Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Numerycznie zaawansowana demodulacja fazy i amplitudy na potrzeby interferencyjnej mikroskopii optycznej z elementami tomografii

2017/25/B/ST7/02049

Słowa kluczowe:

obrazowanie fazy i amplitudy mikroskopia interferencyjna transformacja Hilberta-Huanga tomografia interferencyjna mikroskopia biologiczna bez znaczników

Deskryptory:

  • ST7_5: Mikro- i nanoelektronika, optoelektronika

Panel:

ST7 - Inżynieria systemów i komunikacji: elektronika, komunikacja, optoelektronika

Jednostka realizująca:

Politechnika Warszawska, Wydział Mechatroniki

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Maciej Trusiak 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: OPUS 13 - ogłoszony 2017-03-15

Przyznana kwota: 1 265 602 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2018-01-19

Zakończenie projektu: 2021-07-18

Planowany czas trwania projektu: 42 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Komputer do obliczeń naukowych (2 szt.). Za kwotę 20 000 PLN
  2. Laser (2 szt.). Za kwotę 11 000 PLN
  3. Stolik sterowany piezoelektrycznie i kontroler. Za kwotę 25 000 PLN
  4. Obiektyw mikroskopowy wysokiej jakości (2 szt.). Za kwotę 12 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (24)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (20)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. DarkFocus: numerical autofocusing in digital in-line holographic microscopy using variance of computational dark-field gradient
    Autorzy:
    Maciej Trusiak, Jose Angel Picazo-Bueno, Piotr Zdańkowski, Vicente Mico
    Czasopismo:
    Optics and Lasers in Engineering (rok: 2020, tom: 134, strony: 106195), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.optlaseng.2020.106195 - link do publikacji
  2. Full-field vibration profilometry using time-averaged interference microscopy aided by variational analysis
    Autorzy:
    M Cywińska, M Trusiak, A Styk, K Patorski
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2020, tom: 28(1), strony: 435-450), Wydawca: OSA - The Optical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.28.000435 - link do publikacji
  3. Single-shot slightly off-axis digital holographic microscopy with add-on module based on beamsplitter cube
    Autorzy:
    J. A. Picazo-Bueno, M. Trusiak, V. Micó
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2019, tom: 27, strony: 5655-5669), Wydawca: Optical Society of America
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.27.005655 - link do publikacji
  4. Three-level transmittance 2D grating with reduced spectrum and its self-imaging
    Autorzy:
    Krzysztof Patorski, Łukasz Służewski, Piotr Zdańkowski, Maria Cywińska, Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2019, tom: 27, strony: 1854-1868), Wydawca: Optical Society of America
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.27.001854 - link do publikacji
  5. 5-beam grating interferometry for extended phase gradient sensing
    Autorzy:
    Krzysztof Patorski, Łukasz Służewski, Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2018, tom: 26, strony: 26872-26887), Wydawca: Optical society of America
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.26.026872 - link do publikacji
  6. Automatized fringe pattern preprocessing using unsupervised variational image decomposition
    Autorzy:
    M. Cywińska, M. Trusiak, K. Patorski
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2019, tom: 16/27, strony: 22542-22562), Wydawca: OSA - The Optical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.27.022542 - link do publikacji
  7. FPM app: an open-source MATLAB application for simple and intuitive Fourier ptychographic reconstruction
    Autorzy:
    Mikołaj Rogalski, Piotr Zdańkowski, Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Bioinformatics (rok: 2021, tom: btab237, strony: btab237), Wydawca: Oxford Academic
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bioinformatics/btab237 - link do publikacji
  8. Full volume super-resolution imaging of thick mitotic spindle using 3D AO STED microscope
    Autorzy:
    Piotr Zdankowski, David McGloin, Jason Swedlow
    Czasopismo:
    Biomedical Optics Express (rok: 2019, tom: 10, strony: 45306), Wydawca: Optical Society of America
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
  9. High-speed 3D shape measurement using the optimized composite fringe patterns and stereo-assisted structured light system
    Autorzy:
    W. Yin, S. Feng, T. Tao, L. Huang, M. Trusiak, Q. Chen, C. Zuo
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2019, tom: 45378, strony: 2411-2431), Wydawca: OSA The Optical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.27.002411 - link do publikacji
  10. Variable zoom digital in-line holographic microscopy
    Autorzy:
    M Sanz, M Trusiak, J García, V Micó
    Czasopismo:
    Optics and Lasers in Engineering (rok: 2020, tom: 127, strony: 105939), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.optlaseng.2019.105939 - link do publikacji
  11. Common-path intrinsically achromatic optical diffraction tomography
    Autorzy:
    Piotr Zdańkowski, Julianna Winnik, Krzysztof Patorski, Paweł Gocłowski, Michał Ziemczonok, Michał Józwik, Małgorzata Kujawińska, and Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Biomedical Optics Express (rok: 2021, tom: 12(7), strony: 4219-4234), Wydawca: OSA The Optical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/BOE.428828 - link do publikacji
  12. DeepDensity: Convolutional neural network based estimation of local fringe pattern density
    Autorzy:
    M. Cywińska, F. Brzeski, W. Krajnik, K. Patorski, C. Zuo, M. Trusiak
    Czasopismo:
    Optics and Lasers in Engineering (rok: 2021, tom: 145, strony: 106675), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.optlaseng.2021.106675 - link do publikacji
  13. Enhancing single-shot fringe pattern phase demodulation using advanced variational image decomposition
    Autorzy:
    Maria Cywińska, Maciej Trusiak, Chao Zuo, Krzysztof Patorski
    Czasopismo:
    Journal of Optics (rok: 2019, tom: 21(4), strony: 45702), Wydawca: IOP Publishing
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1088/2040-8986/ab078e - link do publikacji
  14. Off-axis digital holographic multiplexing for rapid wavefront acquisition and processing
    Autorzy:
    Natan T. Shaked, Vicente Micó, Maciej Trusiak, Arkadiusz Kuś, and Simcha K. Mirsky
    Czasopismo:
    Advances in Optics and Photonics (rok: 2020, tom: 12(3), strony: 556-611), Wydawca: OSA The Optical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/AOP.384612 - link do publikacji
  15. Single-shot isotropic quantitative phase microscopy based on color-multiplexed differential phase contrast
    Autorzy:
    Y Fan, J Sun, Q Chen, X Pan, M Trusiak, C Zuo
    Czasopismo:
    APL Photonics (rok: 2019, tom: 4 (12), strony: 121301-1 : 121301:12), Wydawca: AIP Publishing
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1063/1.5124535 - link do publikacji
  16. Temporal phase unwrapping using deep learning
    Autorzy:
    W Yin, Q Chen, S Feng, T Tao, L Huang, M Trusiak, A Asundi, C Zuo
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9 (1), strony: 20175, 1-12), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-019-56222-3 - link do publikacji
  17. Grating deployed total-shear 3-beam interference microscopy with reduced temporal coherence
    Autorzy:
    Krzysztof Patorski, Piotr Zdańkowski, and Maciej Trusiak
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2020, tom: 28(5), strony: 6893-6908), Wydawca: OSA The Optical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.383201 - link do publikacji
  18. Single-shot two-frame π-shifted spatially multiplexed interference phase microscopy
    Autorzy:
    M Trusiak, JA Picazo-Bueno, K Patorski, P Zdankowski, V Mico
    Czasopismo:
    Journal of Biomedical Optics (rok: 2019, tom: 24(9), strony: 096004-1 : 096004-8), Wydawca: SPIE
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1117/1.JBO.24.9.096004 - link do publikacji
  19. Spatially multiplexed interferometric microscopy: principles and applications to biomedical imaging
    Autorzy:
    José Ángel Picazo-Bueno, Maciej Trusiak, Javier García, Vicente Micó
    Czasopismo:
    Journal of Physics: Photonics (rok: 2021, tom: 3(3), strony: 34005), Wydawca: IOP Publishing
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1088/2515-7647/abfc59 - link do publikacji
  20. Automatic fringe pattern enhancement using truly adaptive period-guided bidimensional empirical mode decomposition
    Autorzy:
    Paweł Gocłowski, Maciej Trusiak, Azeem Ahmad, Adam Styk, Vicente Mico, Balpreet S. Ahluwalia, and Krzysztof Patorski
    Czasopismo:
    Optics Express (rok: 2020, tom: 28(5), strony: 6277-6293), Wydawca: OSA The Optical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1364/OE.382543 - link do publikacji
  21. Hilbert–Huang transform based advanced Bessel fringe generation and demodulation for full-field vibration studies of specular reflection micro-objects
    Autorzy:
    Maciej Trusiak, Adam Styk, Krzysztof Patorski
    Czasopismo:
    Optics and Lasers in Engineering (rok: 2018, tom: 110, strony: 100-112), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.optlaseng.2018.05.021 - link do publikacji
  22. Moiré microstructure generated binary amplitude gratings for suppression of high diffraction orders
    Autorzy:
    Krzysztof Patorski, Maria Cywińska, Piotr Zdańkowski, MaciejTrusiak
    Czasopismo:
    Optics and Lasers in Engineering (rok: 2021, tom: 147, strony: 106731), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.optlaseng.2021.106731 - link do publikacji
  23. Numerically Enhanced Stimulated Emission Depletion Microscopy with Adaptive Optics for Deep-Tissue Super-Resolved Imaging
    Autorzy:
    P Zdankowski, M Trusiak, D McGloin, JR Swedlow
    Czasopismo:
    ACS Nano (rok: 2020, tom: 14, strony: 9b05891), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acsnano.9b05891 - link do publikacji
  24. Variational Hilbert Quantitative Phase Imaging
    Autorzy:
    Maciej Trusiak, Maria Cywińska, Vicente Mico, Jose Angel Picazo-Bueno, Chao Zuo, Piotr Zdańkowski, Krzysztof Patorski
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2020, tom: 10, strony: 13955), Wydawca: Nature Publishing
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-020-69717-1 - link do publikacji
  1. Biological phase sample study using variational Hilbert imaging technique
    Autorzy:
    Maria Cywińska; Maciej Trusiak; Krzysztof Patorski
    Konferencja:
    SPIE Photonics West BiOS, 2019, San Francisco, California, United States (rok: 2019, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 2-7 . 02
    Status:
    Opublikowana
  2. Common-path two-shot binary checker grating based interference microscope for quantitative bio-phase imaging
    Autorzy:
    Piotr Zdańkowski, Krzysztof Patorski, Maria Cywińska, and Maciej Trusiak
    Konferencja:
    Digital Holography and Three-Dimensional Imaging 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: OSA Technical Digest (Optical Society of America, 2019)
    Data:
    konferencja 19-23 . 05
    Status:
    Opublikowana
  3. Total-shear grating based optical diffraction tomography
    Autorzy:
    Piotr Zdańkowski, Julianna Winnik, Paweł Gocłowski, Maciej Trusiak
    Konferencja:
    Biophotonics Congress: Optics in the Life Sciences 2021 (rok: 2021, ), Wydawca: OSA The Optical Society
    Data:
    konferencja 12-16.04.2021
    Status:
    Opublikowana
  4. 3D STED Deep Tissue Imaging Using Adaptive Optics
    Autorzy:
    P. Zdankowski, M. Trusiak, D. Mcgloin, J.R. Swedlow
    Konferencja:
    Focus on Microscopy 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: FOM2019
    Data:
    konferencja 14-17 . 04
    Status:
    Opublikowana
  5. Analysis of fringe patterns with variable density using modified variational image decomposition aided by the Hilbert Transform
    Autorzy:
    M. Cywińska, M. Trusiak, K. Patorski
    Konferencja:
    21st Czech-Polish-Slovak Optical Conference on Wave and Quantum Aspects of Contemporary Optics, 2018, Lednice, Czech Republic (rok: 2018, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 03-07.09.2018
    Status:
    Opublikowana
  6. High space-bandwidth product phase imaging using VHQPI numerical add-on
    Autorzy:
    Maria Cywińska, Krzysztof Patorski, and Maciej Trusiak
    Konferencja:
    Biophotonics Congress: Optics in the Life Sciences 2021 (rok: 2021, ), Wydawca: OSA The Optical Society
    Data:
    konferencja 12-16.04.2021
    Status:
    Opublikowana
  7. Variational approach in time-averaged interference microscopy for full-field vibration profilometry
    Autorzy:
    Maria Cywińska, Maciej Trusiak, Adam Styk, and Krzysztof Patorski
    Konferencja:
    Digital Holography and Three-Dimensional Imaging 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: OSA Technical Digest (Optical Society of America, 2019)
    Data:
    konferencja 19-23 . 05
    Status:
    Opublikowana
  8. Amplitude checker grating-based multichannel lateral shear interferometry for extended aberration sensing
    Autorzy:
    Łukasz Służewski, Krzysztof Patorski, Maciej Trusiak
    Konferencja:
    SPIE Optical Engineering + Applications, 2018, San Diego, California, United States (rok: 2018, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 18-23.08.2018
    Status:
    Opublikowana
  9. An adaptive optics 3D STED microscope for super-resolution imaging of thick samples with background noise suppression using digital image processing
    Autorzy:
    Piotr Zdańkowski, Maciej Trusiak, Maria Cywińska, Jason R. Swedlow
    Konferencja:
    SPECKLE 2018: VII International Conference on Speckle Metrology, 2018, Janów Podlaski, Poland (rok: 2018, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 10-12.09.2018
    Status:
    Opublikowana
  10. Modified variational image decomposition algorithm aided by the Hilbert transform as an alternative to 2D Hilbert-Huang transform for fringe pattern phase retrieval
    Autorzy:
    Maria Cywińska, Maciej Trusiak, Krzysztof Patorski, Jose Angel Picazo-Bueno, Vicente Mico
    Konferencja:
    SPECKLE 2018: VII International Conference on Speckle Metrology, 2018, Janów Podlaski, Poland (rok: 2018, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 10-12.09.2018
    Status:
    Opublikowana
  11. Single-frame fringe pattern analysis using modified variational image decomposition aided by the Hilbert transform for fast full-field quantitative phase imaging
    Autorzy:
    Maria Cywińska, Maciej Trusiak, Vicente Mico, Krzysztof Patorski
    Konferencja:
    SPIE Photonics Europe, 2018, Strasbourg, France (rok: 2018, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 22-26.04.2018
    Status:
    Opublikowana
  12. Single-shot two-frame interference microscopy for robust quantitative phase imaging of fixed and dynamic samples
    Autorzy:
    Maciej Trusiak, Jose Angel Picazo-Bueno, Mikołaj Rogalski, Maria Cywinska, Piotr Zdańkowski, Vicente Micó
    Konferencja:
    SPIE Optical Metrology (rok: 2021, ), Wydawca: SPIE
    Data:
    konferencja 21-26.06.2021
    Status:
    Opublikowana
  13. Upgrading a brightfield optical microscope into a robust numerically advanced interference-based phase imager
    Autorzy:
    Maciej Trusiak, Krzysztof Patorski, Piotr Zdańkowski, Maria Cywińska, Vicente Mico, Jose-Angel Picazo-Bueno, and Javier Garcia
    Konferencja:
    Imaging and Applied Optics 2019 (COSI, IS, MATH, pcAOP) (rok: 2019, ), Wydawca: OSA Technical Digest (Optical Society of America, 2019)
    Data:
    konferencja 24-27 . 06
    Status:
    Opublikowana
  14. Adaptive information retrieval in automated fringe based full-field optical metrology
    Autorzy:
    K. Patorski, M. Trusiak
    Konferencja:
    SPECKLE 2018: VII International Conference on Speckle Metrology, 2018, Janów Podlaski, Poland (rok: 2018, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 10-12.09.2018
    Status:
    Opublikowana
  15. Machine-learning based fast unsupervised variational image decomposition for fringe pattern analysis
    Autorzy:
    Maria Cywińska, Maciej Trusiak, Krzysztof Patorski
    Konferencja:
    SPIE Optical Engineering + Applications - Interferometry XX (rok: 2020, ), Wydawca: SPIE Proceedings
    Data:
    konferencja 24-28.08.2020
    Status:
    Opublikowana
  16. Moiré effect-based interference microscopy for biospecimen characterization
    Autorzy:
    Maciej Trusiak, Vicente Mico, Jose Angel Picazo-Bueno, Maria Cywińska, Piotr Zdańkowski, Krzysztof Patorski
    Konferencja:
    SPIE Optical Engineering + Applications, 2018, San Diego, California, United States (rok: 2018, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 18-23.08.2018
    Status:
    Opublikowana
  17. Practical Improvements Into the Fourier Ptychographic Microscopy Reconstruction Path
    Autorzy:
    Mikołaj Rogalski, Piotr Zdańkowski, Maciej Trusiak
    Konferencja:
    Biophotonics Congress: Optics in the Life Sciences 2021 (rok: 2021, ), Wydawca: OSA The Optical Society
    Data:
    konferencja 12-16.04.2021
    Status:
    Opublikowana
  18. Multi-beam spatially multiplexed interference microscopy for phase objects examination
    Autorzy:
    Piotr Zdańkowski, Vicente Mico, Jose Angel Picazo-Bueno, Krzysztof Patorski, Maciej Trusiak
    Konferencja:
    SPIE Optical Engineering + Applications, 2018, San Diego, California, United States (rok: 2018, ), Wydawca: SPIE International Society for Optics and Photonics
    Data:
    konferencja 19-23.08.2018
    Status:
    Opublikowana
  19. Quasi-noise-free stimulated emission depletion microscopy imaging of thick samples using adaptive optics and block-matching 3D filtering
    Autorzy:
    Piotr Zdankowski, Maciej Trusiak, David McGloin, and Jason R. Swedlow
    Konferencja:
    Imaging and Applied Optics 2019 (COSI, IS, MATH, pcAOP) (rok: 2019, ), Wydawca: OSA Technical Digest (Optical Society of America, 2019)
    Data:
    konferencja 24-27 . 06
    Status:
    Opublikowana
  20. Variational Hilbert Phase Imaging for Prostate Cell Analysis
    Autorzy:
    M. Cywinska, M. Trusiak, K. Patorski, P. Zdankowski, J.A. Picazo-Bueno, V. Mico
    Konferencja:
    Focus on Microscopy 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: FOM2019
    Data:
    konferencja 14-17 . 04
    Status:
    Opublikowana
  1. Interferometric Methods in NDE
    Autorzy:
    Krzysztof Patorski, Maciej Trusiak
    Książka:
    Handbook of Advanced Non-Destructive Evaluation (rok: 2018, tom: 1, strony: 45313), Wydawca: Springer, Cham
    Status:
    Opublikowana