Opracowanie metody do przewidywania struktury przestrzennej kompleksów receptorów GPCR z agonistami i antagonistami z uwzględnieniem wpływu liganda na strukturę receptora.
2011/01/D/NZ2/05314
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
- NZ2_7: Bioinformatyka
- NZ2_8: Biologia obliczeniowa
Panel
NZ2 – Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca
Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. Mirosława Mossakowskiego PAN
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 6
Konkurs
SONATA 1 – ogłoszony 2011-03-15
- Przyznana kwota
- 336 900 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2011-12-07
- Zakończenie projektu
- 2015-12-06
- Planowany czas trwania projektu
- 48 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Latitude E6430 Standart Base.
- Serwer PowerEdge R620. Za kwotę 60 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (2)
-
Recent progress in understanding of structure, ligand interactions and the mechanism of activation of the β₂-adrenergic receptor.
- Autorzy:
- Kolinski M, Plazinska A, Jozwiak K.
- Czasopismo:
- Curr Med Chem. (rok: 2012, tom: 8, strony: 1155-1163 (9)), Wydawca: Bentham Science Publishers
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.2174/092986712799320547 – link do publikacji
-
Structure prediction of the second extracellular loop in G-protein-coupled receptors
- Autorzy:
- Sebastian Kmiecik , Michal Jamroz, Michal Kolinski
- Czasopismo:
- Biophysical Journal (rok: 2014, tom: 106(11), strony: 2408-2416), Wydawca: Cell Press, www.cell.com
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.bpj.2014.04.022. – link do publikacji
Publikacje książkowe (2)
-
Modelowanie molekularne białek błonowych
- Autorzy:
- Aleksandra ED, Koliński M, Koliński A, Kmiecik S.
- Książka:
- Na pograniczu chemii i biologii (rok: 2012, tom: XXVIII, strony: 223-237), Wydawca: Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- link do publikacji
-
Coarse-grained modeling of protein dynamics
- Autorzy:
- Kmiecik S, Wabik J, Kolinski M, Kouza M and Kolinski A.
- Książka:
- Computational Methods to Study the Structure and Dynamics of Biomolecules and Biomolecular Processes (rok: 2014, tom: 1, strony: 55-79), Wydawca: Springer Berlin Heidelberg
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- link do publikacji