Projekty finansowane przez NCN
Przewidywanie zmian mikrobiomu w czasie i pod wpływem perturbacji: zastosowania uczenia maszynowego do badań mikrobiomu i strategii terapeutycznych
2019/35/D/NZ2/04353
Słowa kluczowe:
mikrobiom metagenomika uczenie maszynowe sieci neuronowe bioinformatyka autoenkodery modele statystyczne
Deskryptory:
- NZ2_7: Bioinformatyka
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Uniwersytet Jagielloński, Małopolskie Centrum Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego
woj.
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 5
Konkurs: SONATA 15 - ogłoszony 2019-09-16
Przyznana kwota: 1 154 740 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2020-07-06
Zakończenie projektu: 2024-07-05
Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt zakończony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (3)
- Deep embeddings to comprehend and visualize microbiome protein spaceAutorzy:Krzysztof Odrzywolek, Zuzanna Karwowska, Jan Majta, Aleksander Byrski, Kaja Milanowska-Zabel, Tomasz KosciolekCzasopismo:Scientific Reports (rok: 2022, tom: 12, strony: 10332), Wydawca: Springer NatureStatus:OpublikowanaDoi:10.1038/s41598-022-14055-7 - link do publikacji
- Determinants of the microbiome spatial variability in chronic rhinosinusitisAutorzy:Joanna Szaleniec, Valentyn Bezshapkin, Agnieszka Krawczyk, Katarzyna Kopera, Barbara Zapała, Tomasz Gosiewski, Tomasz KosciolekCzasopismo:Rhinology (rok: 2024, tom: 62, strony: 119-126), Wydawca: European Rhinologic SocietyStatus:OpublikowanaDoi:10.4193/Rhin22.423 - link do publikacji
- Deep embeddings to comprehend and visualize microbiome protein spaceAutorzy:Krzysztof Odrzywolek, Zuzanna Karwowska, Jan Majta, Aleksander Byrski, Kaja Milanowska-Zabel, Tomasz KosciolekCzasopismo:Scientific Reports (rok: 2022, tom: 12, strony: 10332), Wydawca: Springer NatureStatus:OpublikowanaDoi:10.1038/s41598-022-14055-7 - link do publikacji