Projekty finansowane przez NCN
Opracowanie bazy danych do identyfikacji bakterii z rodzaju Streptococcus i Enterococcus z użyciem nowatorskiej techniki opartej o sekwencjonowanie nowej generacji regionu 16S-23S rRNA.
2016/21/N/NZ6/00981
Słowa kluczowe:
Streptococcus Entercoccus sekwencjonowanie nowej generacji region 16S-23S rRNA
Deskryptory:
- NZ6_4: Bakteriologia
- NZ5_5: Diagnostyka chorób człowieka
- NZ2_7: Bioinformatyka
Panel:
NZ6 - Immunologia i choroby zakaźne ludzi i zwierząt: odporność, choroby immunologiczne, immunoterapia, choroby zakaźne i inwazyjne
Jednostka realizująca:
Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii
woj. małopolskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 2
Konkurs: PRELUDIUM 11 - ogłoszony 2016-03-15
Przyznana kwota: 99 960 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2017-04-07
Zakończenie projektu: 2019-10-06
Planowany czas trwania projektu: 30 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (4)
- Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (5)
- Publikacje książkowe (1)
- Development and Validation of a Reference Data Set for Assigning Staphylococcus Species Based on Next-Generation Sequencing of the 16S-23S rRNA RegionAutorzy:Maja Kosecka-Strojek, Artur J. Sabat, Viktoria Akkerboom, Karsten Becker, Evert van Zanten, Guido Wisselink, Jacek Miedzobrodzki, Anna M. D. (Mirjam) Kooistra-Smid and Alexander W. FriedrichCzasopismo:Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (rok: 2019, tom: 9, strony: Article 278), Wydawca: Frontiers Media S.A.Status:OpublikowanaDoi:10.3389/fcimb.2019.00278 - link do publikacji
- Development of a reference data set for assigning Streptococcus and Enterococcus species based on next generation sequencing of the 16S-23S rRNA regionAutorzy:Maja Kosecka-Strojek, Artur J. Sabat, Viktoria Akkerboom, Anna M. D. (Mirjam) Kooistra-Smid, Jacek Miedzobrodzki, Alexander W. FriedrichCzasopismo:Antimicrobial Resistance & Infection Control (rok: 2019, tom: 8, strony: Article 178), Wydawca: Springer NatureStatus:OpublikowanaDoi:10.1186/s13756-019-0622-3 - link do publikacji
- Emergence of linezolid-resistant Staphylococcus epidermidis in the tertiary children's hospital in Cracow, PolandAutorzy:Maja Kosecka-Strojek, Ewa Sadowy, Iwona Gawryszewska, Joanna Klepacka, Tomasz Tomasik, Michal Michalik, Waleria Hryniewicz, Jacek MiedzobrodzkiCzasopismo:European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases (rok: 2020, tom: Online ahead, strony: Online ahead of print), Wydawca: Springer NatureStatus:OpublikowanaDoi:10.1007/s10096-020-03893-w - link do publikacji
- New Insight into Genotypic and Phenotypic Relatedness of Staphylococcus aureus Strains from Human Infections or Animal ReservoirsAutorzy:Klaudia Lisowska-Łysiak*, Maja Kosecka-Strojek*, Joanna Białecka, Andrzej Kasprowicz, Katarzyna Garbacz, Lidia Piechowicz, Vladimir Kmet, Vincenzo Savini, Jacek Międzobrodzki * equal contributionCzasopismo:Polish Journal of Microbiology (rok: 2019, tom: Vol. 68, No 1, strony: 93-104), Wydawca: Polish Society of MicrobiologistsStatus:OpublikowanaDoi:10.21307/pjm-2019-011 - link do publikacji
- The identification of Enterococcus spp. at the species level using rpoB and tuf genes sequencingAutorzy:Alicja Dziadowiec, Mariola Wolska, Maja Kosecka-StrojekKonferencja:XLVII Winter School Faculty of Biochemistry, Biophysics and Biotechnology Jagiellonian University - Molecules, Pathways, and Games (rok: 2020, ), Wydawca: Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego w KrakowieData:konferencja 08-12.02Status:Opublikowana
- Comparison of phenotypic and genetic methods in species Identification of clinically relevant bacteria from Streptococcus and Enterococcus generaAutorzy:Mariola Wolska, Dorota Żabicka, Ewa Sadowy, Jacek Międzobrodzki, Maja Kosecka-StrojekKonferencja:XLVII Winter School Faculty of Biochemistry, Biophysics and Biotechnology Jagiellonian University - Molecules, Pathways, and Games (rok: 2020, ), Wydawca: Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego w KrakowieData:konferencja 08-12.02Status:Opublikowana
- Development and validation of a reference data set for assigning Staphylococcus species based on next generation sequencing of the 16S-23S rRNA regionAutorzy:Maja Kosecka-Strojek, Artur J. Sabat, Viktoria Akkerboom, Karsten Becker, Evert van Zanten, Guido Wisselink, Jacek Miedzobrodzki, Mirjam Kooistra-Smid, Alexander W. FriedrichKonferencja:8th Congress of European Microbiologists - FEMS2019 (rok: 2019, ), Wydawca: FEMSData:konferencja 07.07-11.07Status:Opublikowana
- Identyfikacja istotnych klinicznie bakterii z rodzajów Streptococcus i Enterococcus z użyciem sekwencjonowania genów 16S rRNA, sodA, rpoB oraz tufAutorzy:Mariola Wolska, Dorota Żabicka, Ewa Sadowy, Jacek Międzobrodzki, Maja Kosecka-StrojekKonferencja:V Ogólnopolska Konferencja Doktorantów Nauk o Życiu – BioOpen (rok: 2019, ), Wydawca: Uniwersytet ŁódzkiData:konferencja 30.05-31.05Status:Opublikowana
- Application and comparison of Sanger sequencing and Vitek 2 systems for identification of clinically relevant species from Streptococcus and Enterococcus generaAutorzy:Mariola Wolska, Dorota Żabicka, Ewa Sadowy, Vincenzo Savini, Jacek Międzobrodzki, Maja Kosecka-StrojekKonferencja:FEMS ONLINE CONFERENCE ON MICROBIOLOGY 2020 (rok: 2020, ), Wydawca: Federation of European Microbiological SocietiesData:konferencja 28 – 31.10Status:Złożona
- Staphylococcal Ecology and EpidemiologyAutorzy:Maja Kosecka-Strojek, Aneta Buda, Jacek MiedzobrodzkiKsiążka:Pet-to-Man Travelling Staphylococci A World in Progress (rok: 2018, tom: n/a, strony: 45620), Wydawca: ElsevierStatus:Opublikowana