Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Korelacja dynamiki histonu łącznikowego H1 z przestrzenną architekturą chromatyny w jądrach komórkowych.

2011/01/B/NZ3/00609

Słowa kluczowe:

histon H1 dynamika chromatyna architektura przestrzenna

Deskryptory:

  • NZ3_2: Fizjologia komórki
  • ST6_4: Grafika i przetwarzanie obrazów

Panel:

NZ3 - Biologia na poziomie komórki: biologia komórkowa, biologia rozwoju i starzenia, neurobiologia

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Jerzy Dobrucki 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: OPUS 1 - ogłoszony 2011-03-15

Przyznana kwota: 590 900 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2011-12-07

Zakończenie projektu: 2015-06-06

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Dyski do archiwizacji danych.
  2. Miernik światła. Za kwotę 11 549 PLN
  3. Program komputerowy do analizy obrazu Huygens (SVI).
  4. Program komputerowy do analizy obrazu Huygens (SVI) - II rata. Za kwotę 24 968 PLN
  5. statyw do butli ze sprezonym CO2.
  6. Dyski zewnętrzne do archiwizacji danych. Za kwotę 2 992 PLN
  7. Moniitor komputerowy. Za kwotę 6 686 PLN
  8. Monitor komputerowy.
  9. Programy komputerowe. Za kwotę 80 000 PLN
  10. Filtry optyczne. Za kwotę 30 000 PLN
  11. butla CO2.
  12. Dysk twardy.
  13. Miernik światła.
  14. Serwer plikow NAS. Za kwotę 15 000 PLN
  15. Stacja robocza. Za kwotę 85 000 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (15)
  • Publikacje książkowe (2)
  1. A heterochromatin protein 1 (HP1) dimer and a proliferating cell nuclear antigen (PCNA) protein interact in vivo and are parts of a multiprotein complex involved in DNA replication and DNA repair. IF: 5,243
    Autorzy:
    Trembecka-Lucas DO, Dobrucki JW.
    Czasopismo:
    Cell Cycle (rok: 2012, tom: 11(11), strony: 2170-5.), Wydawca: Landes Bioscience
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.4161/cc.20673 - link do publikacji
  2. Inducing local DNA damage by visible light to study chromatin repair IF: 4,274
    Autorzy:
    Solarczyk KJ, Zarębski M, Dobrucki JW.
    Czasopismo:
    DNA Repair (Amst). (rok: 2012, tom: 11(12), strony: 996-1002.), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.dnarep.2012.09.008 - link do publikacji
  3. Real-time cell viability assays using a new anthracycline derivative DRAQ7®. IF: 3,711
    Autorzy:
    Akagi J, Kordon M, Zhao H, Matuszek A, Dobrucki J, Errington R, Smith PJ, Takeda K, Darzynkiewicz Z, Wlodkowic D.
    Czasopismo:
    Cytometry A. 2013 Feb;83(2):227-34. (rok: 2013, tom: 83(2), strony: 227-34), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/cyto.a.22228 - link do publikacji
  4. UV-activated conversion of Hoechst 33258, DAPI, and Vybrant DyeCycle fluorescent dyes into blue-excited, green-emitting protonated forms IF: 3,711
    Autorzy:
    Zurek-Biesiada D, Kędracka-Krok S, Dobrucki JW.
    Czasopismo:
    Cytometry A (rok: 2013, tom: 83(5), strony: 441-51), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/cyto.a.22260 - link do publikacji
  5. Activation of new replication foci under conditions of replication stress IF: 4,565
    Autorzy:
    Rybak P, Waligórska A, Bujnowicz Ł, Hoang A, Dobrucki JW
    Czasopismo:
    Cell Cycle (rok: 2015, ), Wydawca: Taylor and Francis
    Status:
    Przyjęta do publikacji
  6. Analysis of spatial correlations between patterns of DNA damage response and DNA replication in nuclei of cells subjected to replication stress or oxidative damage IF: 3,711
    Autorzy:
    Bernas T, Berniak K, Rybak P, Zarębski M, Zhao H, Darzynkiewicz Z, Dobrucki JW.
    Czasopismo:
    Cytometry A (rok: 2013, tom: 83(10), strony: 925-32), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/cyto.a.22325 - link do publikacji
  7. Evaluation of acridine orange, LysoTracker Red, and quinacrine as fluorescent probes for long-term tracking of acidic vesicles IF: 3,066
    Autorzy:
    Pierzyńska-Mach A, Janowski PA, Dobrucki JW.
    Czasopismo:
    Cytometry Part A (rok: 2014, tom: 85(8), strony: 729-37), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/cyto.a.22495 - link do publikacji
  8. Relationship between DNA damage response, initiated by camptothecin or oxidative stress, and DNA replication, analyzed by quantitative 3D image analysis IF: 3,711
    Autorzy:
    Berniak K, Rybak P, Bernas T, Zarębski M, Biela E, Zhao H, Darzynkiewicz Z, Dobrucki JW.
    Czasopismo:
    Cytometry A (rok: 2013, tom: 83(10), strony: 913-924), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/cyto.a.22327 - link do publikacji
  9. DNA damage signaling assessed in individual cells in relation to the cell cycle phase and induction of apoptosis. IF: 3,783
    Autorzy:
    Darzynkiewicz Z, Zhao H, Halicka HD, Rybak P, Dobrucki J, Wlodkowic D.
    Czasopismo:
    Crit Rev Clin Lab Sci. (rok: 2012, tom: Sep-Dec;49(5-6), strony: 199-217), Wydawca: Informa Healthcare
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3109/10408363.2012.738808 - link do publikacji
  10. Daunomycin, an antitumor DNA intercalator, influences histone-DNA interactions IF: 3,287
    Autorzy:
    Wójcik K, Zarębski M, Cossarizza A, Dobrucki JW.
    Czasopismo:
    Cancer Biology and Therapy (rok: 2013, tom: 14, strony: 823-832), Wydawca: Landes Bioscience
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.4161/cbt.25328 - link do publikacji
  11. Single molecule localization microscopy of the distribution of chromatin using Hoechst and DAPI fluorescent probes IF: 3,148
    Autorzy:
    Szczurek AT, Prakash K, Lee K-K, Żurek-Biesiada DJ, Best G, Hagmann M, Dobrucki JW, Cremer Ch, and Birk U
    Czasopismo:
    Nucleus (rok: 2104, tom: 5(4), strony: 331-340), Wydawca: Landes Bioscience
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.4161/nucl.29564 - link do publikacji
  12. Spatial heterogeneity of dynamics of H1 linker histone IF: 2,474
    Autorzy:
    Bernas T, Brutkowski W, Zarębski M, Dobrucki J.
    Czasopismo:
    European Biophysical Journal (rok: 2014, tom: 43(6-7), strony: 287-300), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    0.1007/s00249-014-0962-0 - link do publikacji
  13. Dynamics of the HP1β-PCNA-containing complexes in DNA replication and repair
    Autorzy:
    Trembecka-Lucas DO, Szczurek AT, Dobrucki JW.
    Czasopismo:
    Nucleus (rok: 2013, tom: 4(1), strony: 74-82), Wydawca: Landes Bioscience
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.4161/nucl.23683 - link do publikacji
  14. Photosensitized Damage Inflicted on Plasma Membranes of Live Cells by An Extracellular Generator of Singlet Oxygen-A Linear Dependence of A Lethal Dose on Light Intensity. IF: 2,287
    Autorzy:
    Zarębski M, Kordon M, Dobrucki JW.
    Czasopismo:
    Photochemistry Photobiology (rok: 2014, tom: 90, strony: 709-715), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1111/php.12216 - link do publikacji
  15. UV-induced spectral shift and protonation of DNA fluorescent dye Hoechst 33258 IF: 1,667
    Autorzy:
    Żurek-Biesiada D, Waligórski P, Dobrucki JW.
    Czasopismo:
    Journal of Fluorescence (rok: 2014, tom: 24(6), strony: 1791-801), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s10895-014-1468-y - link do publikacji
  1. Fluorescence Microscopy
    Autorzy:
    Dobrucki JW
    Książka:
    Fluorescence Microscopy: From Principles to Biological Applications (rok: 2013, tom: 1, strony: 97-142), Wydawca: Wiley-Blackwell
    Status:
    Opublikowana
  2. Kinetic viability assays using DRAQ7 probe
    Autorzy:
    Wlodkowic D, Akagi J, Dobrucki J, Errington R, Smith PJ, Takeda K, Darzynkiewicz Z
    Książka:
    Curr Protoc Cytom. (rok: 2013, tom: 2013, strony: 0-0), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana