Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Charge Sensitivity Approach to Polarizable Force Fields

2011/01/B/ST4/00636

Keywords:

molecular dynamics charge sensitivity analysis plarizable force fields charge sensitivities

Descriptors:

  • ST4_15: Colloid chemistry

Panel:

ST4 - Chemistry: physical chemistry/chemical physics, theoretical chemistry, analytical chemistry, inorganic chemistry, organic chemistry, method development

Host institution :

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Chemii

woj. małopolskie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

dr hab. Jacek Korchowiec 

Number of co-investigators in the project: 4

Call: OPUS 1 - announced on 2011-03-15

Amount awarded: 263 000 PLN

Project start date (Y-m-d): 2011-12-01

Project end date (Y-m-d): 2014-11-30

Project duration:: 36 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Equipment purchased [PL]

  1. Licencja na oprogramowanie SCIGRESS i ADMEWORKS ModelBuilder; Licencja na oprogramowanie AMBER 12; Licencja na oprogramowanie AIMAll (tworzenie modeli QSAR) ; Licencja na oprogramowanie Tremolo X (pole siłowe AMBER); Przy ostatecznym wyborze pakietów do obliczeń MD kierowaliśmy się dostępnością polaryzowalnych pól siłowych. Związane jest to z koniecznością porównania wyników naszych polaryzowalnych pól siłowych z wynikami otrzymanymi innymi metodami. (55 000 PLN)

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (7)
  1. Bond Detectors for Molecular Dynamics Simulations: Part I - Hydrogen Bonds
    Authors:
    A. Stachowicz, J. Korchowiec
    Academic press:
    Journal of Computational Chemistry (rok: 2013, tom: 34, strony: 2261-2269), Wydawca: Wiley
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1002/jcc.23385 - link to the publication
  2. Intermediate Electrostatic Field for the Accurate Calculation of Generalized Elongation Method
    Authors:
    K. Liu, J. Korchowiec, Y. Aoki
    Academic press:
    ChemPhysChem (rok: 2014, tom: nie dotyczy, strony: niedotyczy), Wydawca: Wiley-WCH
    Status:
    Submitted
    DOI:
    nie - link to the publication
  3. Generalized Charge Sensitivity Analysis
    Authors:
    A. Stachowicz, J. Korchowiec
    Academic press:
    Structural Chemistry (rok: 2012, tom: 23, strony: 1449-1458), Wydawca: Springer
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1007/s11224-012-0054-7 - link to the publication
  4. Intermediate electrostatic field for the elongation method
    Authors:
    P. Kuzniarowicz, K. Liu, Y. Aoki, F.L. Gu, A. Stachowicz, J. Korchowiec
    Academic press:
    Journal of Molecular Modeling (rok: 2014, tom: 20, strony: 2277-), Wydawca: Springer
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1007/s00894-014-2277-6 - link to the publication
  5. Charge Sensitivity Approach to Mutual Polarization of Reactants: Molecular Mechanics Perspective
    Authors:
    A. Stachowicz, M. Rogalski, J. Korchowiec
    Academic press:
    Journal of Molecular Modeling (rok: 2013, tom: 19, strony: 4163-4172), Wydawca: Springer
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1007/s00894-013-1757-4 - link to the publication
  6. Atomic Polarization Justified Fukui Indices and the Affinity Indicators in Aromatic Heterocycles and Nucleobases
    Authors:
    W. Beker, A. Stachowicz-Kuśnierz, J. Zaklika, A. Ziobro, P. Ordon, L. Komorowski
    Academic press:
    J. Chem. Phys. A (rok: 2014, tom: nie dotyczy, strony: nie dotyczy), Wydawca: ACS
    Status:
    Submitted
    DOI:
    nie - link to the publication
  7. Nucleophilic Properties of Purine Bases: Inherent Reactivity vs. Reaction Conditions. A DFT Study.
    Authors:
    A. Stachowicz, J. Korchowiec
    Academic press:
    Structural Chemistry (rok: 2014, tom: nie dotyczy, strony: nie dotyczy), Wydawca: Springer
    Status:
    Submitted
    DOI:
    nie - link to the publication

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy