Analiza podatnościowa narzędziem do opracowania polaryzowalnych pól siłowych
2011/01/B/ST4/00636
Słowa kluczowe
Deskryptory
- ST4_15: Chemia teoretyczna i obliczeniowa
Panel
ST4 – Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna
Jednostka realizująca
Uniwersytet Jagielloński, Wydział Chemii
woj. małopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
dr hab. Jacek Grzegorz Korchowiec
Liczba wykonawców projektu: 4
Konkurs
OPUS 1 – ogłoszony 2011-03-15
- Przyznana kwota
- 263 000 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2011-12-01
- Zakończenie projektu
- 2014-11-30
- Planowany czas trwania projektu
- 36 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Licencja na oprogramowanie SCIGRESS i ADMEWORKS ModelBuilder; Licencja na oprogramowanie AMBER 12; Licencja na oprogramowanie AIMAll (tworzenie modeli QSAR) ; Licencja na oprogramowanie Tremolo X (pole siłowe AMBER); Przy ostatecznym wyborze pakietów do obliczeń MD kierowaliśmy się dostępnością polaryzowalnych pól siłowych. Związane jest to z koniecznością porównania wyników naszych polaryzowalnych pól siłowych z wynikami otrzymanymi innymi metodami.. Za kwotę 55 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (4)
-
Charge Sensitivity Approach to Mutual Polarization of Reactants: Molecular Mechanics Perspective
- Autorzy:
- A. Stachowicz, M. Rogalski, J. Korchowiec
- Czasopismo:
- Journal of Molecular Modeling (rok: 2013, tom: 19, strony: 4163-4172), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s00894-013-1757-4 – link do publikacji
-
Bond Detectors for Molecular Dynamics Simulations: Part I - Hydrogen Bonds
- Autorzy:
- A. Stachowicz, J. Korchowiec
- Czasopismo:
- Journal of Computational Chemistry (rok: 2013, tom: 34, strony: 2261-2269), Wydawca: Wiley
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1002/jcc.23385 – link do publikacji
-
Intermediate electrostatic field for the elongation method
- Autorzy:
- P. Kuzniarowicz, K. Liu, Y. Aoki, F.L. Gu, A. Stachowicz, J. Korchowiec
- Czasopismo:
- Journal of Molecular Modeling (rok: 2014, tom: 20, strony: 2277-), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s00894-014-2277-6 – link do publikacji
-
Generalized Charge Sensitivity Analysis
- Autorzy:
- A. Stachowicz, J. Korchowiec
- Czasopismo:
- Structural Chemistry (rok: 2012, tom: 23, strony: 1449-1458), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1007/s11224-012-0054-7 – link do publikacji