Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Receptory zaangażowane w adsorpcję bakteriofagów do komórek Dickeya solani i Pectobacterium parmentieri i ekologiczny koszt oporności bakterii na bakteriofagi in vitro i in planta

2017/25/B/NZ9/00036

Słowa kluczowe:

przyłączanie się wirusy bakteryjne fagooporność analiza genomów fenoptypy ziemniak (Solanum tuberosum) mutageneza transpozonowa inaktywacja genów

Deskryptory:

  • NZ9_8: Mikrobiologia środowiskowa
  • NZ9_9: Biotechnologia środowiskowa
  • NZ2_1: Genetyka molekularna

Panel:

NZ9 - Stosowane nauki o życiu: rolnictwo, leśnictwo, ogrodnictwo, rybactwo, żywienie i żywność, biotechnologia środowiskowa

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Gdański, Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii Uniwersytetu Gdańskiego i Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego

woj. pomorskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Robert Czajkowski 

Liczba wykonawców projektu: 3

Konkurs: OPUS 13 - ogłoszony 2017-03-15

Przyznana kwota: 1 301 600 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2018-09-03

Zakończenie projektu: 2023-03-02

Planowany czas trwania projektu: 54 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Zestaw precyzyjnych, elektronicznych pipet zmienno-objętościowych z funkcją mieszania i dyspenserem wraz ze stacją dokująco-ładującą.
  2. Szafa fitotronowa do hodowli roślin in vitro i w glebie z regulowaną kontrolą temperatury, wilgotności i fotoperiodu. Za kwotę 50 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (6)
  1. Fast and reliable screening assay developed to preselect candidate Soft Rot Pectobacteriaceae Tn5 mutants showing resistance to bacteriophage infection
    Autorzy:
    R. Czajkowski (autor korespondencyjny), M. Marcisz, P. Bartnik
    Czasopismo:
    European Journal of Plant Pathology (rok: 2019, tom: 155, strony: 671-676), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s10658-019-01786-z - link do publikacji
  2. Fast and reliable procedure developed to generate soft rot Pectobacteriaceae (Pectobacterium spp. and Dickeya spp.) Tn5 mutants resistant to bacteriophage infection
    Autorzy:
    R. Czajkowski (autor korespondencyjny)
    Czasopismo:
    European Journal of Plant Pathology (rok: 2021, tom: 159, strony: 227-231), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s10658-020-02143-1 - link do publikacji
  3. Pectobacterium parmentieri SCC 3193 mutants with altered synthesis of cell surface polysaccharides are resistant to N4-Like lytic bacteriophage phiA38 (vB_Ppp_A38) but express decreased virulence in potato (Solanum tuberosum L.) plants
    Autorzy:
    P. Bartnik, S. Jafra, M. Narajczyk, P. Czaplewska and R. Czajkowski (autor korespondencyjny)
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2021, tom: 22 (14), strony: 7346), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms22147346 - link do publikacji
  4. Resistance of Dickeya solani strain IPO 2222 to lytic bacteriophage ΦD5 results in fitness tradeoffs for the bacterium during infection
    Autorzy:
    P. Bartnik, K. Lewtak, M. Fiołka, P. Czaplewska, M. Narajczyk, R. Czajkowski (autor korespondencyjny)
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2022, tom: 12 (10725), strony: 45314), Wydawca: Nature Portfolio
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-022-14956-7 - link do publikacji
  5. Spontaneous mutations in hlyD and tuf genes result in resistance of Dickeya solani IPO 2222 to phage ϕD5 but cause decreased bacterial fitness and virulence in planta
    Autorzy:
    D. Sokolova, A. Smolarska, P. Bartnik, L. Rabalski, M. Kosinski, M, Narajczyk, D. Krzyzanowska, M. Rajewska, I. Mruk, P. Czaplewska, S. Jafra, R. Czajkowski (autor korespondencyjny)
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2023, tom: 5,77361111111111, strony: 45307), Wydawca: Nature Portfolio
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-023-34803-7 - link do publikacji
  6. Complete genome sequence and phylogenomic analysis of the first N4-like lytic bacteriophage vB_Ppp_A38 (ϕA38) infecting Pectobacterium parmentieri
    Autorzy:
    R. Czajkowski (autor korespondencyjny), L. Rabalski, M. Kosinski and A. Smolarska
    Czasopismo:
    European Journal of Plant Pathology (rok: 2021, tom: 161(2), strony: 483-489), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s10658-021-02334-4 - link do publikacji