Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Synteza i charakteryzacja nowych sond molekularnych do monitorowania aktywności enzymów związanych z dekapingiem RNA w żywych komórkach

2018/31/B/ST5/03821

Słowa kluczowe:

dekaping RNA degradacja sondy fluorescencyjne synteza nukleotydów analogi nukleotydów mRNA cap

Deskryptory:

  • ST5_16: Chemia biologiczna
  • ST5_23: Chemia organiczna
  • NZ1_3: Biofizyka

Panel:

ST5 - Synteza i materiały: otrzymywanie materiałów, związki struktury z właściwościami, nowoczesne materiały o założonych właściwościach, architektura (makro)molekularna, chemia organiczna, chemia nieorganiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Wydział Fizyki

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Joanna Kowalska 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: OPUS 16 - ogłoszony 2018-09-14

Przyznana kwota: 1 654 400 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2019-07-26

Zakończenie projektu: 2024-07-25

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt w realizacji

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (10)
  1. Cellular delivery of dinucleotides by conjugation with small molecules: targeting translation initiation for anticancer applications
    Autorzy:
    9.Kleczewska N., Sikorski P.J., Warmińska Z., Markiewicz Ł., Kasprzyk R., Baran N., Kwapiszewska K., Karpińska A., Michalski J., Hołyst R., Kowalska J., Jemielity J.
    Czasopismo:
    Chemical Science (rok: 2021, tom: 12, strony: 10242-10251), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/D1SC02143E - link do publikacji
  2. Ethylenediamine derivatives efficiently react with oxidized RNA 3′ ends providing access to mono and dually labelled RNA probes for enzymatic assays and in vivo translation
    Autorzy:
    Mamot A., Sikorski P.J., Siekierska A., de Witte P., Kowalska J., Jemielity J.
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2021, tom: 50, strony: Page e3), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkab867 - link do publikacji
  3. Fluorescence-Based Activity Screening Assay Reveals Small Molecule Inhibitors of Vaccinia Virus mRNA Decapping Enzyme D9
    Autorzy:
    Marcelina Bednarczyk, Jessica K. Peters, Renata Kasprzyk, Jagoda Starek, Marcin Warminski, Tomasz Spiewla, Jeffrey S. Mugridge, John D. Gross, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    ACS CHEMICAL BIOLOGY (rok: 2022, tom: 17, strony: 1460−1471), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acschembio.2c00049 - link do publikacji
  4. Substrate-Based Design of Cytosolic Nucleotidase IIIB Inhibitors and Structural Insights into Inhibition Mechanism
    Autorzy:
    Dorota Kubacka, Mateusz Kozarski, Marek R. Baranowski, Radoslaw Wojcik , Joanna Panecka-Hofman, Dominika Strzelecka , Jerome Basquin , Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    Pharmaceuticals (rok: 2022, tom: 15(5), strony: 554), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ph15050554 - link do publikacji
  5. Trinucleotide mRNA Cap Analogue N6-Benzylated at the Site of Posttranscriptional m6Am Mark Facilitates mRNA Purification and Confers Superior Translational Properties In Vitro and In Vivo
    Autorzy:
    Marcin Warminski, Edyta Trepkowska, Miroslaw Smietanski, Pawel J. Sikorski, Marek R. Baranowski, Marcelina Bednarczyk, Hanna Kedzierska, Bartosz Majewski, Adam Mamot, Diana Papiernik, Agnieszka Popielec, Remigiusz A. Serwa, Brittany A. Shimanski, Piotr Sklepkiewicz, Marta Sklucka, Olga Sokolowska, Tomasz Spiewla, Diana Toczydlowska-Socha, Zofia Warminska, Karol Wolosewicz, Joanna Zuberek, Jeffrey S. Mugridge, Dominika Nowis, Jakub Golab, Jacek Jemielity, and Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    Journal of the American Chemical Society (rok: 2024, tom: brak, strony: brak), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/jacs.3c12629 - link do publikacji
  6. Chemically Modified Poly(A) Analogs Targeting PABP: Structure Activity Relationship and Translation Inhibitory Properties
    Autorzy:
    Olga Perzanowska, Miroslaw Smietanski, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    Chemistry—A European Journal (rok: 2022, tom: 28, strony: e202201115), Wydawca: Wiley-VCH GmbH
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/chem.202201115 - link do publikacji
  7. Towards superior mRNA caps accessible by click chemistry: synthesis and translational properties of triazole-bearing oligonucleotide cap analogs
    Autorzy:
    Mateusz Kozarski, Karolina Drazkowska, Marcelina Bednarczyk, MarcinWarminski, JacekJemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2023, tom: 13, strony: 12809–12824), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/d3ra00026e - link do publikacji
  8. 5′-fluoro(di)phosphate-labeled oligonucleotides are versatile molecular probes for studying nucleic acid secondary structure and interactions by 19F NMR
    Autorzy:
    Marek R. Baranowski, Marcin Warmiński, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2020, tom: 48, strony: 8209–8224), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkaa470 - link do publikacji
  9. Biomolecular condensates amplify mRNA decapping by biasing enzyme conformation
    Autorzy:
    Tibble R.W., Depaix A., Kowalska J., Jemielity J., J.D. Gross
    Czasopismo:
    Nature Chemical Biology (rok: 2021, tom: 17, strony: 615-623), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41589-021-00774-x - link do publikacji
  10. Chemical Modifications of mRNA Ends for Therapeutic Applications
    Autorzy:
    Marcin Warminski, Adam Mamot, Anaïs Depaix, Joanna Kowalska and Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Accounts of Chemical Research (rok: 2023, tom: 56, strony: 2814-2826), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.accounts.3c00442 - link do publikacji