Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Transpozony w genomach pierwszych grzybów lądowych (Zygomycota)

2012/07/D/NZ2/04286

Słowa kluczowe:

Zygomycota Entomophtorales Mucorales sekwencjonowanie genomika porównawcza transpozony specjacja MAT locus

Deskryptory:

  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • NZ2_9: Biologia systemowa

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Instytut Biochemii i Biofizyki PAN

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Anna Muszewska 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: SONATA 4 - ogłoszony 2012-09-15

Przyznana kwota: 499 800 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2013-07-16

Zakończenie projektu: 2017-07-15

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Serwer HP Proliant w wersji 24 lib 48 procesorowej z ponad 64GB RAM. Za kwotę 24 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (9)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (1)
  1. Phosphorylation of spore coat proteins by a family of atypical protein kinases.
    Autorzy:
    Nguyen KB, Sreelatha A, Durrant ES, Lopez-Garrido J, Muszewska A, Dudkiewicz M, Grynberg M, Yee S, Pogliano K, Tomchick DR, Pawłowski K, Dixon JE, Tagliabracci VS.
    Czasopismo:
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (rok: 2016, tom: 113(25), strony: E3482-91), Wydawca: National Academy of Sciences
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1073/pnas.1605917113. - link do publikacji
  2. Cut-and-paste transposons in fungi with diverse lifestyles
    Autorzy:
    Anna Muszewska, Kamil Steczkiewicz, Marta M. Stepniewska-Dziubinska, Krzysztof Ginalski
    Czasopismo:
    Genome Biology and Evolution (rok: 2017, tom: 1;9(12), strony: 3463-3477), Wydawca: Oxford Jourmals
    Status:
    Opublikowana
  3. Exploring the genomic diversity of black yeasts and relatives (Chaetothyriales, Ascomycota)
    Autorzy:
    Teixeira MM, Moreno LF, Stielow BJ, Muszewska A, Hainaut M, Gonzaga L, Abouelleil A, Patané JS, Priest M, Souza R, Young S, Ferreira KS, Zeng Q, da Cunha MM, Gladki A, Barker B, Vicente VA, de Souza EM, Almeida S, Henrissat B, Vasconcelos AT, Deng S, Voglmayr H, Moussa TA, Gorbushina A, Felipe MS, Cuomo CA, de Hoog GS
    Czasopismo:
    Studies in Mycology (rok: 2017, tom: 86, strony: 45319), Wydawca: Elsevier B.V.
    Status:
    Opublikowana
  4. Phylogeny-Based Systematization of Arabidopsis Proteins with Histone H1 Globular Domain
    Autorzy:
    Maciej Kotliński, Lukasz Knizewski, Anna Muszewska, Kinga Rutowicz, Maciej Lirski, Anja Schmidt, Célia Baroux, Krzysztof Ginalski, Andrzej Jerzmanowski
    Czasopismo:
    Plant Physiology (rok: 2017, tom: 174, strony: 27-34), Wydawca: American Society of Plant Biologists
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1104/pp.16.00214 - link do publikacji
  5. Fungal genomes tell a story of ecological adaptations
    Autorzy:
    Anna Muszewska
    Czasopismo:
    Folia Biologica et Oecologica (rok: 2014, tom: 10, strony: 45552), Wydawca: DE GRUYTER
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.2478/fobio-2014-0011 - link do publikacji
  6. Biology, systematics, and clinical manifestations of Zygomycota infections
    Autorzy:
    Anna Muszewska, Julia Pawłowska, Paweł Krzyściak
    Czasopismo:
    European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases (rok: 2014, tom: 33, strony: 1273-1287), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s10096-014-2076-0 - link do publikacji
  7. Exploring the genomic diversity of black yeasts and relatives (Chaetothyriales, Ascomycota)
    Autorzy:
    M.M. Teixeira, L.F. Moreno, B.J. Stielow, A. Muszewska, M. Hainaut, L. Gonzaga, A. Abouelleil, J.S.L. Patané, M. Priest, R. Souza, S. Young, K.S. Ferreira, Q. Zeng, M.M.L. da Cunha, A. Gladki, B. Barker, V.A. Vicente, E.M. de Souza, S. Almeida, B. Henrissat, A.T.R. Vasconcelos, S. Deng, H. Voglmayr, T.A.A. Moussa, A. Gorbushina, M.S.S. Felipe, C.A. Cuomo, G. Sybren de Hoog
    Czasopismo:
    Studies in Mycology (rok: 2017, tom: S0166-0616(17), strony: 30016-7), Wydawca: Science direct
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.simyco.2017.01.001 - link do publikacji
  8. Fungal lifestyle reflected in serine protease repertoire
    Autorzy:
    Anna Muszewska, Marta M. Stepniewska-Dziubinska,Kamil Steczkiewicz, Julia Pawlowska, Agata Dziedzic, Krzysztof Ginalski
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2017, tom: 7, strony: -), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-017-09644-w - link do publikacji
  9. Phylogenetic and phylogenomic definition of Rhizopus species
    Autorzy:
    Gryganskyi A, Golan J, Dolatabadi S, Mondo S, Robb S, Idnurm A, Muszewska A, Steczkiewicz K, Masonjones S, Liao HL, Gajdeczka MT1, Anike F, Vuek A, Anishchenko IM, Voigt K, de Hoog GS, Smith ME, Heitman J, Vilgalys R, Stajich JE
    Czasopismo:
    G3: Genes, Genomes, Genetics (rok: 2018, tom: vol. 8 no. 6, strony: 2007-2018), Wydawca: The Genetics Society of America
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1534/g3.118.200235 - link do publikacji
  1. Detecting Locus Acquisition Events in Gene Trees
    Autorzy:
    Michał Ciach, Anna Muszewska and Paweł Górecki.
    Konferencja:
    17th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2017) (rok: 2017, ), Wydawca: Schloss Dagstuhl--Leibniz-Zentrum fuer Informatik
    Data:
    konferencja 21-23.08.2017
    Status:
    Opublikowana