Metody i narzędzia wykorzystujące adnotacje funkcjonalne w analizie grup genów w celu poprawy jakości grupowania oraz opisu
2011/01/D/ST6/07007
Słowa kluczowe
Deskryptory
- ST6_9: Obliczenia naukowe
- ST6_8: Systemy inteligentne
Panel
ST6 – Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne
Jednostka realizująca
Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki
woj. śląskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 5
Konkurs
SONATA 1 – ogłoszony 2011-03-15
- Przyznana kwota
- 362 500 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2011-12-07
- Zakończenie projektu
- 2015-04-06
- Planowany czas trwania projektu
- 40 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (9)
-
Methods of normalization the results of Gene Ontology term similarity
- Autorzy:
- Stypka Ł., Kozielski, M.
- Czasopismo:
- Studia Informatica (rok: 2014, tom: 32(2), strony: 46218), Wydawca: Wydawnictwo Politechniki Śląskiej
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- link do publikacji
-
HuntMi: an efficient and taxon-specific approach in pre-miRNA identification
- Autorzy:
- Gudyś A., Szcześniak M.W., Sikora M. and Makałowska I.
- Czasopismo:
- BMC Bioinformatics (rok: 2013, tom: 14, strony: 83), Wydawca: Jo Appleford-Cook
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1186/1471-2105-14-83 – link do publikacji
-
Censoring Weighted Separate-and- Conquer Rule Induction from Survival Data
- Autorzy:
- Wróbel Ł. Sikora M.
- Czasopismo:
- Methods of Information in Medicine (rok: 2014, tom: 53, strony: -), Wydawca: Schattauer Publishers
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3414/ME13-01-0046 – link do publikacji
-
Data- and expert-driven rule induction and filtering framework for functional interpretation and description of gene sets
- Autorzy:
- Gruca A., Sikora M.
- Czasopismo:
- Journal of Biomedical Semantics (rok: 2017, tom: 2017, strony: 0,349305555555556), Wydawca: BioMed Central
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1186/s13326-017-0129-x – link do publikacji
-
CHIRA—Convex Hull Based Iterative Algorithm of Rules Aggregation
- Autorzy:
- Sikora M., Gudyś A.
- Czasopismo:
- Fundamenta Informaticae (rok: 2013, tom: 123(2), strony: 143-170), Wydawca: IOS Press
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3233/FI-2013-805 – link do publikacji
-
Application of Binary similarity measures to analysis of genes represented in Gene ontology domain
- Autorzy:
- Michał Kozielski, Aleksandra Gruca
- Czasopismo:
- Studia Informatica (rok: 2012, tom: 33(2A), strony: 541-552), Wydawca: Wydawnictwo Politechniki Śląskiej
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- link do publikacji
-
Data-driven adaptive selection of rule quality measures for improving rule induction and filtration algorithms
- Autorzy:
- Sikora M., Wróbel Ł.
- Czasopismo:
- International Journal of General Systems (rok: 2013, tom: 42(6), strony: 594-613), Wydawca: Taylor & Francis
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1080/03081079.2013.798901 – link do publikacji
-
Application of rule induction to discover survival factors of patients after bone marrov transplantation
- Autorzy:
- Sikora M., Wróbel Ł., Mielcarek M., Kałwak K.
- Czasopismo:
- Journal of Medical Informatics & Technologies (rok: 2013, tom: 22, strony: 35-53), Wydawca: Computer System Dept. University of Sielsia
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- link do publikacji
-
Rule based functional description of genes – estimation of the multicriteria rule interestingness measure by the UTA method
- Autorzy:
- Gruca A., Sikora M.
- Czasopismo:
- Biocybernetics and Biomedical Engineering (rok: 2013, tom: 33, strony: 222-234), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.bbe.2013.09.005 – link do publikacji
Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (2)
-
Soft Approach to Identification of Cohesive Clusters in Two Gene Representations
- Autorzy:
- Kozielski M., Gruca A.
- Konferencja:
- Knowledge-Based and Intelligent Information & Engineering Systems 18th Annual Conference (rok: 2014, strony: 281–289), Wydawca: Elsevier
- Data:
- konferencja 15-17.09.2014
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- link do publikacji
-
Identification of the compound subjective rule interestingness measure for rule-based functional description of genes
- Autorzy:
- Aleksandra Gruca, Marek Sikora
- Konferencja:
- The 15th International Conference on Artificial Intelligence: Methodology, Systems, Applications (rok: 2012, strony: 125-134), Wydawca: Springer-Verlag
- Data:
- konferencja 15-15.09.2012
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- link do publikacji
Publikacje książkowe (1)
-
An Efficient Algorithm for Microarray Probes Re-annotation
- Autorzy:
- Foszner P., Gruca A., Polanski A., Marczyk M., Jaksik R., Polanska J.
- Książka:
- Transactions on Computational Collective Intelligence XIII (rok: 2014, tom: LNCS 8342, strony: 201--218), Wydawca: Springer Berlin Heidelberg
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- link do publikacji