Projekty finansowane przez NCN
Identyfikacja funkcjonalnych miejsc wiązania MYC oraz docelowych genów niezbędnych dla wzrostu komórek nowotworowych w oparciu o badanie przesiewowe CRISPR/Cas9
2016/23/D/NZ1/01611
Słowa kluczowe:
MYC geny docelowe MYC nowotwory CRISPR/Cas9 wysokoprzepustowe badanie przesiewowe
Deskryptory:
- NZ1_1: Biologia molekularna
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ3_1: Biologia komórki
Panel:
NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia
Jednostka realizująca:
Instytut Genetyki Człowieka Polskiej Akademii Nauk
woj. wielkopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
dr hab. Agnieszka Dzikiewicz-Krawczyk
Liczba wykonawców projektu: 6
Konkurs: SONATA 12 - ogłoszony 2016-09-15
Przyznana kwota: 815 000 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2017-08-04
Zakończenie projektu: 2021-08-03
Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- Inkubator CO2 Binder C170. Za kwotę 35 000 PLN
- Mikroskop odwrócony Leica DMIL LED z modułem fluorescencyjnym GFP. Za kwotę 65 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (5)
- Publikacje książkowe (1)
- Intricate crosstalk between MYC and non-coding RNAs regulates hallmarks of cancerAutorzy:Swier LJYM, Dzikiewicz-Krawczyk A, Winkle M, van den Berg A, Kluiver JCzasopismo:Molecular Oncology (rok: 2018, tom: Epub Dec5, strony: -), Wydawca: ElsevierStatus:OpublikowanaDoi:10.1002/1878-0261.12409 - link do publikacji
- The lncRNA KTN1-AS1 co-regulates a variety of Myc-target genes and enhances proliferation of Burkitt lymphoma cellsAutorzy:Winkle M, Tayari MM, Kok K, Duns G, Grot N, Kazimierska M, Seitz A, de Jong D, Koerts J, Diepstra A, Dzikiewicz-Krawczyk A, Steidl C, Kluiver J, van den Berg ACzasopismo:Human Molecular Genetics (rok: 2022, tom: 31(24), strony: 4193-4206), Wydawca: Oxford University PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/hmg/ddac159 - link do publikacji
- TransCRISPR-sgRNA design tool for CRISPR/Cas9 experiments targeting specific sequence motifsAutorzy:Woźniak T, Sura W, Kazimierska M, Kasprzyk ME, Podralska M, Dzikiewicz-Krawczyk ACzasopismo:Nucleic Acids Research (rok: 2023, tom: -, strony: 45301), Wydawca: Oxford University PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/nar/gkad355 - link do publikacji
- CRISPR/Cas9 screen for genome-wide interrogation of essential MYC-bound E-boxes in cancer cellsAutorzy:Marta Kazimierska, Marta Podralska, Magdalena Żurawek, Tomasz Woźniak, Marta Elżbieta Kasprzyk, Weronika Sura, Wojciech Łosiewski, Iwona Ziółkowska-Suchanek, Joost Kluiver, Anke van den Berg, Natalia Rozwadowska, Agnieszka Dzikiewicz-KrawczykCzasopismo:Molecular Oncology (rok: 2023, tom: -, strony: -), Wydawca: FEBS PressStatus:Przyjęta do publikacjiDoi:10.1101/2021.08.02.454734v3 - link do publikacji
- The miR-26b-5p/KPNA2 Axis Is an Important Regulator of Burkitt Lymphoma Cell GrowthAutorzy:Fubiao Niu, Marta Kazimierska, Ilja M Nolte, Miente Martijn Terpstra, Debora de Jong, Jasper Koerts, Tineke van der Sluis, Bea Rutgers, Ryan M O'Connell, Klaas Kok, Anke van den Berg, Agnieszka Dzikiewicz-Krawczyk, Joost KluiverCzasopismo:Cancers (rok: 2020, tom: 12(6), strony: 1464), Wydawca: MDPIStatus:OpublikowanaDoi:10.3390/cancers12061464 - link do publikacji
- NGS-based high-throughput screen to identify microRNAs regulating growth of B-cell lymphomaAutorzy:Kluiver J, Niu F, Yuan Y, Kok K, van den Berg A, Dzikiewicz-Krawczyk AKsiążka:Methods in Molecular Biology. Lymphoma (rok: 2019, tom: 1956, strony: 269-282), Wydawca: SpringerLinkStatus:Opublikowana