Projects funded by the NCN


Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Charge Sensitivity Approach to Polarizable Force Fields

2011/01/B/ST4/00636

Keywords:

molecular dynamics charge sensitivity analysis plarizable force fields charge sensitivities

Descriptors:

  • ST4_15:

Panel:

ST4 - Chemistry: physical chemistry/chemical physics, theoretical chemistry, analytical chemistry, inorganic chemistry, organic chemistry, method development

Host institution :

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Chemii

woj. małopolskie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

dr hab. Jacek Grzegorz Korchowiec 

Number of co-investigators in the project: 4

Call: OPUS 1 - announced on 2011-03-15

Amount awarded: 263 000 PLN

Project start date (Y-m-d): 2011-12-01

Project end date (Y-m-d): 2014-11-30

Project duration:: 36 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Equipment purchased [PL]

  1. Licencja na oprogramowanie SCIGRESS i ADMEWORKS ModelBuilder; Licencja na oprogramowanie AMBER 12; Licencja na oprogramowanie AIMAll (tworzenie modeli QSAR) ; Licencja na oprogramowanie Tremolo X (pole siłowe AMBER); Przy ostatecznym wyborze pakietów do obliczeń MD kierowaliśmy się dostępnością polaryzowalnych pól siłowych. Związane jest to z koniecznością porównania wyników naszych polaryzowalnych pól siłowych z wynikami otrzymanymi innymi metodami. (55 000 PLN)

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (4)
  1. Charge Sensitivity Approach to Mutual Polarization of Reactants: Molecular Mechanics Perspective
    Authors:
    A. Stachowicz, M. Rogalski, J. Korchowiec
    Academic press:
    Journal of Molecular Modeling (rok: 2013, tom: 19, strony: 4163-4172), Wydawca: Springer
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1007/s00894-013-1757-4 - link to the publication
  2. Intermediate electrostatic field for the elongation method
    Authors:
    P. Kuzniarowicz, K. Liu, Y. Aoki, F.L. Gu, A. Stachowicz, J. Korchowiec
    Academic press:
    Journal of Molecular Modeling (rok: 2014, tom: 20, strony: 2277-), Wydawca: Springer
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1007/s00894-014-2277-6 - link to the publication
  3. Bond Detectors for Molecular Dynamics Simulations: Part I - Hydrogen Bonds
    Authors:
    A. Stachowicz, J. Korchowiec
    Academic press:
    Journal of Computational Chemistry (rok: 2013, tom: 34, strony: 2261-2269), Wydawca: Wiley
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1002/jcc.23385 - link to the publication
  4. Generalized Charge Sensitivity Analysis
    Authors:
    A. Stachowicz, J. Korchowiec
    Academic press:
    Structural Chemistry (rok: 2012, tom: 23, strony: 1449-1458), Wydawca: Springer
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1007/s11224-012-0054-7 - link to the publication