A GROMOS Force Field for Furanose-Based Carbohydrates
Autorzy:
Nester, K., Gaweda, K., Plazinski, W.
Czasopismo:
Journal of Chemical Theory and Computation (rok: 2019, tom: 15, strony: 1168-1186), Wydawca: American Chemical Society
Comparison of Carbohydrate Force Fields in Molecular Dynamics Simulations of Protein–Carbohydrate Complexes
Autorzy:
Plazinska, A., Plazinski, W.
Czasopismo:
Journal of Chemical Theory and Computation (rok: 2021, tom: 17, strony: 2575–2585), Wydawca: American Chemical Society
Conformations of saturated five-membered heterocycles evaluated by MP2 calculations
Autorzy:
Gaweda, K., Plazinska, A., Plazinski, W.
Czasopismo:
Chemistry of Heterocyclic Compounds (rok: 2020, tom: 56, strony: 1599–1604), Wydawca: Springer
Extension of the GROMOS 56a6CARBO/CARBO_R Force Field for Charged, Protonated and Esterified Uronates
Autorzy:
Karina Panczyk, Karolina Gaweda, Mateusz Drach, Wojciech Plazinski
Czasopismo:
Journal of Physical Chemistry B (rok: 2018, tom: 122, strony: 3696-3710), Wydawca: American Chemical Society
Tautomers of N-acetyl-D-allosamine: an NMR and computational chemistry study
Autorzy:
W. Plazinski, M.U. Roslund, E. Säwén, O. Engström, P. Tähtinen, G. Widmalm
Czasopismo:
Organic & Biomolecular Chemistry (rok: 2021, tom: 19, strony: 7190-7201), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
The endo- and exo-Anomeric Effects in Furanosides. A Computational Study
Autorzy:
Gaweda, K., Plazinski, W.
Czasopismo:
European Journal of Organic Chemistry (rok: 2020, tom: 6, strony: 674-679), Wydawca: Royal Chemical Society
Efficient sampling of high-energy states by machine learning force fields
Autorzy:
Plazinski, W., Plazinska, A., Brzyska, A.
Czasopismo:
Physical Chemistry Chemical Physics (rok: 2020, tom: 22, strony: 14364-14374), Wydawca: Royal Chemical Society
Molecular Structure of Cefuroxime Axetil Complexes with α-, β-, γ-, and 2-Hydroxypropyl-β-Cyclodextrins: Molecular Simulations and Raman Spectroscopic and Imaging Studies
Autorzy:
B. Gieroba, G. Kalisz, A. Sroka-Bartnicka, A. Płazińska, W. Płaziński, M. Starek, M. Dąbrowska
Czasopismo:
International Joural of Molecular Sciences (rok: 2021, tom: 22 (10), strony: 5238), Wydawca: MDPI
Pyranose ring puckering in aldopentoses, ketohexoses and deoxyaldohexoses. A molecular dynamics study
Autorzy:
Panczyk, K., Plazinski, W.
Czasopismo:
Carbohydrate Research (rok: 2018, tom: 455, strony: 67-70), Wydawca: Elsevier
Pyranose ring conformations in mono- and oligosaccharides: A combined MD and DFT approach
Autorzy:
Gaweda, K., Plazinski, W.
Czasopismo:
Physical Chemistry Chemical Physics (rok: 2017, tom: 19, strony: 20760-20772), Wydawca: Royal Society of Chemistry
Relation between the NMR data and the pseudorotational free energy profile for oxolane
Autorzy:
Plazinski, W.; Gaweda, K.; Plazinska, A.
Czasopismo:
Journal of Theoretical and Computational Chemistry (rok: 2019, tom: 18, strony: 1950012), Wydawca: World Scientific
The systematic influence of solvent on the conformational features of furanosides
Autorzy:
Gaweda, K., Plazinski, W.
Czasopismo:
Organic and Biomolecular Chemistry (rok: 2019, tom: 17, strony: 2479-2485), Wydawca: Royal Chemical Society
Conformational properties of inulin, levan and arabinan studied by molecular dynamics simulations
Autorzy:
Nester, K., Plazinski, W.
Czasopismo:
Carbohydrate Polymers (rok: 2020, tom: 240, strony: 116266-116278), Wydawca: Elsevier
Deciphering the conformational preferences of furanosides. A molecular dynamics study
Autorzy:
Nester, K., Plazinski, W.
Czasopismo:
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics (rok: 2020, tom: 38, strony: 3359-3370), Wydawca: Taylor and Francis
Tautomeric and epimeric equilibria of aldo- and ketohexoses studied by the MD simulations and QM calculations
Autorzy:
Gaweda, K., Plazinski, W.
Czasopismo:
Carbohydrate Research (rok: 2019, tom: 474, strony: 45519), Wydawca: Elsevier