Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

[PHAICELL] Koherentna mikroskopia z ilościowym kontrastem fazowym: powrót do podstaw i zaproponowanie nowej techniki numerycznej rekonstrukcji z zastosowaniem do zaawansowanego obrazowania biomedycznego bez znaczników

2020/37/B/ST7/03629

Słowa kluczowe:

optyczne obrazowanie mikroskopia z ilościowym kontrastem fazowym mikroskopia bez znaczników obrazowanie obliczeniowe numeryczna rekonstrukcja obrazowanie biomedyczne

Deskryptory:

  • ST7_005: Układy z elementami elektronicznymi, optoelektronicznymi i fotonicznymi
  • ST7_011: Zastosowania elementów i systemów elektronicznych, optoelektronicznych i fotonicznych (np. w inżynierii biomedycznej)

Panel:

ST7 - Inżynieria systemów i komunikacji: elektronika, komunikacja, optoelektronika

Jednostka realizująca:

Politechnika Warszawska, Wydział Mechatroniki

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Maciej Trusiak 

Liczba wykonawców projektu: 10

Konkurs: OPUS 19 - ogłoszony 2020-03-16

Przyznana kwota: 1 999 200 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2021-01-19

Zakończenie projektu: 2025-01-18

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt zakończony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (16)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (8)
  1. DeepVID: deep-learning accelerated variational image decomposition model tailored to fringe pattern filtration
    Autorzy:
    M. Cywińska, K. Szumigaj, M. Kołodziej, K. Patorski, V. Micó, S. Feng, C. Zuo, M. Trusiak
    Czasopismo:
    Journal of Optics (rok: 2023, tom: 25, strony: 45702), Wydawca: IOP Publishing Ltd
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1088/2040-8986/acb3df - link do publikacji
  2. High space–time bandwidth product imaging in low coherence quantitative phase microscopy
    Autorzy:
    Azeem Ahmad, Paweł Gocłowski, Vishesh Dubey, Maciej Trusiak & Balpreet S. Ahluwalia
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2024, tom: 14, strony: 9191), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-024-59874-y - link do publikacji
  3. High-throughput transport-of-intensity quantitative phase imaging with aberration correction
    Autorzy:
    Linpeng Lu , Shun Zhou, Yefeng Shu, Yanbo Jin, Jiasong Sun, Ran Ye, Maciej Trusiak, Peng Gao , Chao Zuo,
    Czasopismo:
    Light: Advanced Manufacturing (rok: 2024, tom: 5(4), strony: 532-541), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.37188/lam.2024.045 - link do publikacji
  4. Deep learning assisted variational Hilbert quantitative phase imaging
    Autorzy:
    Zhuoshi Li, Jiasong Sun, Yao Fan, Yanbo Jin, Qian Shen, Maciej Trusiak, Maria Cywińska, Peng Gao, Qian Chen3 Chao Zuo
    Czasopismo:
    Opto-electronic Science (rok: 2023, tom: 2, strony: 220023), Wydawca: OE Journals Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.29026/oes.2023.220023 - link do publikacji
  5. DeepQuadrature: universal convolutional neural network enlarging space-bandwidth product in single-shot fringe pattern optical metrology
    Autorzy:
    Maria Cywińska, Michał Józwik, Krzysztof Patorski, Azeem Ahmad, Balpreet Ahluwalia, Björn Kemper, and Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Journal of Physics: Photonics (rok: 2025, tom: 7(2), strony: 25024), Wydawca: IOP
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1088/2515-7647/adc219 - link do publikacji
  6. Roadmap on computational methods in optical imaging and holography [invited]
    Autorzy:
    Joseph Rosen, Simon Alford, Blake Allan, Vijayakumar Anand, Shlomi Arnon, Francis Gracy Arockiaraj, Jonathan Art, Bijie Bai, Ganesh M. Balasubramaniam, Tobias Birnbaum, Nandan S. Bisht, David Blinder, Liangcai Cao, Qian Chen, Ziyang Chen, Vishesh Dubey, Karen Egiazarian, Mert Ercan, Andrew Forbes, G. Gopakumar, Yunhui Gao, Sylvain Gigan, Paweł Gocłowski, Shivasubramanian Gopinath, Alon Greenbaum, Ryoichi Horisaki, Daniel Ierodiaconou, Saulius Juodkazis, Tanushree Karmakar, Vladimir Katkovnik, Svetlana N. Khonina, Peter Kner, Vladislav Kravets, Ravi Kumar, Yingming Lai, Chen Li, Jiaji Li, Shaoheng Li, Yuzhu Li, Jinyang Liang, Gokul Manavalan, Aditya Chandra Mandal, Manisha Manisha, Christopher Mann, Marcin J. Marzejon, Chané Moodley, Junko Morikawa, Inbarasan Muniraj, Donatas Narbutis, Soon Hock Ng, Fazilah Nothlawala, Jeonghun Oh, Aydogan Ozcan, YongKeun Park, Alexey P. Porfirev, Mariana Potcoava, Shashi Prabhakar, Jixiong Pu, Mani Ratnam Rai, Mikołaj Rogalski, Meguya Ryu, Sakshi Choudhary, Gangi Reddy Salla, Peter Schelkens, Sarp Feykun Şener, Igor Shevkunov, Tomoyoshi Shimobaba, Rakesh K. Singh, Ravindra P. Singh, Adrian Stern, Jiasong Sun, Shun Zhou, Chao Zuo, Zack Zurawski, Tatsuki Tahara, Vipin Tiwari, Maciej Trusiak, R. V. Vinu, Sergey G. Volotovskiy, Hasan Yılmaz, Hilton Barbosa De Aguiar, Balpreet S. Ahluwalia & Azeem Ahmad
    Czasopismo:
    Applied Physics B (rok: 2024, tom: 130, strony: 166), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00340-024-08280-3 - link do publikacji
  7. Deep learning assisted variational Hilbert quantitative phase imaging
    Autorzy:
    Zhuoshi Li, Jiasong Sun, Yao Fan, Yanbo Jin, Qian Shen, Maciej Trusiak, Maria Cywińska, Peng Gao, Qian Chen3 Chao Zuo
    Czasopismo:
    Opto-electronic Science , Wydawca: OE Journals Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.29026/oes.2023.220023 - link do publikacji
  8. Nanometer Resolution Imaging and Tracking of Single Fluorophores by Sequential Structured Illumination
    Autorzy:
    Piotr Zdańkowski, Lucía F. Lopez, Guillermo P. Acuna, and Fernando D. Stefani
    Czasopismo:
    ACS Photonics (rok: 2022, tom: 9(12), strony: 3777–3785), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acsphotonics.2c01391 - link do publikacji
  9. Single-shot fringe pattern phase retrieval using improved period-guided bidimensional empirical mode decomposition and Hilbert transform
    Autorzy:
    Paweł Gocłowski, Maria Cywińska, Azeem Ahmad, Balpreet Ahluwalia, Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2021, tom: 29(20), strony: 31632-31649), Wydawca: Optics Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.435001 - link do publikacji
  10. Tailoring 2D fast iterative filtering algorithm for low-contrast optical fringe pattern preprocessing
    Autorzy:
    Mikolaj Rogalski, Mateusz Pielach, Antonio Cicone, Piotr Zdankowski, Luiza Stanaszek, Katarzyna Drela, Krzysztof Patorski, Barbara Lukomska, Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Optics and Lasers in Engineering (rok: 2022, tom: 155, strony: 107069), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.optlaseng.2022.107069 - link do publikacji
  11. Polarization gratings aided common-path Hilbert holotomography for high-throughput lipid droplets content assay
    Autorzy:
    Piotr Zdańkowski, Julianna Winnik, Mikołaj Rogalski, Marcin J. Marzejon, Emilia Wdowiak, Wioleta Dudka, Michał Józwik, Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Laser and Photonics Reviews (rok: 2025, tom: 2401474, strony: 46032), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/lpor.202401474 - link do publikacji
  12. Numerical analysis of the effect of reduced temporal coherence in quantitative phase microscopy and tomography
    Autorzy:
    Wojciech Lipke, Julianna Winnik, and Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2022, tom: 30(12), strony: 21241-21257), Wydawca: OPTICA Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.458167 - link do publikacji
  13. Fringe analysis: single-shot or two-frames? Quantitative phase imaging answers
    Autorzy:
    Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2021, tom: 29(12), strony: 18192-18211), Wydawca: Optica Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.423336 - link do publikacji
  14. Common-path intrinsically achromatic optical diffraction tomography
    Autorzy:
    Piotr Zdańkowski, Julianna Winnik, Krzysztof Patorski, Paweł Gocłowski, Michał Ziemczonok, Michał Józwik, Małgorzata Kujawińska, Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Biomedical Optics Express (rok: 2021, tom: 12(7), strony: 4219-4234), Wydawca: Optica Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/BOE.428828 - link do publikacji
  15. Hilbert phase microscopy based on pseudo thermal illumination in the Linnik configuration
    Autorzy:
    Mikołaj Rogalski, Maria Cywińska, Azeem Ahmad, Krzysztof Patorski, Vicente Micó, Balpreet S. Ahluwalia, and Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Optics Letters (rok: 2022, tom: 47(22), strony: 5793-5796), Wydawca: OPTICA Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OL.471858 - link do publikacji
  16. DeepOrientation: convolutional neural network for fringe pattern orientation map estimation
    Autorzy:
    Maria Cywińska, Mikołaj Rogalski, Filip Brzeski, Krzysztof Patorski, and Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2022, tom: 30(23), strony: 42283-42299), Wydawca: OPTICA Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.465094 - link do publikacji
  1. Gradient based common-path optical diffraction tomography
    Autorzy:
    Piotr Zdańkowski, Julianna Winnik, and Maciej Trusiak
    Konferencja:
    Optica Imaging Congress 2024 (3D, AOMS, COSI, ISA, pcAOP) (rok: 2024, tom: COSI, strony: paper CW1B.2), Wydawca: Optica Publishing Group
    Data:
    konferencja 15-19.07.2024
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/COSI.2024.CW1B.2 - link do publikacji
  2. Phase from defocus: transport of intensity or in-line holography?
    Autorzy:
    Mikołaj Rogalski, Piotr Arcab, Emilia Wdowiak, Michał Józwik, Maciej Trusiak
    Konferencja:
    SPIE Proceedings Volume 12852 (rok: 2024, tom: Quantitative Phase Imaging X, strony: 128520L), Wydawca: SPIE
    Data:
    konferencja 27.01-01.02.2024
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1117/12.3008453 - link do publikacji
  3. Fast locally adaptive method for optical fringe pattern filtering
    Autorzy:
    Mikołaj Rogalski, Jędrzej Szpygiel, Antonio Cicone, Maciej Trusiak
    Konferencja:
    Proceedings Volume 12223, Interferometry XXI, SPIE Optical Engineering + Applications, 2022 (rok: 2022, tom: SPIE Optical Engineering + Applications, strony: 1222309), Wydawca: SPIE
    Data:
    konferencja 22.08.2022
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1117/12.2636210 - link do publikacji
  4. Bedrosian theorem problem in quantitative phase imaging
    Autorzy:
    Piotr Zdańkowski, Maksymilian Chlipała, Mikołaj Rogalski, and Maciej Trusiak
    Konferencja:
    In proceedings Optica Digital Holography and Three-Dimensional Imaging 2024 (DH) ISBN: 978-1-957171-38-8 (rok: 2024, tom: Optica Digital Holography and Three-Dimensional Imaging 2024 (DH), strony: paper M3A.2), Wydawca: Optica Publishing Group
    Data:
    konferencja 3-6.06.2024
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/DH.2024.M3A.2 - link do publikacji
  5. Common-path grating-based interferometers with altered temporal and spatial coherence of illumination for quantitative phase microscopy and tomography
    Autorzy:
    M. Trusiak, K. Patorski, P. Zdańkowski, J. Winnik, W. Lipke
    Konferencja:
    Proceedings Volume 12223, Interferometry XXI, SPIE Optical Engineering + Applications, 2022, San Diego, California, United States (rok: 2022, tom: SPIE Optical Engineering + Applications, strony: 122230G), Wydawca: SPIE
    Data:
    konferencja 22.08.2022
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1117/12.2636220 - link do publikacji
  6. Deep learning aided Variational Hilbert Quantitative Phase Imaging
    Autorzy:
    Maria Cywińska, Krzysztof Patorski, and Maciej Trusiak
    Konferencja:
    Optica Imaging Congress (3D, COSI, DH, FLatOptics, IS, pcAOP) (rok: 2023, tom: Optica Imaging Congress, strony: HTu3C.3), Wydawca: OPTICA Publishing Group
    Data:
    konferencja 14-17.08.2023
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/DH.2023.HTu3C.3 - link do publikacji
  7. Quantitative comparison of the light sources in grating-based common-path quantitative phase microscopy
    Autorzy:
    P. Zdankowski, M. Trusiak
    Konferencja:
    Proceedings Volume 12574, Holography: Advances and Modern Trends VIII (rok: 2023, tom: SPIE Optics + Optoelectronics, 2023, Prague, Czech Republic, strony: 125740R), Wydawca: SPIE
    Data:
    konferencja 24-28.04.2023
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1117/12.2665811 - link do publikacji
  8. Grating-based common-path quantitative phase microscopy in low photon budget regime
    Autorzy:
    M. Trusiak, P. Zdańkowski, M. Rogalski, K. Patorski
    Konferencja:
    Proceedings Volume 12574, Holography: Advances and Modern Trends VIII (rok: 2023, tom: SPIE Optics + Optoelectronics, 2023, Prague, Czech Republic, strony: 125740Y), Wydawca: SPIE
    Data:
    konferencja 24-28.04.2023
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1117/12.2665601 - link do publikacji