Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Szczegółowa analiza potencjalnych regulatorów transkrypcji z proteomu Pseudomonas aeruginosa zależnych od ParA/ParB z wykorzystaniem narzędzi biologii systemów.

2015/18/E/NZ2/00675

Słowa kluczowe:

regulator transkrypcji regulacja ekspresji genów sieć regulacyjna regulon ParA/ParB Pseudomonas aeruginosa biologia systemów

Deskryptory:

  • NZ2_1: Genetyka molekularna
  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
  • NZ2_9: Biologia systemowa

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Aneta Bartosik 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: SONATA BIS 5 - ogłoszony 2015-06-15

Przyznana kwota: 1 518 680 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2016-04-20

Zakończenie projektu: 2022-04-19

Planowany czas trwania projektu: 72 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Wielodetekcyjny czytnik płytek 6-384-dołkowych umożliwiający pomiar absorbancji, fluorescencji i luminescencji wraz z oprogramowaniem. Dodatkowo kompatybilna płytka do pomiaru mikroilości DNA lub RNA przy 260 nm.. Za kwotę 120 000 PLN
  2. Zamrażarka do ultra niskich temperatur (-80oC). Za kwotę 50 000 PLN
  3. Komputery z oprogramowaniem. Za kwotę 15 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (6)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (7)
  1. Genome sequence of Pseudomonas aeruginosa PAO1161, a PAO1 derivative with the ICEPae1161 integrative and conjugative element
    Autorzy:
    Adam Kawalek, Karolina Kotecka, Magdalena Modrzejewska, Jan Gawor, Grazyna Jagura-Burdzy and Aneta Agnieszka Bartosik
    Czasopismo:
    BMC Genomics (rok: 2020, tom: 21, strony: (2020) 21:14), Wydawca: BMC part of Springer Nature (BioMed Central Ltd.)
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12864-019-6378-6 - link do publikacji
  2. The Lrp/AsnC-Type Regulator PA2577 Controls the EamA-like Transporter Gene PA2576 in Pseudomonas aeruginosa
    Autorzy:
    Magdalena Modrzejewska, Adam Kawalek, Aneta Agnieszka Bartosik
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2021, tom: 2021, 22, 13340, strony: 13340), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms222413340 - link do publikacji
  3. The LysR-Type Transcriptional Regulator BsrA (PA2121) Controls Vital Metabolic Pathways in Pseudomonas aeruginosa
    Autorzy:
    Magdalena Modrzejewska,a Adam Kawalek,a Aneta Agnieszka Bartosika
    Czasopismo:
    mSystems (rok: 2021, tom: 6:e00015-21, strony: e00015-21), Wydawca: ASM
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1128/mSystems.00015-21 - link do publikacji
  4. The MarR-Type Regulator PA3458 Is Involved in Osmoadaptation Control in Pseudomonas aeruginosa
    Autorzy:
    Karolina Kotecka , Adam Kawalek , Kamil Kobylecki, Aneta Agnieszka Bartosik
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2021, tom: 2021, 22, 3982, strony: 3982), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms22083982 - link do publikacji
  5. Interaction of ArmZ with the DNA-Binding Domain of MexZ Induces Expression of mexXY Multidrug Efflux Pump Genes and Antimicrobial Resistance in Pseudomonas aeruginosa
    Autorzy:
    Adam Kawalek, Magdalena Modrzejewska, Bartlomiej Zieniuk, Aneta Agnieszka Bartosik, Grazyna Jagura-Burdzy
    Czasopismo:
    Antimicrobial Agents and Chemotherapy (rok: 2019, tom: 63, strony: 63:e01199-19), Wydawca: American Society for Microbiology
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1128/AAC.01199-19 - link do publikacji
  6. The AraC-Type Transcriptional Regulator GliR (PA3027) Activates Genes of Glycerolipid Metabolism in Pseudomonas aeruginosa
    Autorzy:
    Karolina Kotecka , Adam Kawalek , Kamil Kobylecki and Aneta Agnieszka Bartosik
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2021, tom: 2021, 22, 5066, strony: 5066), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms22105066 - link do publikacji
  1. Towards survival – logarithmic versus stationary phase studies on Pseudomonas aeruginosa
    Autorzy:
    BARTOSIK A.A., KOTECKA K., MODRZEJEWSKA M., KAWAŁEK A., JAGURA-BURDZY G.
    Konferencja:
    International Biennial Conference Pseudomonas 2019, Kuala Lumpur, Malaysia, 22-26 July 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: Pseudomonas 2019
    Data:
    konferencja 2019-07-22-26
    Status:
    Opublikowana
  2. Analysis of three putative transcriptional regulators PA1196, PA2121 and PA2577 from Pseudomonas aeruginosa proteome
    Autorzy:
    M. Modrzejewska, A.A. Bartosik
    Konferencja:
    7th Congress of European Microbiologists (FEMS), Valencia, Spain (rok: 2017, ), Wydawca: 7th Congress of European Microbiologists (FEMS)
    Data:
    konferencja 9-13 July 2017
    Status:
    Opublikowana
  3. Studies on PA2121 - a LysR-type transcriptional regulator from Pseudomonas aeruginosa
    Autorzy:
    MODRZEJEWSKA M., KAWAŁEK A., BARTOSIK A.A.
    Konferencja:
    8th Congress of European Microbiologists, Glasgow, Scotland (rok: 2019, ), Wydawca: FEMS
    Data:
    konferencja 2019-07-07-11
    Status:
    Opublikowana
  4. Studies on PA3027 – the AraC family transcriptional activator
    Autorzy:
    KOTECKA K., KAWAŁEK A., BARTOSIK A.A.
    Konferencja:
    International Biennial Conference Pseudomonas 2019, Kuala Lumpur, Malaysia, 22-26 July 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: Pseudomonas 2019
    Data:
    konferencja 2019-07-22-26
    Status:
    Opublikowana
  5. Characterization of transcriptional regulator PA3458 from Pseudomonas aeruginosa
    Autorzy:
    KOTECKA K., KAWAŁEK A., BARTOSIK A.A.
    Konferencja:
    8th Congress of European Microbiologists (FEMS), Glasgow, Scotland, 7-11 July 2019 (rok: 2019, ), Wydawca: FEMS
    Data:
    konferencja 2019-07-07-11
    Status:
    Opublikowana
  6. Functional characterization of TetR-like transcriptional regulator PA3973 from Pseudomonas aeruginosa
    Autorzy:
    Kotecka Karolina, Kawalek Adam, Gawor Jan, Zuchniewicz Karolina, Gromadka Robert, Bartosik Aneta Agnieszka
    Konferencja:
    International Biennial Conference Pseudomonas 2022, Atlanta, USA (rok: 2022, ), Wydawca: Pseudomonas 2022
    Data:
    konferencja 2022-04-18_23
    Status:
    Opublikowana
  7. Preliminary functional characterization of putative transcriptional regulators PA3027, PA3458 and PA3973 from Pseudomonas aeruginosa
    Autorzy:
    K. Kotecka, A.A. Bartosik
    Konferencja:
    7th Congress of European Microbiologists (FEMS),Valencia, Spain (rok: 2017, ), Wydawca: 7th Congress of European Microbiologists (FEMS)
    Data:
    konferencja 9-13 July 2017
    Status:
    Opublikowana