Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Kotranskrypcyjne fałdowanie vRNA wirusa grypy w obecności antysensowych oligonukleotydów w zainfekowanych wirusem komórkach MDCK. Nowa metoda chemicznego mapowania struktury RNA w oparciu o metodę głębokiego sekwencjonowania.

2017/25/B/NZ1/02269

Słowa kluczowe:

RNA wirus grypy terapeutyczne oligonukleotydy mapowanie RNA z użyciem PVP głębokie sekwencjonowanie kotranskrypcyjne fałdowanie RNA struktura drugorzędowa RNA

Deskryptory:

  • NZ1_2: Biochemia
  • NZ1_4: Biologia strukturalna
  • NZ1_1: Biologia molekularna

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Ryszard Kierzek 

Liczba wykonawców projektu: 5

Konkurs: OPUS 13 - ogłoszony 2017-03-15

Przyznana kwota: 2 068 520 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2018-01-30

Zakończenie projektu: 2022-01-29

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Aparat do elektroforezy poliakrylamidowej. Za kwotę 16 000 PLN
  2. Oprogramowanie do komputera.
  3. Aparat Real-Time PCR.
  4. Inkubator z dwutlenkiem węgla. Za kwotę 35 000 PLN
  5. Spektrofotometr UV/VIS z termoprogramatorem i kuwetami kwarcowymi. Za kwotę 142 000 PLN
  6. Wysokiej sprawności komputer, monitor i drukarka laserowa. Za kwotę 12 000 PLN
  7. Zasilacz wysokonapięciowy. Za kwotę 9 000 PLN
  8. Aspirator próżniowy. Za kwotę 12 000 PLN
  9. Komora laminarna II klasa bezpieczeństwa. Za kwotę 45 000 PLN
  10. Pompa olejowa wysokiej próżni. Za kwotę 10 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (10)
  1. RNA Secondary Structure Motifs of the Influenza A Virus as Targets for siRNA-Mediated RNA Interference.
    Autorzy:
    J. Piasecka, E. Lenartowicz, M. Soszynska-Jozwiak, B. Szutkowska, R. Kierzek, E. Kierzek
    Czasopismo:
    Molecular Therapy-Nucleic Acids (rok: 2020, tom: 19, strony: 627-642), Wydawca: Cell Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.omtn.2019.12.018 - link do publikacji
  2. RNA Secondary Structure as a First Step for Rational Design of the Oligonucleotides towards Inhibition of Influenza A Virus Replication.
    Autorzy:
    M. Szabat, D. Lorent, T. Czapik, M. Tomaszewska, E. Kierzek, R. Kierzek
    Czasopismo:
    Pathogenes (rok: 2020, tom: 9, strony: 925), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/pathogens9110925 - link do publikacji
  3. Secondary Structure of Influenza A Virus Genomic Segment 8 RNA Folded in a Cellular Environment
    Autorzy:
    B. Szutkowska, K. Wieczorek, R. Kierzek, P. Zmora, J. M. Peterson, W. N. Moss, D. H. Mathews, E. Kierzek
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2022, tom: 23, strony: 2452), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms23052452 - link do publikacji
  4. The regulation properties of RNA secondary structure in alternative splicing
    Autorzy:
    N. Bartys, R. Kierzek, J. Lisowiec-Wachnicka
    Czasopismo:
    Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms (rok: 2019, tom: 1862, strony: 194401), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bbagrm.2019.07.002 - link do publikacji
  5. Computational and NMR studies of RNA duplexes with an internal pseudouridine-adenosine base pair
    Autorzy:
    I. Deb, L. Popenda, J. Sarzynska, M. Malgowska, A. Lahiri, Z. Gdaniec, R. Kierzek
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 16278), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-019-52637-0 - link do publikacji
  6. Conserved Structural Motifs of Two Distant IAV Subtypes in Genomic Segment 5 RNA
    Autorzy:
    P. Michalak, J. Piasecka, B. Szutkowska, R. Kierzek, E. Biala, W.N. Moss, E. Kierzek
    Czasopismo:
    VIRUSES-BASEL (rok: 2021, tom: 13, strony: 2000-2016), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/v13030525 - link do publikacji
  7. Thermodynamic and structural contributions of the 6-thioguanosine residue to helical properties of RNA
    Autorzy:
    M. Gladysz, W. Andralojc, T. Czapik, Z. Gdaniec, R. Kierzek
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 4385), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-019-40715-2 - link do publikacji
  8. Universal and strain specific structure features of segment 8 genomic RNA of influenza A virus - application of 4-thiouridine photocrosslinking
    Autorzy:
    M. Soszynska-Jozwiak, M. Pszczola, J. Piasecka, J.M. Peterson, W.N. Moss, K. Taras-Goslinska, R. Kierzek, E. Kierzek
    Czasopismo:
    Journal of Biological Chemistry (rok: 2021, tom: 297, strony: 101245), Wydawca: ASBMB
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jbc.2021.101245 - link do publikacji
  9. Structural variants and modifications of hammerhead ribozymes targeting influenza A virus conserved structural motifs
    Autorzy:
    T. Czapik, J. Piasecka, R. Kierzek, E. Kierzek
    Czasopismo:
    Molecular Therapy - Nucleic Acids (tom: brak, strony: brak), Wydawca: Elsevier Inc
    Status:
    Złożona
    Doi:
    brak - link do publikacji
  10. Secondary structure of the segment 5 genomic RNA of influenza A virus and its application for designing antisense oligonucleotides
    Autorzy:
    P. Michalak, M. Soszynska-Jozwiak, E. Biala, W.N. Moss, J. Kesy, B. Szutkowska, E. Lenartowicz, R. Kierzek, E. Kierzek
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 3801), Wydawca: Nuture Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-019-40443-7 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy