Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Opracowanie metody do przewidywania struktury przestrzennej kompleksów receptorów GPCR z agonistami i antagonistami z uwzględnieniem wpływu liganda na strukturę receptora.

2011/01/D/NZ2/05314

Słowa kluczowe:

GPCR ruchome dokowanie przewidywanie struktury wiązanie ligandów modleowanie pętli projektowanie leków

Deskryptory:

  • NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • NZ2_8: Biologia obliczeniowa

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. Mirosława Mossakowskiego PAN

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Michał Koliński 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: SONATA 1 - ogłoszony 2011-03-15

Przyznana kwota: 336 900 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2011-12-07

Zakończenie projektu: 2015-12-06

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Serwer PowerEdge R620. Za kwotę 60 000 PLN
  2. Latitude E6430 Standart Base.

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (3)
  • Publikacje książkowe (2)
  1. Recent progress in understanding of structure, ligand interactions and the mechanism of activation of the β₂-adrenergic receptor. IF: 4,07
    Autorzy:
    Kolinski M, Plazinska A, Jozwiak K.
    Czasopismo:
    Curr Med Chem. (rok: 2012, tom: 8, strony: 1155-1163 (9)), Wydawca: Bentham Science Publishers
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.2174/092986712799320547 - link do publikacji
  2. Structure prediction of the second extracellular loop in G-protein-coupled receptors IF: 3,668
    Autorzy:
    Sebastian Kmiecik , Michal Jamroz, Michal Kolinski
    Czasopismo:
    Biophysical Journal (rok: 2014, tom: 106(11), strony: 2408-2416), Wydawca: Cell Press, www.cell.com
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bpj.2014.04.022. - link do publikacji
  3. A CABS coarse-grained model for de novo simulations of helical membrane proteins IF: 5,498
    Autorzy:
    Wojciech Pulawski, Michal Jamroz, Michal Kolinski, Andrzej Kolinski, Sebastian Kmiecik
    Czasopismo:
    Journal of Chemical Theory and Computation (rok: 2016, ), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Złożona
  1. Modelowanie molekularne białek błonowych
    Autorzy:
    Aleksandra ED, Koliński M, Koliński A, Kmiecik S.
    Książka:
    Na pograniczu chemii i biologii (rok: 2012, tom: XXVIII, strony: 223-237), Wydawca: Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza
    Status:
    Opublikowana
  2. Coarse-grained modeling of protein dynamics
    Autorzy:
    Kmiecik S, Wabik J, Kolinski M, Kouza M and Kolinski A.
    Książka:
    Computational Methods to Study the Structure and Dynamics of Biomolecules and Biomolecular Processes (rok: 2014, tom: 1, strony: 55-79), Wydawca: Springer Berlin Heidelberg
    Status:
    Opublikowana