Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Analiza podatnościowa narzędziem do opracowania polaryzowalnych pól siłowych

2011/01/B/ST4/00636

Słowa kluczowe:

dynamika molekularna analiza podatnościowa rozkładu ładunku polaryzowalne pola siłowe podatności molekularne

Deskryptory:

  • ST4_15: Chemia teoretyczna i obliczeniowa

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Chemii

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Jacek Korchowiec 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: OPUS 1 - ogłoszony 2011-03-15

Przyznana kwota: 263 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2011-12-01

Zakończenie projektu: 2014-11-30

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Licencja na oprogramowanie SCIGRESS i ADMEWORKS ModelBuilder; Licencja na oprogramowanie AMBER 12; Licencja na oprogramowanie AIMAll (tworzenie modeli QSAR) ; Licencja na oprogramowanie Tremolo X (pole siłowe AMBER); Przy ostatecznym wyborze pakietów do obliczeń MD kierowaliśmy się dostępnością polaryzowalnych pól siłowych. Związane jest to z koniecznością porównania wyników naszych polaryzowalnych pól siłowych z wynikami otrzymanymi innymi metodami.. Za kwotę 55 000 PLN

Dane z raportu końcowego

  • Publikacje w czasopismach (7)
  1. Bond Detectors for Molecular Dynamics Simulations: Part I - Hydrogen Bonds
    Autorzy:
    A. Stachowicz, J. Korchowiec
    Czasopismo:
    Journal of Computational Chemistry (rok: 2013, tom: 34, strony: 2261-2269), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/jcc.23385 - link do publikacji
  2. Atomic Polarization Justified Fukui Indices and the Affinity Indicators in Aromatic Heterocycles and Nucleobases
    Autorzy:
    W. Beker, A. Stachowicz-Kuśnierz, J. Zaklika, A. Ziobro, P. Ordon, L. Komorowski
    Czasopismo:
    J. Chem. Phys. A (rok: 2014, tom: nie dotyczy, strony: nie dotyczy), Wydawca: ACS
    Status:
    Złożona
  3. Intermediate Electrostatic Field for the Accurate Calculation of Generalized Elongation Method
    Autorzy:
    K. Liu, J. Korchowiec, Y. Aoki
    Czasopismo:
    ChemPhysChem (rok: 2014, tom: nie dotyczy, strony: niedotyczy), Wydawca: Wiley-WCH
    Status:
    Złożona
  4. Nucleophilic Properties of Purine Bases: Inherent Reactivity vs. Reaction Conditions. A DFT Study.
    Autorzy:
    A. Stachowicz, J. Korchowiec
    Czasopismo:
    Structural Chemistry (rok: 2014, tom: nie dotyczy, strony: nie dotyczy), Wydawca: Springer
    Status:
    Złożona
  5. Generalized Charge Sensitivity Analysis
    Autorzy:
    A. Stachowicz, J. Korchowiec
    Czasopismo:
    Structural Chemistry (rok: 2012, tom: 23, strony: 1449-1458), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s11224-012-0054-7 - link do publikacji
  6. Charge Sensitivity Approach to Mutual Polarization of Reactants: Molecular Mechanics Perspective
    Autorzy:
    A. Stachowicz, M. Rogalski, J. Korchowiec
    Czasopismo:
    Journal of Molecular Modeling (rok: 2013, tom: 19, strony: 4163-4172), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00894-013-1757-4 - link do publikacji
  7. Intermediate electrostatic field for the elongation method
    Autorzy:
    P. Kuzniarowicz, K. Liu, Y. Aoki, F.L. Gu, A. Stachowicz, J. Korchowiec
    Czasopismo:
    Journal of Molecular Modeling (rok: 2014, tom: 20, strony: 2277-), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00894-014-2277-6 - link do publikacji