Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Kompleksowa plastydowa baza danych z zestawem narzędzi do analiz filogenetycznych i przewidywania sekwencji sygnałowych

2017/26/D/NZ8/00444

Słowa kluczowe:

chromalweolaty baza danych endosymbioza ewolucja plastydy Paulinella sygnały kierujące

Deskryptory:

  • NZ8_1: Biologia ewolucyjna
  • NZ8_10: Taksonomia i filogenetyka
  • NZ8_14: Inne zagadnienia pokrewne

Panel:

NZ8 - Podstawy wiedzy o życiu na poziomie środowiskowym: biologia ewolucyjna, biologia populacyjna, biologia środowiskowa, systematyka

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Biotechnologii

woj. dolnośląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Przemysław Gagat 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: SONATA 13 - ogłoszony 2017-06-14

Przyznana kwota: 519 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2018-04-10

Zakończenie projektu: 2023-04-09

Planowany czas trwania projektu: 60 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Laptop Asus ROG Strix.
  2. Przenośny komputer osobisty. Za kwotę 18 000 PLN
  3. Monitor komputerowy. Za kwotę 3 000 PLN
  4. Serwer komputerowy. Za kwotę 45 000 PLN
  5. Tablet z klawiaturą i rysikiem.
  6. Zasilacz awaryjny UPS. Za kwotę 7 000 PLN
  7. Klaster komputerowy. Za kwotę 40 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (8)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Benchmarks in antimicrobial peptide prediction are biased due to the selection of negative data
    Autorzy:
    Katarzyna Sidorczuk, Przemysław Gagat, Filip Pietluch, Jakub Kała, Dominik Rafacz, Laura Bąkała, Jadwiga Słowik, Rafał Kolenda, Stefan Rödiger, Legana CHW Fingerhut, Ira R Cooke, Paweł Mackiewicz, Michał Burdukiewicz
    Czasopismo:
    Briefings in Bioinformatics (rok: 2022, tom: 23, strony: bbac343), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bib/bbac343 - link do publikacji
  2. Proteomic Screening for Prediction and Design of Antimicrobial Peptides with AmpGram
    Autorzy:
    Michał Burdukiewicz, Katarzyna Sidorczuk, Dominik Rafacz, Filip Pietluch, Jarosław Chilimoniuk, Stefan Rödiger, Przemysław Gagat
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2020, tom: 21, strony: 45304), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms21124310 - link do publikacji
  3. Characterization of signal and transit peptides based on motif composition and taxon-specific patterns
    Autorzy:
    Katarzyna Sidorczuk, Paweł Mackiewicz, Filip Pietluch, Przemysław Gagat
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2023, tom: brak, strony: brak), Wydawca: Nature Publishing Group UK
    Status:
    Złożona
    Doi:
    10.21203/rs.3.rs-2926521/v1 - link do publikacji
  4. Prediction of Signal Peptides in Proteins from Malaria Parasite
    Autorzy:
    Michał Burdukiewicz , Piotr Sobczyk, Jarosław Chilimoniuk, Przemysław Gagat, Paweł Mackiewicz
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2018, tom: 19, strony: 3709), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms19123709 - link do publikacji
  5. CancerGram: An Effective Classifier for Differentiating Anticancer from Antimicrobial Peptides
    Autorzy:
    Michał Burdukiewicz, Katarzyna Sidorczuk, Dominik Rafacz, Filip Pietluch, Mateusz Bąkała, Jadwiga Słowik, Przemysław Gagat
    Czasopismo:
    Pharmaceutics (rok: 2020, tom: 12, strony: 45305), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/pharmaceutics12111045 - link do publikacji
  6. Dating the Origin and Spread of Plastids and Chromatophores
    Autorzy:
    Filip Pietluch, Paweł Mackiewicz, Katarzyna Sidorczuk, Przemysław Gagat
    Czasopismo:
    Systematic Biology (rok: 2022, tom: brak, strony: brak), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Złożona
    Doi:
    10.1101/2022.07.01.497312 - link do publikacji
  7. Testing Antimicrobial Properties of Selected Short Amyloids
    Autorzy:
    Przemysław Gagat, Anna Duda-Madej, Michał Ostrówka, Filip Pietluch, Alicja Seniuk, Paweł Mackiewicz, Michał Burdukiewicz
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2023, tom: 24, strony: 804), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms24010804 - link do publikacji
  8. Prediction of protein subplastid localization and origin with PlastoGram
    Autorzy:
    Katarzyna Sidorczuk, Przemysław Gagat, Jakub Kała, Henrik Nielsen, Filip Pietluch, Paweł Mackiewicz, Michał Burdukiewicz
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2023, tom: 13, strony: 8365), Wydawca: Nature Publishing Group UK
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-023-35296-0 - link do publikacji
  1. The photosynthetic adventure of Paulinella spp.
    Autorzy:
    Przemysław Gagat, Katarzyna Sidorczuk, Filip Pietluch, Paweł Mackiewicz
    Książka:
    Results and Problems in Cell Differentation (rok: 2020, tom: Symbiosis, strony: 353-386), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy