Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Sterowanie procesami wewnątrzkomórkowymi

2012/05/D/ST7/02072

Słowa kluczowe:

sterowanie modelowanie bio-matematyczne moduł regulatorowy p53 analiza bifurkacyjna analiza wrażliwości

Deskryptory:

  • ST7_4: Inżynieria systemów, sensoryka, automatyka
  • ST7_11: Inżynieria biomedyczna
  • ST7_1: Inżynieria sterowania

Panel:

ST7 - Inżynieria systemów i komunikacji: elektronika, komunikacja, optoelektronika

Jednostka realizująca:

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

woj. śląskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Krzysztof Puszyński 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: SONATA 3 - ogłoszony 2012-03-15

Przyznana kwota: 499 980 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2013-03-06

Zakończenie projektu: 2016-09-05

Planowany czas trwania projektu: 42 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (4)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (8)
  • Publikacje książkowe (10)
  1. Pharmacodynamics of the p53-Mdm2 targeting drug Nutlin: the role of gene switching noise
    Autorzy:
    Krzysztof Puszynski, Alberto Gandolfi, Alberto d'Onofrio
    Czasopismo:
    PLOS Computational Biology (rok: 2014, tom: 11(3), strony: online), Wydawca: Publish Library Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pcbi.1003991. - link do publikacji
  2. Application of Bifurcation Theory and siRNA-based Control Signal to Restore the Proper Response of Cancer Cells to DNA Damage
    Autorzy:
    Kozlowska E. Puszynski K.
    Czasopismo:
    Journal of Theoretical Biology (rok: 2016, tom: 408, strony: 213-221), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.jtbi.2016.08.017 - link do publikacji
  3. A novel mathematical model of ATM/p53/NF-kappaB pathways points to the importance of the DDR switch-off mechanisms
    Autorzy:
    Jonak K, Kurpas M, Szoltysek K, Janus P, Abramowicz A, Puszynski K.
    Czasopismo:
    BMC Bioinformatics (rok: 2016, tom: 10(1), strony: 45303), Wydawca: BioMed Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12918-016-0293-0 - link do publikacji
  4. The role of stochastic gene switching in determining the pharmacodynamics of certain drugs: basic mechanisms
    Autorzy:
    Puszynski K. Gandolfi A. d'Onofrio A.
    Czasopismo:
    Journal of Pharmacokinetics and Pharmacodynamics (rok: 2016, tom: 43(4), strony: 395-410), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s10928-016-9480-2 - link do publikacji
  1. Reachability of the Therapeutic Target in the Systems with Parameters Switch
    Autorzy:
    Magdalena Ochab, Krzysztof Puszynski, Andrzej Świerniak
    Konferencja:
    4th International Conference, IWBBIO 2016 (rok: 2016, ), Wydawca: Springer: Bioinformatics and Biomedical Engineering
    Data:
    konferencja 20-22.04.2016
    Status:
    Opublikowana
  2. Structural stability of biological models with switchings
    Autorzy:
    Magdalena Ochab, Krzysztof Puszynski, Andrzej Swierniak
    Konferencja:
    21st International Conference on Methods and Models in Automation and Robotics (rok: 2016, ), Wydawca: Methods and Models in Automation and Robotics (MMAR), 2016 21st International Conference on, IEEE Xplore
    Data:
    konferencja 29.08-1.09.2016
    Status:
    Opublikowana
  3. Analiza symulacyjna procesu ubikwitynacji bałka p53
    Autorzy:
    Wojciech Bensz, Krzysztof Puszyński
    Konferencja:
    XVIII Krajowa Konferencja Biocybernetyki i Inżynierii Biomedycznej (rok: 2013, ), Wydawca: Politechnika Gdańska
    Data:
    konferencja 10-12 października
    Status:
    Opublikowana
  4. Wpływ poziomu białka p53 na los komórki
    Autorzy:
    Magdalena Ochab, Krzysztof Puszyński
    Konferencja:
    XVIII Krajowa Konferencja Biocybernetyki i Inżynierii Biomedycznej (rok: 2013, ), Wydawca: Politechnika Gdańska
    Data:
    konferencja 10-12 października
    Status:
    Opublikowana
  5. A simulation study of the relationship between replication stress detection pathway and the cell cycle
    Autorzy:
    Kurpas Monika, Puszynski Krzysztof
    Konferencja:
    Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics (rok: 2015, ), Wydawca: Springer
    Data:
    konferencja 10-12.09.2015
    Status:
    Opublikowana
  6. The Resection Mechanism Promotes Cell Survival after Exposure to IR
    Autorzy:
    Kurpas Monika, Jonak Katarzyna, Puszynski Krzysztof
    Konferencja:
    4th International Conference on Man–Machine Interactions (rok: 2015, ), Wydawca: Springer
    Data:
    konferencja 6-9.10.2015
    Status:
    Opublikowana
  7. Application of the piece-wise linear models for description of nonlinear biological systems based on p53 regulatory unit
    Autorzy:
    Magdalena Ochab, Krzysztof Puszynski, Andrzej Świerniak
    Konferencja:
    XXII Krajowa Konferencja Zastosowań Matematyki w Biologii i Medycynie (rok: 2016, ), Wydawca: Wydawnictwo Uniwersytetu Jana Kochanowskiego w Kielcach
    Data:
    konferencja 5-9.09.2016
    Status:
    Opublikowana
  8. Controlling the Intracellular Processes
    Autorzy:
    Puszynski, Krzysztof; Jaksik, Roman; Lalik, Anna
    Konferencja:
    19th IFAC World Congress, 2014 (rok: 2014, ), Wydawca: International Federation of Automatic Control
    Data:
    konferencja 24-29.08.2014
    Status:
    Opublikowana
  1. Wybrane metody uproszczonego modelowania matematycznego procesów wewnątrzkomórkowych
    Autorzy:
    Bensz Wojciech, Kurpas Monika, Ochab Magdalena
    Książka:
    Badania i Rozwój Młodych Naukowców w Polsce – Inżynieria w medycynie. (rok: 2016, tom: brak, strony: 58-63), Wydawca: Młodzi naukowcy
    Status:
    Opublikowana
  2. Modelowanie regulatorowych sieci genowych (GRN) - przegląd metod
    Autorzy:
    Ochab Magdalena, Kurpas Monika, Bensz Wojciech
    Książka:
    Badania i Rozwój Młodych Naukowców w Polsce – Inżynieria w medycynie (rok: 2016, tom: brak, strony: 36-44), Wydawca: Młodzi Naukowcy
    Status:
    Opublikowana
  3. Modelowanie wybranych skutków ubocznych chemioterapii
    Autorzy:
    Bensz Wojciech, Kurpas Monika, Ochab Magdalena
    Książka:
    Badania i Rozwój Młodych Naukowców w Polsce – Inżynieria w medycynie (rok: 2016, tom: brak, strony: 53-57), Wydawca: Młodzi Naukowcy
    Status:
    Opublikowana
  4. Prediction of the behavior of mammalian cells after exposure to ionizing radiation based on the new mathematical model of ATM-Mdm2-p53 regulatory pathway
    Autorzy:
    Katarzyna Jonak, Monika Kurpas, and Krzysztof Puszynski
    Książka:
    Advances in Intelligent Systems and Computing. Information Technologies in Biomedicine. (rok: 2014, tom: 283 (3), strony: 349-362), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
  5. Przegląd modeli matematycznych cyklu komórkowego
    Autorzy:
    Kurpas Monika, Bensz Wojciech, Ochab Magdalena
    Książka:
    Badania i Rozwój Młodych Naukowców w Polsce – Inżynieria w medycynie (rok: 2016, tom: brak, strony: 64-71), Wydawca: Młodzi Naukowcy
    Status:
    Opublikowana
  6. Przegląd modeli matematycznych szlaków detekcji uszkodzeń DNA
    Autorzy:
    Kurpas Monika, Bensz Wojciech, Ochab Magdalena
    Książka:
    Badania i Rozwój Młodych Naukowców w Polsce – Inżynieria w medycynie (rok: 2016, tom: brak, strony: 72-79), Wydawca: Młodzi Naukowcy
    Status:
    Opublikowana
  7. Modele komórkowych szlaków sygnałowych i estymacja ich parametrów
    Autorzy:
    Krzysztof Fujarewicz i Krzysztof Puszyński
    Książka:
    Biocybernetyka i Inżynieria Biomedyczna - Tom 10 Bioinformatyka (rok: 2014, tom: 10, strony: 141-174), Wydawca: Akademicka Oficyna Wydawnicza EXIT
    Status:
    Opublikowana
  8. Monografia - współudział wszystkich rozdziałów
    Autorzy:
    Andrzej Swierniak, Marek Kimmel, Jaroslaw Smieja, Krzysztof Puszynski, Krzysztof Psiuk-Maksymowicz
    Książka:
    System Engineering Approach to Planning Anticancer Therapies (rok: 2016, tom: osobna książka, strony: 235 stron), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
  9. Simulation Analysis of the ATR Module as a Detector of UV-Induced DNA Damage
    Autorzy:
    Monika Kurpas, Katarzyna Jonak, Krzysztof Puszyński
    Książka:
    Advances in Intelligent Systems and Computing. Information Technologies in Biomedicine. (rok: 2014, tom: 283 (3), strony: 317-326), Wydawca: Springer
    Status:
    Opublikowana
  10. Systemy biologiczne jako układy z przełączeniami na przykładzie modułu regulatorowego p53
    Autorzy:
    Ochab Magdalena, Kurpas Monika, Bensz Wojciech
    Książka:
    Badania i Rozwój Młodych Naukowców w Polsce – Inżynieria w medycynie (rok: 2016, tom: brak, strony: 44-53), Wydawca: Młodzi Naukowcy
    Status:
    Opublikowana