Projekty finansowane przez NCN
Powstawanie niejednorodności przestrzennych na błonie komórkowej i ich znaczenie w przekaźnictwie sygnału
2013/09/N/NZ2/02631
Słowa kluczowe:
białka błonowe klasteryzacja receptorów reakcje ograniczone dyfuzją modelowanie oparte na regułach symulacje stochastyczne
Deskryptory:
- NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
- NZ3_7: Przekaźnictwo sygnału
- ST6_12: Obliczenia naukowe, narzędzia modelowania i symulacji
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN
woj. mazowieckie
Konkurs: PRELUDIUM 5 - ogłoszony 2013-03-15
Przyznana kwota: 93 600 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2014-05-05
Zakończenie projektu: 2017-03-04
Planowany czas trwania projektu: 34 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (4)
- Effective reaction rates for diffusion-limited reaction cyclesAutorzy:Paweł Nałęcz-Jawecki, Paulina Szymańska, Marek Kochańczyk, Jacek Miękisz, Tomasz LipniackiCzasopismo:Journal of Chemical Physics (rok: 2015, tom: 143, strony: 215102), Wydawca: American Institute of PhysicsStatus:OpublikowanaDoi:10.1063/1.4936131 - link do publikacji
- Effective reaction rates in diffusion-limited phosphorylation–dephosphorylation cyclesAutorzy:Paulina Szymańska, Marek Kochańczyk, Jacek Miększ, Tomasz LipniackiCzasopismo:Physical Review E (rok: 2015, tom: 91, strony: 22702), Wydawca: American Physical SocietyStatus:OpublikowanaDoi:10.1103/PhysRevE.91.022702 - link do publikacji
- SPATKIN: a simulator for spatial rule-based modeling of biomolecular site dynamicsAutorzy:Marek Kochańczyk, William S. Hlavacek, Tomasz LipniackiCzasopismo:Bioinformatics (rok: 2017, tom: 33, strony: 3667–3669), Wydawca: Oxford University PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/bioinformatics/btx456 - link do publikacji
- Relaxation oscillations and hierarchy of feedbacks in MAPK signalingAutorzy:Marek Kochańczyk, Paweł Kocieniewski, Emilia Kozłowska, Joanna Jaruszewicz-Błońska, Breanne Sparta Michael Pargett, John G. Albeck, William S. Hlavacek, Tomasz LipniackiCzasopismo:Scientific Reports (rok: 2017, tom: 7, strony: 38244), Wydawca: Nature Publishing GroupStatus:OpublikowanaDoi:10.1038/srep38244 - link do publikacji