Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Rola antybakteryjnego białka chemeryny w patofizjologii naskórka.

2014/12/W/NZ6/00454

Słowa kluczowe:

czynniki antybakteryjne skóra nabłonek

Deskryptory:

  • NZ6_4: Bakteriologia
  • NZ4_4: Patofizjologia ogólna

Panel:

NZ6 - Immunologia i choroby zakaźne ludzi i zwierząt: odporność, choroby immunologiczne, immunoterapia, choroby zakaźne i inwazyjne

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii

woj. małopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Joanna Cichy 

Liczba wykonawców projektu: 18

Konkurs: SYMFONIA 2 - ogłoszony 2013-12-16

Przyznana kwota: 6 589 560 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2014-11-21

Zakończenie projektu: 2021-02-20

Planowany czas trwania projektu: 75 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Aparat do kawitacji.
  2. Pompa strzykawkowe i robot do nanoszenia próbek.. Za kwotę 60 000 PLN
  3. Stacja robocza i rozbudowa cytometru o nowe lasery.
  4. System do detekcji produktów PCR w czasie rzeczywistym.. Za kwotę 120 000 PLN
  5. Zamrażarka. Za kwotę 849 PLN
  6. komputer stacjonarny - 2 szt..
  7. komputer stacjonarny z monitorem LCD.
  8. Komputer stacjonarny. Za kwotę 3 676 PLN
  9. Komputer stacjonarny.
  10. Platforma PCR do analiz w czasie rzeczywistym.. Za kwotę 180 000 PLN
  11. Przyrząd do mierzenia wilgotości skóry.. Za kwotę 75 000 PLN
  12. System do analizy obrazów.. Za kwotę 170 000 PLN
  13. Wielodetekcyjny czytnik mikropłytkowy. Za kwotę 100 000 PLN
  14. Mikroskop biologiczny z kamerą cyfrową. Za kwotę 16 728 PLN
  15. Rozbudowa stacji roboczej (hardware i software).
  16. Stacja robocza i podajnik płytek do cytometru przepływowego LSRII.. Za kwotę 140 000 PLN
  17. dwustanowiskowa komora laminarna.
  18. Łaźnia wodna. Za kwotę 5 227 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (44)
  1. Gravity-driven microfluidic assay for digital enumeration of bacteria and for antibiotic susceptibility testing
    Autorzy:
    Yu-Ting Kao, Tomasz S. Kaminski, Witold Postek, Jan Guzowski, Karol Makuch, Artur Ruszczak, Felix von Stetten, Roland Zengerle, Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    Lab on a Chip (rok: 2020, tom: 20, strony: 54-63), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C9LC00684B - link do publikacji
  2. Architecture of antimicrobial skin defense.
    Autorzy:
    Kwiecien K, Zegar A, Jung J, Brzoza P, Kwitniewski M, Godlewska U, Grygier B, Kwiecinska P, Morytko A, Cichy J.
    Czasopismo:
    Cytokine & Growth Factor Reviews (rok: 2019, tom: 49, strony: 70-84), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.cytogfr.2019.08.001 - link do publikacji
  3. Grooved step emulsification systems optimize throughput of passive generation of monodisperse emulsions
    Autorzy:
    Adam S. Opalski, Karol Makuch, Yu-Kai Lai, Ladislav Derzsi and Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    Lab on a Chip (rok: 2019, tom: 19, strony: 1183-1192), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C8LC01096J - link do publikacji
  4. Bacteria Modify Their Sensitivity to Chemerin-Derived Peptides by Hindering Peptide Association With the Cell Surface and Peptide Oxidation
    Autorzy:
    Godlewska U, Bilska B, Majewski P, Pyza E, Zabel BA, Cichy J.
    Czasopismo:
    Frontiers in Microbiology (rok: 2020, tom: 11, strony: 1819 (1-11)), Wydawca: Frontiers
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fmicb.2020.01819 - link do publikacji
  5. The methylation status of the chemerin promoter region located from - 252 to + 258 bp regulates constitutive but not acute-phase cytokine-inducible chemerin expression levels
    Autorzy:
    Kwiecien K, Brzoza P, Bak M, Majewski P, Skulimowska I, Bednarczyk K, Cichy J, Kwitniewski M.
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2020, tom: 10, strony: 13702 (1-12)), Wydawca: Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-020-70625-7 - link do publikacji
  6. A passive microfluidic system based on step emulsification allows the generation of libraries of nanoliter-sized droplets from microliter droplets of varying and known concentrations of a sample
    Autorzy:
    W. Postek, T. Kamiński, P. Garstecki
    Czasopismo:
    Lab on a Chip (rok: 2017, tom: 17, strony: 1323-1331), Wydawca: ROYAL SOC CHEMISTRY
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C7LC00014F - link do publikacji
  7. A precise and accurate microfluidic droplet dilutor
    Autorzy:
    Witold Postek, Tomasz S Kaminski and Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    Analyst (rok: 2017, tom: 142, strony: 2901-2911), Wydawca: ROYAL SOC CHEMISTRY
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C7AN00679A - link do publikacji
  8. Dodecylresorufin (C12R) outperforms resorufin in micro-droplet bacterial assays
    Autorzy:
    O. Scheler, T.S. Kaminski, A. Ruszczak and P. Garstecki
    Czasopismo:
    Applied Materials and Interfaces (rok: 2016, tom: 8, strony: 11318-11325), Wydawca: AMER CHEMICAL SOC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acsami.6b02360 - link do publikacji
  9. Microfluidic screening of antibiotic susceptibility at a single-cell level shows inoculum effect of cefotaxime in E. coli
    Autorzy:
    Witold Postek, Pawel Gargulinski, Ott Scheler, Tomasz S. Kaminski and Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    Lab on a Chip (rok: 2018, tom: 18, strony: 3668–3677), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C8LC00916C - link do publikacji
  10. Dodecylresorufin (C12R) outperforms resorufin in micro-droplet bacterial assays
    Autorzy:
    O. Scheler, T.S. Kaminski, A. Ruszczak and P. Garstecki
    Czasopismo:
    Applied Materials and Interfaces (rok: 2016, tom: 8, strony: 11318-11325), Wydawca: AMER CHEMICAL SOC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acsami.6b02360 - link do publikacji
  11. Antimicrobial and attractant roles for chemerin in the oral cavity during inflammatory gum disease
    Autorzy:
    U.Godlewska, P.Brzoza, A.Sroka, P.Majewski, H.Jentsch, M.Eckert, S.Eick, J.Potempa, B.Zabel and J.Cichy
    Czasopismo:
    Frontiers in Immunology (rok: 2017, tom: 0,578472222222222, strony: 45668), Wydawca: Frontiers
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fimmu.2017.00353 - link do publikacji
  12. Controlled droplet microfluidic systems for multistep chemical and biological assays
    Autorzy:
    Tomasz S Kaminski and Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    Chemical Society Reviews (rok: 2017, tom: 46, strony: 6210 - 6226), Wydawca: ROYALSOC CHEMISTRY
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C5CS00717H - link do publikacji
  13. Metagenomic Studies in Inflammatory Skin Diseases
    Autorzy:
    Godlewska U, Brzoza P, Kwiecień K, Kwitniewski M, Cichy J.
    Czasopismo:
    Current Microbiology (rok: 2020, tom: 77, strony: 3201–3212), Wydawca: Springer nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00284-020-02163-4 - link do publikacji
  14. A method for simultaneous polishing and hydrophobization of polycarbonate for microfluidic applications
    Autorzy:
    Dominika Ogończyk, Paweł Jankowski, Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    Polymers (rok: 2020, tom: 12(11), strony: 2490), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/polym12112490 - link do publikacji
  15. Split or slip - passive generation of monodisperse double emulsions with cores of varying viscosity in microfluidic tandem step emulsification system
    Autorzy:
    Adam S. Opalski, Karol Makuch, Ladislav Derzsi and Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2020, tom: 10, strony: 23058 - 23065), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/D0RA03007D - link do publikacji
  16. Antimicrobial and attractant roles for chemerin in the oral cavity during inflammatory gum disease
    Autorzy:
    U.Godlewska, P.Brzoza, A.Sroka, P.Majewski, H.Jentsch, M.Eckert, S.Eick, J.Potempa, B.Zabel and J.Cichy
    Czasopismo:
    Frontiers in Immunology (rok: 2017, tom: 0,578472222222222, strony: 45668), Wydawca: Frontiers
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fimmu.2017.00353 - link do publikacji
  17. Passive and parallel microfluidic formation of droplet interface bilayers (DIBs) for measurement of leakage of small molecules through artificial phospholipid membranes
    Autorzy:
    Magdalena A. Czekalska, Tomasz S. Kaminski, Karol Makuch and Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    Sensors and Actuators: B Chemical (rok: 2019, tom: 286, strony: 258-265), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.snb.2019.01.143 - link do publikacji
  18. The antimicrobial activity of chemerin-derived peptide p4 requires oxidative conditions.
    Autorzy:
    Urszula Godlewska, Bernadetta Bilska, Aneta Zegar, Piotr Brzoza, Arkadiusz Borek, Krzysztof Murzyn, Oliwia Bochenska, Agnieszka Morytko, Patryk Kuleta, Andrzej Kozik, Elzbieta Pyza, Artur Osyczka, Brian A Zabel and Joanna Cichy
    Czasopismo:
    Journal of Biological Chemistry (rok: 2019, tom: 294, strony: 1267-1278), Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Privacy Policy
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1074/jbc.RA118.005495 - link do publikacji
  19. Direct droplet digital PCR (dddPCR) for species specific, accurate and precise quantification of bacteria in mixed samples
    Autorzy:
    Natalia Pacocha, Ott Scheler, Mikołaj Marcin Nowak, Ladislav Derzsi, Joanna Cichy, Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    Analytical Methods (rok: 2019, tom: 11, strony: 5730-5735), Wydawca: ROYAL SOC CHEMISTRY
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C9AY01874C - link do publikacji
  20. Non-wetting droplets in capillaries of circular cross-section: scaling function
    Autorzy:
    Karol Makuch, Jean-Baptiste Gorce, and Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    Physics of Fluids (rok: 2019, tom: 31, strony: 43102), Wydawca: AIP Publishing
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1063/1.5087722 - link do publikacji
  21. Redox Active Antimicrobial Peptides in Controlling Growth of Microorganisms at Body Barriers
    Autorzy:
    Brzoza, P.; Godlewska, U.; Borek, A.; Morytko, A.; Zegar, A.; Kwiecinska, P.; Zabel, B.A.; Osyczka, A.; Kwitniewski, M.; Cichy, J.
    Czasopismo:
    Antioxidants (rok: 2021, tom: 10(3), strony: 446 (1-18)), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ - link do publikacji
  22. Expression of antimicrobial peptide genes oscillates along day/night rhythm protecting mice skin from bacteria
    Autorzy:
    Bilska B, Zegar A, Slominski AT, Kleszczyński K, Cichy J, Pyza E.
    Czasopismo:
    Experimental Dermatology (rok: 2020, ), Wydawca: John Wiley & Sons Ltd
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1111/exd.14229 - link do publikacji
  23. Oscillating droplet trains in microfluidic networks and their suppression in blood flow
    Autorzy:
    Bartosz Grzybowski, Olgierd Cybulski, Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    Nature Physics (rok: 2019, tom: 15, strony: 706-713), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41567-019-0486-8 - link do publikacji
  24. The role of chemerin and its antibacterial derivatives in maintaining epithelial barrier function
    Autorzy:
    Godlewska U, Zegar A, Cichy J.
    Czasopismo:
    Postepy Biochemii (rok: 2020, tom: 66 (2), strony: 151-159), Wydawca: Polskie Towarzystwo Biochemiczne
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.18388/pb.2020_323 - link do publikacji
  25. Antibiograms in five pipetting steps: precise dilution assays in sub-microliter volumes with a conventional pipette
    Autorzy:
    L. Derzsi, T.S. Kaminski and P. Garstecki
    Czasopismo:
    Lab on a Chip (rok: 2016, tom: 16, strony: 893-901), Wydawca: ROYAL SOC CHEMISTRY
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C5LC01151E - link do publikacji
  26. The expression and regulation of chemerin in the epidermis.
    Autorzy:
    Banas M, Zegar A, Kwitniewski M, Zabieglo K, Marczynska J, Kapinska-Mrowiecka M, LaJevic M, Zabel BA, Cichy J.
    Czasopismo:
    PLos One (rok: 2015, tom: 10(2):e011783, strony: 45676), Wydawca: Plos.org
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0117830 - link do publikacji
  27. Optimized droplet digital CFU assay (ddCFU) provides precise quantification of bacteria over dynamic range of 6 logs and beyond
    Autorzy:
    O. Scheler, N. Pacocha, P. R. Debski, A. Ruszczak, T. S. Kaminski and P. Garstecki
    Czasopismo:
    Lab on a Chip (rok: 2017, tom: 17, strony: 1980 - 1987), Wydawca: ROYAL SOC CHEMISTRY
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c7lc00206h - link do publikacji
  28. Droplet Microfluidics as a Tool for the Generation of Granular Matters and Functional Emulsions
    Autorzy:
    Adam S. Opalski, Tomasz S. Kaminski, Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    KONA Powder and Particle Journal (rok: 2018, tom: 45733, strony: 45679), Wydawca: Hosokawa Powder Technology Foundation
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.14356/kona.2019004 - link do publikacji
  29. The antimicrobial activity of chemerin-derived peptide p4 requires oxidative conditions.
    Autorzy:
    Urszula Godlewska, Bernadetta Bilska, Aneta Zegar, Piotr Brzoza, Arkadiusz Borek, Krzysztof Murzyn, Oliwia Bochenska, Agnieszka Morytko, Patryk Kuleta, Andrzej Kozik, Elzbieta Pyza, Artur Osyczka, Brian A Zabel and Joanna Cichy
    Czasopismo:
    Journal of Biological Chemistry (rok: 2019, tom: 294, strony: 1267-1278), Wydawca: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Privacy Policy
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1074/jbc.RA118.005495 - link do publikacji
  30. Passive and parallel microfluidic formation of droplet interface bilayers (DIBs) for measurement of leakage of small molecules through artificial phospholipid membranes
    Autorzy:
    Magdalena A. Czekalska, Tomasz S. Kaminski, Karol Makuch and Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    Sensors and Actuators: B Chemical (rok: 2019, tom: 286, strony: 258-265), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.snb.2019.01.143 - link do publikacji
  31. Direct droplet digital PCR (dddPCR) for species specific, accurate and precise quantification of bacteria in mixed samples
    Autorzy:
    Natalia Pacocha, Ott Scheler, Mikołaj Marcin Nowak, Ladislav Derzsi, Joanna Cichy, Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    Analytical Methods (rok: 2019, tom: 11, strony: 5730-5735), Wydawca: ROYAL SOC CHEMISTRY
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C9AY01874C - link do publikacji
  32. High-Throughput Monitoring of Bacterial Cell Density in Nanoliter Droplets: Label-Free Detection of Unmodified Gram-Positive and Gram-Negative Bacteria
    Autorzy:
    Natalia Pacocha, Jakub Bogusławski, Michał Horka, Karol Makuch,Kamil Liżewski, Maciej Wojtkowski, Piotr Garsteck
    Czasopismo:
    Analytical Chemistr (rok: 2021, tom: 93, 2, strony: 843–850), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.analchem.0c03408 - link do publikacji
  33. Droplet-based digital antibiotic susceptibility screen reveals single-cell clonal heteroresistance in an isogenic bacterial population
    Autorzy:
    Ott Scheler, Karol Makuch, Pawel R Debski, Michal Horka, Artur Ruszczak, Natalia Pacocha, Krzysztof Sozanski, Olli-Pekka Smolander, Witold Postek, Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2020, tom: 10, strony: 3282), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-020-60381-z - link do publikacji
  34. Droplet microfluidics for microbiology: techniques, applications and challenges
    Autorzy:
    T.S. Kaminski, O. Scheler and P. Garstecki
    Czasopismo:
    Lab on a Chip (rok: 2016, tom: 16, strony: 2168-2187), Wydawca: ROYAL SOC CHEMISTRY
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C6LC00367B - link do publikacji
  35. The expression and regulation of chemerin in the epidermis.
    Autorzy:
    Banas M, Zegar A, Kwitniewski M, Zabieglo K, Marczynska J, Kapinska-Mrowiecka M, LaJevic M, Zabel BA, Cichy J.
    Czasopismo:
    PLos One (rok: 2015, tom: 10(2):e011783, strony: 45676), Wydawca: Plos.org
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0117830 - link do publikacji
  36. Gravity-driven microfluidic assay for digital enumeration of bacteria and for antibiotic susceptibility testing
    Autorzy:
    Yu-Ting Kao, Tomasz S. Kaminski, Witold Postek, Jan Guzowski, Karol Makuch, Artur Ruszczak, Felix von Stetten, Roland Zengerle, Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    Lab on a Chip (rok: 2020, tom: 20, strony: 54-63), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C9LC00684B - link do publikacji
  37. A precise and accurate microfluidic droplet dilutor
    Autorzy:
    Witold Postek, Tomasz S Kaminski and Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    Analyst (rok: 2017, tom: 142, strony: 2901-2911), Wydawca: ROYAL SOC CHEMISTRY
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C7AN00679A - link do publikacji
  38. Chemerin-derived peptide Val66-Pro85 is effective in limiting methicillin-resistant S. aureus skin infection.
    Autorzy:
    Aneta Zegar, Urszula Godlewska, Dorota Kozłowska-Chmielewska, Pawel Majewski, Brian A Zabel, Joanna Cichy
    Czasopismo:
    Frontiers in Microbiology (rok: 2021, tom: 12, strony: 45665), Wydawca: Frontiers Media SA
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3389/fmicb.2021.742610 - link do publikacji
  39. Controlled droplet microfluidic systems for multistep chemical and biological assays
    Autorzy:
    Tomasz S Kaminski and Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    Chemical Society Reviews (rok: 2017, tom: 46, strony: 6210 - 6226), Wydawca: ROYALSOC CHEMISTRY
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C5CS00717H - link do publikacji
  40. Antimicrobial Properties of a Peptide Derived from the Male Fertility Factor kl2 Protein of Drosophila melanogaster
    Autorzy:
    Bilska, B.; Godlewska, U.; Damulewicz, M.; Murzyn, K.; Kwitniewski, M.; Cichy, J.; Pyza, E.
    Czasopismo:
    Current Issues in Molecular Biology (rok: 2022, tom: 44, strony: 1169-1181), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/cimb44030076 - link do publikacji
  41. Recent developments of microfluidics as a tool for biotechnology and microbiology
    Autorzy:
    Ott Scheler, Witold Postek, Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    Current Opinion in Biotechnology (rok: 2019, tom: 55, strony: 60-67), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.copbio.2018.08.004 - link do publikacji
  42. Split or slip - passive generation of monodisperse double emulsions with cores of varying viscosity in microfluidic tandem step emulsification system
    Autorzy:
    Adam S. Opalski, Karol Makuch, Ladislav Derzsi and Piotr Garstecki
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2020, tom: 10, strony: 23058 - 23065), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/D0RA03007D - link do publikacji
  43. Antibiograms in five pipetting steps: precise dilution assays in sub-microliter volumes with a conventional pipette
    Autorzy:
    L. Derzsi, T.S. Kaminski and P. Garstecki
    Czasopismo:
    Lab on a Chip (rok: 2016, tom: 16, strony: 893-901), Wydawca: ROYAL SOC CHEMISTRY
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C5LC01151E - link do publikacji
  44. A passive microfluidic system based on step emulsification allows the generation of libraries of nanoliter-sized droplets from microliter droplets of varying and known concentrations of a sample
    Autorzy:
    W. Postek, T. Kamiński, P. Garstecki
    Czasopismo:
    Lab on a Chip (rok: 2017, tom: 17, strony: 1323-1331), Wydawca: ROYAL SOC CHEMISTRY
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C7LC00014F - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy