Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Produkcja nanoobiektów o geometrii niewystepujacej w przyrodzie

2016/20/W/NZ1/00095

Słowa kluczowe:

białka struktura białek białka klatkowe sztuczny kapsyd system dostarczania leków złamanie symetrii robotyka molekularna symetria białek

Deskryptory:

  • NZ3_1: Biologia komórki
  • NZ1_4: Biologia strukturalna
  • NZ1_9: Biotechnologia

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Jagielloński, Małopolskie Centrum Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Jonathan Heddle 

Liczba wykonawców projektu: 12

Konkurs: SYMFONIA 4 - ogłoszony 2015-12-15

Przyznana kwota: 6 596 736 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-11-07

Zakończenie projektu: 2021-04-06

Planowany czas trwania projektu: 53 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Aparat do gwałtownego zamrażania próbek dla Cryo-em. Za kwotę 250 000 PLN
  2. Duża wirówka z rotorami.
  3. Inkubator z wytrząsaniem i chłodzeniem.
  4. Inkubator z wytrząsarką.
  5. Komputer do obliczeń, modelowania molekularnego oraz analizy danych z cryo-EM.
  6. Komputer/laptop dla Kierownika Projektu.
  7. Licencja programu do modelowania molekularnego AMBER.
  8. Wortex.
  9. Zestaw do natywnej elektroforezy białek.
  10. Łaźnia wodna.
  11. Dysk wewnętrzny. Za kwotę 2 890 PLN
  12. FPLC. Za kwotę 500 000 PLN
  13. Laptopy dla asystentów naukowych.
  14. QCM. Za kwotę 200 000 PLN
  15. Serwer.
  16. System obrazowania. Za kwotę 170 590 PLN
  17. syntezator peptydów. Za kwotę 500 000 PLN
  18. Średnia, nablatowa wirówka laboratoryjna z rotorami.
  19. Lodówka laboratoryjna/szafa chłodnicza.
  20. Rotor R2. Za kwotę 3 888 PLN
  21. VitMaster do szybkiego zamrażania próbek. Za kwotę 45 608 PLN
  22. Wyposażenie do elektroforezy poziomej na żelach agarozowych.
  23. Drukarka 3D. Za kwotę 50 000 PLN
  24. Dysk zewnętrzny. Za kwotę 611 PLN
  25. Komputer przenośny (laptop).
  26. Mała nablatowa wirówka.
  27. Nóż diamentowy.
  28. Spektrofotometr (do pomiarów mikro objętości próbek). Za kwotę 40 000 PLN
  29. Wirówka z chłodzeniem.
  30. pH-metr.
  31. Elektroniczny pipetor.
  32. FPLC.
  33. Licencja na oprogramowanie do mikroskopu elektronowego.
  34. Mieszadła magnetyczne.
  35. Termocykler gradientowy wraz z termocyklerem służebnym (2 szt. w zestawie).
  36. Wyposażenie do elektroforezy PAGE.
  37. Zamrażarka niskotemperaturowa (-80 st. C).
  38. Zestawy komputerowe do modelowania molekularnego wraz z wyposażeniem.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (9)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Artificial Protein cages – Inspiration, construction, and observation.
    Autorzy:
    Stupka, I., Heddle, J. G.*
    Czasopismo:
    Current Opinion in Structural Biology (rok: 2020, tom: 64, strony: 66-73), Wydawca: Current Opinion in Structural Biology
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.sbi.2020.05.014 - link do publikacji
  2. Characterization of near-miss connectivity-invariant homogeneous convex polyhedral cages
    Autorzy:
    Piette, B.M.A.G., Kowalczyk, A., Heddle, J.G.
    Czasopismo:
    Proceedings of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences (rok: 2022, tom: 478, strony: 20210679), Wydawca: The Royal Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1098/rspa.2021.0679 - link do publikacji
  3. Chemically induced protein cage assembly with programmable opening and cargo release.
    Autorzy:
    Stupka, I., Azuma, Y., Biela, A., Imamura, M., Scheuring, S., Pyza, E., Woźnicka, O., Maskel, D. P., Heddle, J.G.
    Czasopismo:
    Science Advances (rok: 2022, tom: 8, strony: eabj9424), Wydawca: American Association for the Advancement of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1126/sciadv.abj9424 - link do publikacji
  4. Enzyme encapsulation by protein cages.
    Autorzy:
    Chakraborti, S., Lin, T.Y., Glatt, S. and Heddle, J.G.*
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2020, tom: 10(22), strony: 13293-13301), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C9RA10983H - link do publikacji
  5. Artificial Protein Cage Delivers Active Protein Cargos to the Cell Interior
    Autorzy:
    Naskalska, A., Borzęcka-Solarz, K., Różycki, J., Stupka, I., Bochenek, M., Pyza, E., Heddle, J. G
    Czasopismo:
    Biomacromolecules (rok: 2021, tom: 22, strony: 4146−4154), Wydawca: The American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.biomac.1c00630 - link do publikacji
  6. Artificial Protein Cage with Unusual Geometry and Regularly Embedded Gold Nanoparticles
    Autorzy:
    Majsterkiewicz, K., Biela, A.P., Maity, S., Sharma, M., Piette, B.M.A.G., Kowalczyk, A., Gaweł, S., Chakraborti, S., Roos, W.H., Heddle, J.G.
    Czasopismo:
    Nano Letters (rok: 2022, tom: 22, strony: 3187–3195), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.nanolett.1c04222 - link do publikacji
  7. Connectability of protein cages
    Autorzy:
    Majsterkiewicz, K., Azuma, Y. Heddle, J. G.*
    Czasopismo:
    Nanoscale Advances (rok: 2020, tom: 2 (6), strony: 2255–2264), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/D0NA00227E - link do publikacji
  8. An ultra-stable gold-coordinated protein cage displaying reversible assembly
    Autorzy:
    Malay Ali D., Miyazaki Naoyuki, Biela Artur, Chakraborti Soumyananda, Majsterkiewicz Karolina , Stupka Izabela, Kaplan Craig S., Kowalczyk Agnieszka , Piette Bernard M. A. G., Hochberg Georg K. A., Wu Di, Wróbel Tomasz, Fineberg Adam, Kushwah Manish S., Kelemen Mitja, Vavpetič Primož, Pelicon Primož, Kukura Philipp, Benesch Justin L. P., Iwasaki Kenji, Heddle Jonathan Dr hab. Jonathan Heddle
    Czasopismo:
    Nature (rok: 2019, tom: 569, strony: 438-442), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41586-019-1185-4 - link do publikacji
  9. Natural and artificial protein cages: design, structure and therapeutic applications
    Autorzy:
    Jonathan Gardiner Heddle, Soumyananda Chakraborti, Kenji Iwasaki
    Czasopismo:
    Current Opinion in Structural Biology (rok: 2017, tom: 43, strony: 148-155), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.sbi.2017.03.007 - link do publikacji
  1. Hendecagonal Near-miss Polyhedral Cages
    Autorzy:
    Jonathan G. Heddle, Agnieszka Kowalczyk, Bernard M. A. G. Piette
    Konferencja:
    Proceedings of Bridges 2019: Mathematics, Art, Music, Architecture, Education, Culture (rok: 2019, ), Wydawca: Tessellations Publishing
    Data:
    konferencja 43662
    Status:
    Opublikowana
  1. TRAPped Structures: Making Artificial Cages with a Ring Protein
    Autorzy:
    Jonathan G. Heddle
    Książka:
    Advances in Bioinspired and Biomedical Materials Volume 1 (rok: 2017, tom: Vol. 1252, strony: 45368), Wydawca: ACS Symposium Series, American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana