Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Metody bioinformatyczne integracji wysokoprzepustowych danych biologii molekularnej dla analizy radiowrażliwości.

2013/08/M/ST6/00924

Słowa kluczowe:

Radiowrażliwość bioinformatyka integratywna

Deskryptory:

  • ST6_11: Uczenie maszynowe, statystyczne przetwarzanie danych i zastosowanie w przetwarzaniu sygnałów
  • ST6_13: Bioinformatyka, bioobliczenia, obliczenia DNA i molekularne

Panel:

ST6 - Informatyka i technologie informacyjne: technologie i systemy informacyjne, informatyka, obliczenia naukowe, systemy inteligentne

Jednostka realizująca:

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

woj. śląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Joanna Polańska 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: HARMONIA 4 - ogłoszony 2012-12-15

Przyznana kwota: 613 857 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2013-09-13

Zakończenie projektu: 2016-11-12

Planowany czas trwania projektu: 38 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (12)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (33)
  • Publikacje książkowe (7)
  1. Initializing the EM algorithm for univariate Gaussian, multi-component, heteroscedastic mixture models by dynamic programming partitions
    Autorzy:
    Polanski A., Marczyk M., Pietrowska M., Widlak P., Polanska J.
    Czasopismo:
    International Journal of Computational Methods (rok: 2018, tom: 15, strony: 1850012 (21 pages)), Wydawca: World Scientific
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1142/S0219876218500123 - link do publikacji
  2. Potential protein activity modifications of amino acid variants in the human transcriptome
    Autorzy:
    Zyla J., Bulman R., Badie C., Bouffler S.
    Czasopismo:
    Acta Biochimica Polonica (rok: 2015, tom: 62(1), strony: 57-61), Wydawca: Polish Biochemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.18388/abp.2014_771 - link do publikacji
  3. Age of diagnosis and gender modify the risk of 9q22, 14q13 polymorphisms for papillary thyroid carcinoma
    Autorzy:
    Kula D., Kalemba M., Puch Z., Polanska J., Handkiewicz-Junak D., Swierniak M., Rusinek D., Żebracka-Gala J., Kowalska M., Kowal M., Tyszkiewicz T., Piasna E., Czarniecka A., Pawlaczek A., Krajewska J., Szpak-Ulczok S., Jarząb B.
    Czasopismo:
    Endokrynologia Polska (rok: 2017, tom: 68(3), strony: 283-289), Wydawca: Via Medica Journals
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.5603/EP.2017.0021 - link do publikacji
  4. Comprehensive analysis of MILE gene expression data set advances discovery of leukaemia type and subtype biomarkers
    Autorzy:
    Labaj W., Papiez A., Polanski A., Polanska J.
    Czasopismo:
    Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences (rok: 2017, tom: 9, strony: 24–35), Wydawca: Springer Verlag
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s12539-017-0216-9 - link do publikacji
  5. Signal Partitioning Algorithm for Highly Efficient Gaussian Mixture Modeling in Mass Spectrometry
    Autorzy:
    Polanski A., Marczyk M., Pietrowska M., Widlak P., Polanska J.
    Czasopismo:
    Plos ONE (rok: 2015, tom: 10(7), strony: e0134256), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pone.0134256 - link do publikacji
  6. Transcriptomic and proteomic analysis of mouse radiation – induced acute myeloid leukaemia (AML)
    Autorzy:
    Badie C., Blachowicz A., Barjaktarovic Z., Finnon R., Michaux A., Sarioglu H., Brown N., Benotmane A., Tapio S., Polanska J., Bouffler S.
    Czasopismo:
    Oncotarget (rok: 2015, tom: 7 (26), strony: 40461-80), Wydawca: Impact Journals, LLC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.18632/oncotarget.9626 - link do publikacji
  7. BatchI: Batch effect Identification in high-throughput screening data using a dynamic programming algorithm
    Autorzy:
    Papiez A., Marczyk M., Polanski A., Polanska J.
    Czasopismo:
    BMC Bioinformatics (rok: 2017, tom: bd, strony: bd), Wydawca: Springer
    Status:
    Złożona
  8. Low dose radiation accelerates ageing of the mur 1 ine T cell receptor repertoire in CBA/Ca mice
    Autorzy:
    Candéias S.M., Mika J., Finnon P., Verbiest T., Finnon R., Brown N., Bouffler S., Polanska J., Badie C.
    Czasopismo:
    Cellular and Molecular Life Sciences (rok: 2017, tom: 74, strony: 4339–4351), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00018-017-2581-2 - link do publikacji
  9. Ranking metrics in Gene Set Enrichment Analysis: do they matter?
    Autorzy:
    Zyla J., Marczyk M., Weiner J., Polanska J.
    Czasopismo:
    BMC Bioinformatics (rok: 2017, tom: 18, strony: 256), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12859-017-1674-0 - link do publikacji
  10. Seeking genetic signature of radiosensitivity - a novel method for data analysis in case of small sample sizes
    Autorzy:
    Zyla J., Finnon P., Bulman R., Bouffler S., Badie C., Polanska J.
    Czasopismo:
    Theoretical Biology and Medical Modelling (rok: 2014, tom: 11(S1), strony: S2), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/1742-4682-11-S1-S2 - link do publikacji
  11. Strategies for optimizing the phase correction algorithms in Nuclear Magnetic Resonance spectroscopy
    Autorzy:
    Binczyk F., Tarnawski R., Polanska J.
    Czasopismo:
    BioMedical Engineering OnLine (rok: 2015, tom: 14(S2), strony: 5), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/1475-925X-14-S2-S5 - link do publikacji
  12. Sources of high variance between probe signals in Affymetrix short oligonucleotide microarrays
    Autorzy:
    Jaksik R., Marczyk M., Polanska J., Rzeszowska-Wolny J.
    Czasopismo:
    Sensors (rok: 2014, tom: 14(1), strony: 532-548), Wydawca: MDPI AG, Basel, Switzerland
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/s140100532 - link do publikacji