Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Modelowanie i ewolucja sekwencji kierujących do organelli pochodzenia endosymbiotycznego.

2018/31/N/NZ2/01338

Słowa kluczowe:

presekwencje endosymbioza uczenie maszynowe plastydy sygnały kierujące peptydy antydrobnoustrojowe

Deskryptory:

  • NZ2_3: Proteomika
  • NZ2_7: Bioinformatyka

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Biotechnologii

woj. dolnośląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

Katarzyna Sidorczuk 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: PRELUDIUM 16 - ogłoszony 2018-09-14

Przyznana kwota: 198 600 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2019-07-16

Zakończenie projektu: 2023-07-15

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Przenośny komputer osobisty. Za kwotę 9 000 PLN
  2. Monitor komputerowy. Za kwotę 2 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (6)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Characterization of signal and transit peptides based on motif composition and taxon-specific patterns
    Autorzy:
    Sidorczuk, Katarzyna; Mackiewicz, Paweł; Pietluch, Filip; Gagat, Przemysław
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2023, tom: 13, strony: 15751), Wydawca: Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-023-42987-1 - link do publikacji
  2. Prediction of protein subplastid localization and origin with PlastoGram
    Autorzy:
    Sidorczuk, Katarzyna; Gagat, Przemysław; Kała, Jakub; Nielsen, Henrik; Pietluch, Filip; Mackiewicz, Paweł; Burdukiewicz, Michał
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2023, tom: 13, strony: 8365), Wydawca: Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-023-35296-0 - link do publikacji
  3. The dynamic landscape of peptide activity prediction
    Autorzy:
    Bárcenas, Oriol; Pintado-Grima, Carlos; Sidorczuk, Katarzyna; Teufel, Felix; Nielsen, Henrik; Ventura, Salvador; Burdukiewicz, Michał
    Czasopismo:
    Computational and Structural Biotechnology Journal (rok: 2022, tom: 20, strony: 6526-6533), Wydawca: ELSEVIER
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.csbj.2022.11.043 - link do publikacji
  4. Proteomic Screening for Prediction and Design of Antimicrobial Peptides with AmpGram
    Autorzy:
    Burdukiewicz, Michał; Sidorczuk, Katarzyna; Rafacz, Dominik; Pietluch, Filip; Chilimoniuk, Jarosław; Rödiger, Stefan; Gagat, Przemysław.
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2020, tom: 21(12), strony: 4310), Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms21124310 - link do publikacji
  5. Benchmarks in antimicrobial peptide prediction are biased due to the selection of negative data
    Autorzy:
    Sidorczuk, Katarzyna; Gagat, Przemysław; Pietluch, Filip; Kała, Jakub; Rafacz, Dominik; Bąkała, Laura; Słowik, Jadwiga; Kolenda, Rafał; Rödiger, Stefan; Fingerhut, Legana C H W; Cooke, Ira R; Mackiewicz, Paweł; Burdukiewicz, Michał
    Czasopismo:
    Briefings in Bioinformatics (rok: 2022, tom: 23, strony: bbac343), Wydawca: Oxford Academic
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bib/bbac343 - link do publikacji
  6. CancerGram: An Effective Classifier for Differentiating Anticancer from Antimicrobial Peptides
    Autorzy:
    Burdukiewicz, Michał; Sidorczuk, Katarzyna; Rafacz, Dominik; Pietluch, Filip; Bąkała, Mateusz; Słowik, Jadwiga; Gagat, Przemysław
    Czasopismo:
    Pharmaceutics (rok: 2020, tom: 12(11), strony: 1045), Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/pharmaceutics12111045 - link do publikacji
  1. The Photosynthetic Adventure of Paulinella Spp.
    Autorzy:
    Gagat, Przemysław; Sidorczuk, Katarzyna; Pietluch, Filip; Mackiewicz, Paweł
    Książka:
    Symbiosis: Cellular, Molecular, Medical and Evolutionary Aspects (rok: 2020, tom: 69, strony: 353-386), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy