Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

The cucumber transcriptome analysis unravels the sex determination mechanism in plants

2011/01/B/NZ2/01631

Keywords:

transcriptom profile Cucumis sativus sex determiantion Illumina sequencing

Descriptors:

  • NZ2_2:
  • NZ3_10:
  • NZ9_4:

Panel:

NZ2 - Genetics, genomics: molecular genetics, genomics, proteomics, bioinformatics, systems biology, genetic epidemiology

Host institution :

Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie, Wydział Ogrodnictwa i Architektury Krajobrazu; Katedra Genetyki, Hodowli i Biotechnologii Roślin

woj. mazowieckie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

dr Magdalena Ewa Pawełkowicz 

Number of co-investigators in the project: 6

Call: OPUS 1 - announced on 2011-03-15

Amount awarded: 699 600 PLN

Project start date (Y-m-d): 2011-12-06

Project end date (Y-m-d): 2015-12-05

Project duration:: 48 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Equipment purchased [PL]

  1. komputer przenośny (8 000 PLN)
  2. zestaw komputerowy (17 000 PLN)

Information in the final report

  • Articles in post-conference publications (12)
  1. Identification and analysys of WUSCHEL (WUS/WOX) and CLAVATA genes in cucumber (Cucumis sativus L.).
    Authors:
    WOJCIESZEK M., PAWEŁKOWICZ M., OLSZAK M.L., JĘDRZEJUK A., PRZYBECKI Z., BURZA W.
    Conference:
    5th Central European Congress of Life Science EUROBIOTECH 2013 (rok: 2013, ), Wydawca: Polish Ministry of Science and Higher Education
    Data:
    konferencja 8th-11th October
    Status:
    Published
  2. Computational structural variation discovery in genomes | state of the art and challenges
    Authors:
    Paweł Osipowski, Magdalena Pawełkowicz, Zbigniew Przybecki
    Conference:
    XXXIV-th IEEE-SPIE Joint Symposium on Photonics, Web Engineering, Electronics for Astronomy and High Energy Physics Experiment (rok: 2014, ), Wydawca: SPIE
    Data:
    konferencja 26.05.2014 - 01.06.2014
    Status:
    Published
    DOI:
    link to the publication
  3. Comparative Analysis of Transcriptomes Connected with Sex Expression in Cucumber.
    Authors:
    Pawelkowicz M. Pryszcz L. Wojcieszek, M. Osipowski P. Plader W. Przybecki Z
    Conference:
    Pawelkowicz M. Pryszcz L. Wojcieszek, M. Osipowski P. Plader W. Przybecki Z. (2015, January). Comparative Analysis of Transcriptomes Connected with Sex Expression in Cucumber. In Plant and Animal Genome XXIII Conference. Plant and Animal Genome.USA San Diego P0476 (rok: 2015, ), Wydawca: PAG
    Data:
    konferencja 10- 14. I
    Status:
    Published
  4. Identification and characterization of novel CsABI1 and CsABI2 genes in cucumber genome using comprarative analysis
    Authors:
    PAWEŁKOWICZ M., KRZYWKOWSKI T., KOWALCZUK C., WÓYCICKI R., OSIPOWSKI P., PRZYBECKI Z.
    Conference:
    IV POLSKI KONGRES GENETYKI (rok: 2013, ), Wydawca: Fundacja Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
    Data:
    konferencja 10-13 września
    Status:
    Published
  5. Advantages and disadvantages in usage of bioinformatic programs in promoter region analysis
    Authors:
    Magdalena Ewa Pawełkowicz, Agnieszka Skarzyńska, Kacper Posyniak, Karolina Ziąbska, Wojciech Pląder, Zbigniew Przybecki
    Conference:
    XXXVIth IEEE-SPIE Joint Symposium on Photonics, Web Engineering, Electronics for Astronomy and High Energy Physics Experiment (rok: 2015, ), Wydawca: SPIE
    Data:
    konferencja 25-31 V 2015
    Status:
    Published
  6. Genomic identyfication and characterization of GY/gy gene in cucumber
    Authors:
    OSIPOWSKI P., WÓYCICKI R., WITKOWICZ J., PAWEŁKOWICZ M., WOJCIESZEK M., SIEDLECKA E., GUTMAN W., PRZYBECKI Z.,
    Conference:
    IV POLSKI KONGRES GENETYKI (rok: 2013, ), Wydawca: Fundacja Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
    Data:
    konferencja 10-13 września
    Status:
    Published
  7. The role of ubiquitins in cucumber (C. sativus L.) flower morphogenesis.
    Authors:
    PAWEŁKOWICZ M., KOWALCZUK C., OSIPOWSKI P., WOJCIESZEK M., KOJDER G., KOSIK K., PRZYBECKI Z.
    Conference:
    5th Central European Congress of Life Science EUROBIOTECH 2013 , Wydawca: Polish Ministry of Science and Higher Education
    Data:
    konferencja 8th-11th October
    Status:
    Published
  8. Genomic identyfication and characterization of GY/gy gene in cucumber
    Authors:
    OSIPOWSKI P., WÓYCICKI R., WITKOWICZ J., PAWEŁKOWICZ M., WOJCIESZEK M., SIEDLECKA E., GUTMAN W., PRZYBECKI Z.,
    Conference:
    IV POLSKI KONGRES GENETYKI (), Wydawca: Fundacja Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
    Data:
    konferencja 10-13 września
    Status:
    Published
  9. The discrepancies in the results of bioinformatics tools for genomic structural annotation
    Authors:
    Magdalena Pawełkowicz, Robert Nowak, Paweł Osipowski, Jacek Rymuszka, Katarzyna Świerkula, Michał Wojcieszek1, Zbigniew Przybecki
    Conference:
    XXXIV-th IEEE-SPIE Joint Symposium on Photonics, Web Engineering, Electronics for Astronomy and High Energy Physics Experiments (rok: 2014, ), Wydawca: SPIE
    Data:
    konferencja 26.05.2014 - 01.06.2014
    Status:
    Published
    DOI:
    link to the publication
  10. Genomes correction and assembling - present methods and tools
    Authors:
    Michał Wojcieszek, Magdalena Pawełkowicz, Robert Nowak, Zbigniew Przybecki
    Conference:
    XXXIV-th IEEE-SPIE Joint Symposium on Photonics, Web Engineering, Electronics for Astronomy and High Energy Physics Experiment (rok: 2014, ), Wydawca: SPIE
    Data:
    konferencja 26.05.2014 - 01.06.2014
    Status:
    Published
    DOI:
    link to the publication
  11. The differential expression of genes potentially involved in cucumber floral buds development
    Authors:
    Pawełkowicz M; Osipowski P; Przybecki Z
    Conference:
    XIII conference on Molecular biology in diagnostics of infectious diseases and biotechnology (rok: 2012, ), Wydawca: Committee on Microbiology; Committee of Veterinary Scinces Division II Biological & Agriclutural Sciences Polish Academy of Sciences
    Data:
    konferencja 24.11.2012
    Status:
    Published
  12. Identification and characterization of novel CsABI1 and CsABI2 genes in cucumber genome using comprarative analysis
    Authors:
    PAWEŁKOWICZ M., KRZYWKOWSKI T., KOWALCZUK C., WÓYCICKI R., OSIPOWSKI P., PRZYBECKI Z.
    Conference:
    IV POLSKI KONGRES GENETYKI (), Wydawca: Fundacja Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
    Data:
    konferencja 10-13 września
    Status:
    Published

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy