Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Molekularne mechanizmy komunikacji allosterycznej w syntazie tymidylanowej

2017/27/N/NZ1/00716

Słowa kluczowe:

dynamika molekularna efekty allosteryczne syntaza tymidylanowa

Deskryptory:

  • NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • NZ1_2: Biochemia

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Jan Ludwiczak 

Liczba wykonawców projektu: 3

Konkurs: PRELUDIUM 14 - ogłoszony 2017-09-15

Przyznana kwota: 106 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2018-08-27

Zakończenie projektu: 2022-02-26

Planowany czas trwania projektu: 42 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Komputer przenośny.
  2. Jednostka obliczeniowa (2 szt.). Za kwotę 23 000 PLN
  3. Komputer stacjonarny z monitorem.
  4. Program Amber. Za kwotę 1 800 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (2)
  1. localpdb - a Python package to manage protein structures and their annotations
    Autorzy:
    Jan Ludwiczak, Aleksander Wiński, Stanisław Dunin-Horkawicz
    Czasopismo:
    Bioinformatics (rok: 2022, tom: -, strony: -), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bioinformatics/btac121 - link do publikacji
  2. Rossmann-toolbox: a deep learning-based protocol for the prediction and design of cofactor specificity in Rossmann fold proteins
    Autorzy:
    Kamil Kamiński, Jan Ludwiczak, Maciej Jasiński, Adriana Bukala, Rafal Madaj, Krzysztof Szczepaniak, Stanisław Dunin-Horkawicz
    Czasopismo:
    Briefings in Bioinformatics (rok: 2022, tom: 23, strony: 45302), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bib/bbab371 - link do publikacji