Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Synteza i charakteryzacja nowych sond molekularnych do monitorowania aktywności enzymów związanych z dekapingiem RNA w żywych komórkach

2018/31/B/ST5/03821

Słowa kluczowe:

dekaping RNA degradacja sondy fluorescencyjne synteza nukleotydów analogi nukleotydów mRNA cap

Deskryptory:

  • ST5_16: Chemia biologiczna
  • ST5_23: Chemia organiczna
  • NZ1_3: Biofizyka

Panel:

ST5 - Synteza i materiały: otrzymywanie materiałów, związki struktury z właściwościami, nowoczesne materiały o założonych właściwościach, architektura (makro)molekularna, chemia organiczna, chemia nieorganiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Wydział Fizyki

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Joanna Kowalska 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: OPUS 16 - ogłoszony 2018-09-14

Przyznana kwota: 1 654 400 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2019-07-26

Zakończenie projektu: 2024-07-25

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt w realizacji

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (7)
  1. Biomolecular condensates amplify mRNA decapping by biasing enzyme conformation
    Autorzy:
    Tibble R.W., Depaix A., Kowalska J., Jemielity J., J.D. Gross
    Czasopismo:
    Nature Chemical Biology (rok: 2021, tom: 17, strony: 615-623), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41589-021-00774-x - link do publikacji
  2. 5′-fluoro(di)phosphate-labeled oligonucleotides are versatile molecular probes for studying nucleic acid secondary structure and interactions by 19F NMR
    Autorzy:
    Marek R. Baranowski, Marcin Warmiński, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2020, tom: 48, strony: 8209–8224), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkaa470 - link do publikacji
  3. Ethylenediamine derivatives efficiently react with oxidized RNA 3′ ends providing access to mono and dually labelled RNA probes for enzymatic assays and in vivo translation
    Autorzy:
    Mamot A., Sikorski P.J., Siekierska A., de Witte P., Kowalska J., Jemielity J.
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2021, tom: 50, strony: Page e3), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkab867 - link do publikacji
  4. Substrate-Based Design of Cytosolic Nucleotidase IIIB Inhibitors and Structural Insights into Inhibition Mechanism
    Autorzy:
    Dorota Kubacka, Mateusz Kozarski, Marek R. Baranowski, Radoslaw Wojcik , Joanna Panecka-Hofman, Dominika Strzelecka , Jerome Basquin , Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    Pharmaceuticals (rok: 2022, tom: 15(5), strony: 554), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ph15050554 - link do publikacji
  5. Cellular delivery of dinucleotides by conjugation with small molecules: targeting translation initiation for anticancer applications
    Autorzy:
    9.Kleczewska N., Sikorski P.J., Warmińska Z., Markiewicz Ł., Kasprzyk R., Baran N., Kwapiszewska K., Karpińska A., Michalski J., Hołyst R., Kowalska J., Jemielity J.
    Czasopismo:
    Chemical Science (rok: 2021, tom: 12, strony: 10242-10251), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/D1SC02143E - link do publikacji
  6. Chemically Modified Poly(A) Analogs Targeting PABP: Structure Activity Relationship and Translation Inhibitory Properties
    Autorzy:
    Olga Perzanowska, Miroslaw Smietanski, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    Chemistry—A European Journal (rok: 2022, tom: 28, strony: e202201115), Wydawca: Wiley-VCH GmbH
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/chem.202201115 - link do publikacji
  7. Fluorescence-Based Activity Screening Assay Reveals Small Molecule Inhibitors of Vaccinia Virus mRNA Decapping Enzyme D9
    Autorzy:
    Marcelina Bednarczyk, Jessica K. Peters, Renata Kasprzyk, Jagoda Starek, Marcin Warminski, Tomasz Spiewla, Jeffrey S. Mugridge, John D. Gross, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    ACS CHEMICAL BIOLOGY (rok: 2022, tom: 17, strony: 1460−1471), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acschembio.2c00049 - link do publikacji