Projekty finansowane przez NCN
Nowy model probabilistyczny do identyfikacji typów komórek w danych transkryptomicznych otrzymanych w wyniku sekwencjonowania przestrzennego oraz z pojedynczych komórek
2021/41/N/ST6/03619
Słowa kluczowe:
probabilistyczne modele grafowe próbkowanie Monte Carlo łańcuchami Markowa transkryptomika
Deskryptory:
- ST6_11: Uczenie maszynowe, statystyczne przetwarzanie danych i zastosowania w przetwarzaniu sygnałów (np. mowy, obrazów, filmów)
- ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne
- ST1_17: Matematyka stosowana
Panel:
ST6 - Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne
Jednostka realizująca:
Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki
woj.
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 2
Konkurs: PRELUDIUM 20 - ogłoszony 2021-03-15
Przyznana kwota: 67 344 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2022-01-12
Zakończenie projektu: 2024-01-11
Planowany czas trwania projektu: 24 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (2)
- Tumoroscope: a probabilistic model for mapping cancer clones in tumor tissuesAutorzy:Shadi Darvish Shafighi, Agnieszka Geras, Barbara Jurzysta, Alireza Sahaf Naeini, Igor Filipiuk, Łukasz Rączkowski, Hosein Toosi, Łukasz Koperski, Kim Thrane, Camilla Engblom, Jeff Mold, Xinsong Chen, Johan Hartman, Dominika Nowis, Alessandra Carbone, Jens Lagergren, Ewa SzczurekCzasopismo:Nature Communications (rok: 2023, tom: -, strony: -), Wydawca: Nature Publishing GroupStatus:Złożona
- Integrative Spatial and Genomic Analysis of Tumor Heterogeneity with TumoroscopeAutorzy:Shadi Shafighi, Agnieszka Geras, Barbara Jurzysta, Alireza Sahaf Naeini, Igor Filipiuk, Alicja Rączkowska, Hosein Toosi, Łukasz Koperski, Kim Thrane, Camilla Engblom, Jeff E Mold, Xinsong Chen, Johan Hartman, Dominika Nowis, Alessandra Carbone, Jens Lagergren, Ewa SzczurekCzasopismo:Nature Communications (rok: 2024, tom: -, strony: -), Wydawca: Nature Publishing GroupStatus:Przyjęta do publikacji