Engineering, Electronics for Astronomy and High Energy Physics Experiments (rok: 2014, ), Wydawca: SPIE
    Data:
    konferencja 26.05.2014 - 01.06.2014
    Status:
    Opublikowana