Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Zastosowanie nowego typu adsorbentów oraz chromatografii cieczowej sprzężonej ze spektrometrią mas w badaniu in vitro metabolizmu oligonukleotydów antysensownych dla potrzeb terapii antysensowej

2016/22/E/ST4/00478

Słowa kluczowe:

oligonukleotydy antysensowe metabolizm chromatografia cieczowa przygotowanie próbki spektrometria mas

Deskryptory:

  • ST4_3: Metody spektroskopowe i spektrometryczne
  • ST4_6: Chemia analityczna
  • ST4_8: Metody instrumentalne w chemii

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Mikołaja Kopernika, Wydział Chemii

woj. kujawsko-pomorskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Sylwia Studzińska 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: SONATA BIS 6 - ogłoszony 2016-06-15

Przyznana kwota: 1 321 149 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2017-06-02

Zakończenie projektu: 2020-12-01

Planowany czas trwania projektu: 42 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. ultra wysokosprawny chromatograf cieczowy. Za kwotę 300 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (21)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. A new approach to preparation of antisense oligonucleotide samples with microextraction by packed sorbent
    Autorzy:
    Łukasz Nuckowski, Anna Kaczmarkiewicz, Sylwia Studzińska, Bogusław Buszewski
    Czasopismo:
    Analyst (rok: 2019, tom: 144, strony: 4622-4632), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c9an00740g - link do publikacji
  2. Analysis of antisense oligonucleotides with the use of ionic liquids as the mobile phase modifiers
    Autorzy:
    Anna Kaczmarkiewicz, Judyta Zielak, Łukasz Nuckowski, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2019, tom: 9, strony: 39100-39110), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c9ra06483d - link do publikacji
  3. Hydrophilic interaction in solid phase extraction of antisense oligonucleotides
    Autorzy:
    Łukasz Nuckowski, Anna Kilanowska, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Journal of Chromatographic Science (rok: 2020, tom: 58, strony: 383–387), Wydawca: Oxford Academic
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/chromsci/bmz114 - link do publikacji
  4. Klasyczne i nowe metody przygotowania próbek oligonukleotydów antysensownych przed analizą chromatograficzną
    Autorzy:
    Łukasz Nuckowski, Anna Kaczmarkiewicz, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Analityka (rok: 2020, tom: 1, strony: 45393), Wydawca: Malamut
    Status:
    Opublikowana
  5. Review on sample preparation methods for oligonucleotides analysis by liquid chromatography
    Autorzy:
    Łukasz Nuckowski, Anna Kaczmarkiewicz, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Journal of Chromatography B (rok: 2018, tom: 1090, strony: 90-100), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jchromb.2018.05.025 - link do publikacji
  6. Analysis of Antisense Oligonucleotides and Their Metabolites with the Use of Ion Pair ReversedPhase Liquid Chromatography Coupled with Mass Spectrometry
    Autorzy:
    Anna Kaczmarkiewicz, Łukasz Nuckowski, Sylwia Studzińska, Bogusław Buszewski
    Czasopismo:
    Critical Review in Analytical Chemistry (rok: 2019, tom: 49, strony: 256-270), Wydawca: Taylor and Francis
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1080/10408347.2018.1517034 - link do publikacji
  7. Attachment of hybridizable oligonucleotide to silica support and its application for selective extraction of unmodified and antisense oligonucleotides from serum samples
    Autorzy:
    Sylwia Studzińska, Magdalena Skoczylas, Szymon Bocian, Anna Dembska, Bogusław Buszewski,
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2020, tom: 10, strony: 16221-16230), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/d0ra01620a - link do publikacji
  8. Studying in vitro metabolism of the first and second generation of antisense oligonucleotides with the use of ultra high performance liquid chromatography coupled with quadrupole time-of-flight mass spectrometry
    Autorzy:
    Anna Kilanowska, Łukasz Nuckowski, Sylwia Studzińska,
    Czasopismo:
    Analytical and Bioanalytical Chemistry (rok: 2020, tom: 412, strony: 7453–7467), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00216-020-02878-0 - link do publikacji
  9. Ultra high performance reversed phase liquid chromatography hyphenated with ESI-Q-TOF-MS for the analysis of unmodified and antisense oligonucleotides
    Autorzy:
    Sylwia Studzińska, Łukasz Nuckowski, Anna Kilanowska
    Czasopismo:
    Chromatographia (rok: 2020, tom: 83, strony: 349–360), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s10337-019-03844-4 - link do publikacji
  10. Adsorbenty ze związanymi cieczami jonowymi i ich wykorzystanie w przygotowaniu próbek oligonukleotydów
    Autorzy:
    Łukasz Nuckowski, Ewa Zalesińska, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Wiadomości Chemiczne (rok: 2020, tom: 74 (7-8), strony: 545-565), Wydawca: Polskie Towarzystwo Chemiczne
    Status:
    Opublikowana
  11. Analysis of the first and second generation of antisense oligonucleotides in serum samples with the use of ultra high performance liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry
    Autorzy:
    Anna Kaczmarkiewicz, Łukasz Nuckowski, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Talanta (rok: 2019, tom: 196, strony: 54-63), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.talanta.2018.12.023 - link do publikacji
  12. Application of ion pair chromatography coupled with mass spectrometry to assess antisense oligonucleotide concentrations in living cells
    Autorzy:
    Sylwia Studzińska, Krzysztof Sobczak, Piotr Cywoniuk
    Czasopismo:
    Analyst (rok: 2019, tom: 144, strony: 622-633), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c8an01603h - link do publikacji
  13. Poly(ionic liquid)s as new adsorbents in dispersive micro-solid phase extraction of unmodified and modified oligonucleotides
    Autorzy:
    Łukasz Nuckowski, Ewa Zalesińska, Krzysztof Dzieszkowski, Zbigniew Rafiński, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Talanta (rok: 2021, tom: 221, strony: 121662), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.talanta.2020.121662 - link do publikacji
  14. Zastosowanie cieczy jonowych jako modyfikatorów fazy ruchomej w chromatografii cieczowej
    Autorzy:
    Anna Kilanowska, Judyta Zielak, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Wiadomości Chemiczne (rok: 2020, tom: 74 (7-8), strony: 507-525), Wydawca: Polskie Towarzystwo Chemiczne
    Status:
    Opublikowana
  15. Development of SPE method for the extraction of phosphorothioate oligonucleotides from serum samples
    Autorzy:
    Łukasz Nuckowski, Anna Kaczmarkiewicz, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Bioanalysis (rok: 2018, tom: 10 (20), strony: 1757-6180), Wydawca: Future Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.4155/bio-2018-0166 - link do publikacji
  16. Synthesis and application of stationary phase for DNA affinity chromatographic analysis of unmodified and antisense oligonucleotide
    Autorzy:
    Sylwia Studzińska, Ewelina Zawadzka, Szymon Bocian, Michał Szumski
    Czasopismo:
    Analytical and Bioanalytical Chemistry (rok: 2021, tom: 413, strony: 5109–5119), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00216-021-03473-7 - link do publikacji
  17. Analiza oligonukleotydów antysensownych pierwszej i drugiej generacji za pomocą chromatografii par jonowych
    Autorzy:
    Anna Kaczmarkiewicz, Łukasz Nuckowski, Sylwia Studzińska, Bogusław Buszewski
    Czasopismo:
    Analityka (rok: 2019, tom: 2, strony: 45393), Wydawca: Malamut
    Status:
    Opublikowana
  18. Analysis of microRNA and modified oligonucleotides with the use of ultra high performance liquid chromatography coupled with mass spectrometry
    Autorzy:
    Sylwia Studzińska, Bogusław Buszewski
    Czasopismo:
    Journal of Chromatography A (rok: 2018, tom: 1554, strony: 71-80), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.chroma.2018.04.037 - link do publikacji
  19. Application of Magnetic Nanoparticles Coated with Crosslinked Zwitterionic Poly(ionic liquid)s for the Extraction of Oligonucleotides
    Autorzy:
    Łukasz Nuckowski, Krzysztof Dzieszkowski, Zbigniew Rafiński, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Materials (rok: 2021, tom: 14 (12), strony: 3146), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ma14123146 - link do publikacji
  20. Application of hydrophilic interaction liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry for the retention and sensitivity studies of antisense oligonucleotides
    Autorzy:
    Anna Kilanowska, Bogusław Buszewski, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    Journal of Chromatography A (rok: 2020, tom: 1622, strony: 461100), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.chroma.2020.461100 - link do publikacji
  21. In vivo and in vitro studies of antisense oligonucleotides - a review
    Autorzy:
    Anna Kilanowska, Sylwia Studzińska
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2020, tom: 10, strony: 34501-34516), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/d0ra04978f - link do publikacji
  1. Analityka oligonukleotydów antysensownych
    Autorzy:
    Sylwia Studzińska, Anna Kilanowska, Łukasz Nuckowski, Bogusław Buszewski
    Książka:
    Bioanalityka w nauce i życiu (rok: 2020, tom: 1, strony: 57-71), Wydawca: PWN
    Status:
    Opublikowana