Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Identyfikacja nowych zmian genetycznych w nowotworach mózgu o wysokim stopniu złośliwości u dzieci przy użyciu sekwencjonowania nowej generacji oraz ocena ich przydatności klinicznej

2016/23/B/NZ2/03064

Słowa kluczowe:

nowotwory mózgu wieku rozwojowego markery molekularne sekwencjonowanie następnej generacji nowotwory o wysokim stopniu złośliwości glioblastoma choroid plexus carcinoma pineoblastoma oligodendroglioma.

Deskryptory:

  • NZ5_5: Diagnostyka chorób człowieka
  • NZ5_3: Patogeneza chorób człowieka
  • NZ2_1: Genetyka molekularna

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Instytut "Pomnik - Centrum Zdrowia Dziecka"

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Joanna Trubicka 

Liczba wykonawców projektu: 11

Konkurs: OPUS 12 - ogłoszony 2016-09-15

Przyznana kwota: 988 800 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2017-07-25

Zakończenie projektu: 2023-01-24

Planowany czas trwania projektu: 66 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Termocykler z systemem wymiany bloków i gradientem. Za kwotę 54 000 PLN
  2. Komputer do analizy danych uzyskanych w wysokoprzepustowych badań. Za kwotę 9 000 PLN
  3. Licencje dla specjalistycznego oprogramowania. Za kwotę 63 000 PLN
  4. Termomikser. Za kwotę 3 500 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (7)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (4)
  1. Transcriptional profiling of paediatric ependymomas identifies prognostically significant groups.
    Autorzy:
    Łastowska Maria, Matyja Eaw, Sobocińska Anna, Wojtaś Bartosz, Niemira Magdalena, Szałkowska Anna, Krętowski Adam, Karkucińska-Więckowska Agnieszka, Kaleta Magdalena, Ejmont Maria, Tarasińska Magdalena, Perek-Polnik Marta, Dembowska-Bagińska Bożenna, Pronicki Maciej, Grajkowska Wiesława, Trubicka Joanna.
    Czasopismo:
    The journal of pathology. Clinical research. (rok: 2021, tom: Vol. 7, Nr 6, strony: s. 565-576), Wydawca: Wiley Online Library
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/cjp2.236 - link do publikacji
  2. Molecular identification of CNS NB-FOXR2, CNS EFT-CIC, CNS HGNET-MN1 and CNS HGNET-BCOR pediatric brain tumors using tumor-specific signature genes.
    Autorzy:
    Maria Łastowska; Joanna Trubicka; Anna Sobocińska; Bartosz Wojtas; Magdalena Niemira; Anna Szałkowska; Adam Krętowski; Agnieszka Karkucińska-Więckowska; Magdalena Kaleta; Maria Ejmont; Marta Perek-Polnik; Bożenna Dembowska-Bagińska; Wiesława Grajkowska; Ewa Matyja
    Czasopismo:
    Acta Neuropathologica Communications (rok: 2020, tom: Vol. 8, strony: Article 105), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s40478-020-00084-9 - link do publikacji
  3. Molecular markers of pediatric solid tumors-diagnosis, optimizing treatments, and determining susceptibility: current state and future directions.
    Autorzy:
    Trubicka Joanna, Grajkowska Wiesława, Dembowska-Bagińska Bożenna.
    Czasopismo:
    Cells (rok: 2022, tom: Vol. 11, Nr 7,, strony: Article 1238), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/cells11071238 - link do publikacji
  4. BCOR expression in pediatric pineoblastoma
    Autorzy:
    Joanna Trubicka, Maria Łastowska, Agnieszka Karkucińska-Więckowska, Magdalena Niemira, Maria Ejmont, Agnieszka Sowińska, Maciej Pronicki, Ewa Matyja, Wiesława Grajkowska
    Czasopismo:
    Folia Neuropathologica (rok: 2023, ), Wydawca: Termedia
    Status:
    Złożona
  5. Immunohistochemical detection of ALK protein identifies APC mutated medulloblastoma and differentiates the WNT-activated medulloblastoma from other types of posterior fossa childhood tumors.
    Autorzy:
    Immunohistochemical detection of ALK protein identifies APC mutated medulloblastoma and differentiates the WNT-activated medulloblastoma from other types of posterior fossa childhood tumors.
    Czasopismo:
    Brain Tumor Pathology (rok: 2019, tom: Vol. 36, Nr 1, strony: 45297), Wydawca: Apringer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s10014-018-0331-2 - link do publikacji
  6. Medulloblastoma with transitional features between Group 3 and Group 4 is associated with good prognosis.
    Autorzy:
    Maria Łastowska; Joanna Trubicka; Magdalena Niemira; Magdalena Paczkowska-Abdulsalam; Agnieszka Karkucińska-Więckowska; Magdalena Kaleta; Monika Drogosiewicz; Marta Perek-Polnik; Adam Krętowski; Bożena Cukrowska; Wiesława Grajkowska; Bożenna Dembowska-Bagińska; Ewa Matyja
    Czasopismo:
    Journal of Neuro-Oncology (rok: 2018, tom: Vol. 138, Nr 2, strony: 231-240), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s11060-018-2797-5 - link do publikacji
  7. Constitutional mosaicism of a de novo TP53 mutation in a patient with bilateral choroid plexus carcinoma.
    Autorzy:
    Joanna Trubicka; Iwona Filipek; Piotr Iwanowski; Małgorzata Rydzanicz; Wiesława Grajkowska; Dorota Piekutowska-Abramczuk; Krystyna Chrzanowska; Agnieszka Karkucińska-Więckowska; Katarzyna Iwanicka-Pronicka; Maciej Pronicki; Maria Łastowska; Rafał Płoski; Bożenna Dembowska-Bagińska
    Czasopismo:
    Cancer Genetics (rok: 2017, tom: Vol. 216-217, strony: 79 - 85), Wydawca: ELSEVIER
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.cancergen.201707.001 - link do publikacji
  1. The presence of ROS1 fusions are not limited only to infantile hemispheric glioma.
    Autorzy:
    Trubicka Joanna, Ciołkowski Maciej, Perek-Polnik Marta, Dembowska-Bagińska Bożenna
    Konferencja:
    20th International Symposium on Pediatric Neuro-Oncology & the SIOPE-BTG. (rok: 2022, ), Wydawca: Oxford University Press
    Data:
    konferencja 11-15.06.2022
    Status:
    Opublikowana
  2. ALK expression at the protein level is a marker for the differentiation diagnosis of the WNT-activated type of pediatric medulloblastoma.
    Autorzy:
    Maria Łastowska; Joanna Trubicka; Magdalena Niemira; Magdalena Paczkowska-Abdulsalam; Agnieszka Karkucińska-Więckowska; Magdalena Kaleta; Monika Drogosiewicz; Magdalena Tarasińska; Marta Perek-Polnik; Adam Krętowski; Bożenna Dembowska-Bagińska; Wiesława Grajkowska; Maciej Pronicki; Ewa Matyja
    Konferencja:
    18th International Symposium on Pediatric Neuro-Oncology (ISPNO 2018) (rok: 2018, ), Wydawca: Neuro-Oncology
    Data:
    konferencja 2018.06.30-2018.07.03
    Status:
    Opublikowana
  3. Germline mutations in MSH2 gene in pediatric patients with congenital and sporadic glioblastoma.
    Autorzy:
    Maria Ejmont; Małgorzata Rydzanicz; Wiesława Grajkowska; Marta Perek-Polnik; Agnieszka Sowińska; Magdalena Kozłowska; Maria Łastowska; Maciej Pronicki; Rafał Płoski; Bożenna Dembowska-Bagińska; Joanna Tr
    Konferencja:
    19th International Symposium on Pediatric Neuro-Oncology (ISPNO 2020) (rok: 2020, ), Wydawca: Oxford University Press
    Data:
    konferencja 2020.12.13-2020.12.16
    Status:
    Opublikowana
  4. Constitutional mosaicism of clinically important genetic markers in pediatric brain tumors detected by next-generation sequencing
    Autorzy:
    Joanna Trubicka; Małgorzata Rydzanicz; Iwona Filipek; Piotr Iwanowski; Wiesława Grajkowska; Maciej Pronicki; Rafał Płoski; Bożenna Dembowska-Bagińska; Maria Łastowska
    Konferencja:
    18th International Symposium on Pediatric Neuro-Oncology (ISPNO 2018) (rok: 2018, ), Wydawca: Neuro-Oncology
    Data:
    konferencja 2018.06.30-2018.07.03
    Status:
    Opublikowana