Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Nowe reagenty i metody w syntezie modyfikowanych nukleotydów oraz ich wykorzystanie do otrzymywania narzędzi biochemicznych i nukleotydów o dużym potencjale terapeutycznym

2012/05/E/ST5/03893

Słowa kluczowe:

synteza nukleotydów 5' mRNA kap reakcje typu click synteza modyfikowanych oligofosforanów biosynteza białka

Deskryptory:

  • ST5_16: Chemia biologiczna
  • ST5_11: Synteza biomateriałów
  • NZ1_2: Biochemia

Panel:

ST5 - Synteza i materiały: otrzymywanie materiałów, związki struktury z właściwościami, nowoczesne materiały o założonych właściwościach, architektura (makro)molekularna, chemia organiczna, chemia nieorganiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Jacek Jemielity 

Liczba wykonawców projektu: 6

Konkurs: SONATA BIS 1 - ogłoszony 2012-03-15

Przyznana kwota: 1 479 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2013-03-15

Zakończenie projektu: 2018-03-14

Planowany czas trwania projektu: 60 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. HPLC - pompa poczwórna, 600 barów, detektory UV-Vis, fluorescencyjny, autosampler. Za kwotę 400 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (17)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Analysis of Decapping Scavenger (DcpS)-cap complex using modified cap analogs reveals molecular determinants for efficient cap binding
    Autorzy:
    Anna Wypijewska del Nogal, Marius D. Surleac, Joanna Kowalska, Maciej Lukaszewicz, Jacek Jemielity, Martin Bisaillon, Edward Darzynkiewicz, Adina L. Milac, Elzbieta Bojarska
    Czasopismo:
    FEBS Journal (rok: 2013, tom: 280, strony: 6508-6527), Wydawca: WILEY-BLACKWELL, 111 RIVER ST, HOBOKEN 07030-5774, NJ USA
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1111/febs.12553 - link do publikacji
  2. Five eIF4E isoforms from Arabidopsis thaliana are characterized by distinct features of cap analogs binding
    Autorzy:
    Anna Kropiwnicka, Krzysztof Kuchta, Maciej Lukaszewicz, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity, Krzysztof Ginalski, Edward Darzynkiewicz, Joanna Zuberek
    Czasopismo:
    Biochemical and Biophysical Research Communications (rok: 2015, tom: 456, strony: 47-52), Wydawca: Elsevier Inc.
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bbrc.2014.11.032 - link do publikacji
  3. Potential therapeutic applications of RNA cap analogs
    Autorzy:
    Marcin Ziemniak, Malwina Strenkowska, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Future Medicinal Chemistry (rok: 2013, tom: 5, strony: 1141-1172), Wydawca: FUTURE SCI LTD, UNITED HOUSE, 2 ALBERT PL, LONDON, N3 1QB, ENGLAND
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.4155/fmc.13.96) - link do publikacji
  4. Roquin targets mRNAs in a 3′-UTR-specific manner by different modes of regulation
    Autorzy:
    Katharina Essig, Nina Kronbeck, Joao C. Guimaraes, Claudia Lohs, Andreas Schlundt, Anne Hoffmann, Gesine Behrens, Sven Brenner, Joanna Kowalska, Cristina Lopez-Rodriguez, Jacek Jemielity, Helmut Holtmann, Kristin Reiche, Jörg Hackermüller, Michael Sattler, Mihaela Zavolan , Vigo Heissmeyer
    Czasopismo:
    Nature Communications (rok: 2018, tom: 9, strony: 3810), Wydawca: NATURE PUBLISHING GROUP, MACMILLAN BUILDING, 4 CRINAN ST, LONDON N1 9XW, ENGLAND
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41467-018-06184-3 - link do publikacji
  5. Synthesis and evaluation of fluorescent cap analogues for mRNA labelling
    Autorzy:
    Marcin Ziemniak, Mariusz Szabelski, Maciej Lukaszewicz, Anna Nowicka, Edward Darzynkiewicz, Zbigniew Wieczorek, Robert E. Rhoads, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2013, tom: 3, strony: 20943-20958), Wydawca: ROYAL SOC CHEMISTRY, THOMAS GRAHAM HOUSE, SCIENCE PARK, MILTON RD, CAMBRIDGE CB4 0WF, CAMBS, ENGLAND
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c3ra42769b - link do publikacji
  6. Synthesis, properties, and biological activity of boranophosphate analogs of the mRNA cap: versatile tools for manipulation of therapeutically relevant cap-dependent processes
    Autorzy:
    Joanna Kowalska, Anna Wypijewska del Nogal, Zbigniew M. Darzynkiewicz, Janina Buck, Corina Nicola, Andreas N. Kuhn, Maciej Lukaszewicz, Joanna Zuberek, Malwina Strenkowska, Marcin Ziemniak, Maciej Maciejczyk, Elzbieta Bojarska, Robert E. Rhoads, Edward Darzynkiewicz, Ugur Sahin and Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2014, tom: 42, strony: 10245–10264), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gku757 - link do publikacji
  7. Cap analogs modified with 1,2-dithiodiphosphate moiety protect mRNA from decapping and enhance its translational potential
    Autorzy:
    Malwina Strenkowska, Renata Grzela, Maciej Majewski, Katarzyna Wnek, Joanna Kowalska, Maciej Lukaszewicz, Joanna Zuberek, Edward Darzynkiewicz, Andreas N Kuhn, Ugur Sahin, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2016, tom: 44, strony: 9578-9590), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkw896 - link do publikacji
  8. Fluorescent HTS assay for phosphohydrolases based on nucleoside 5ʹ-fluorophosphates: application in screening for inhibitors of mRNA Decapping Scavenger and PDE-I
    Autorzy:
    Marek R. Baranowski, Anna Nowicka, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    Organic & Biomolecular Chemistry (rok: 2016, tom: 14, strony: 4595-4604), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c6ob00492j - link do publikacji
  9. Synthesis of Fluorophosphate Nucleotide Analogues and Their Characterization as Tools for 19F NMR Studies
    Autorzy:
    Marek R. Baranowski, Anna Nowicka, Anna M. Rydzik, Marcin Warmiński, Renata Kasprzyk, Błażej A. Wojtczak, Jacek Wójcik, Timothy D. W. Claridge, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    The Journal of Organic Chemistry (rok: 2015, tom: 80, strony: 3982-3997), Wydawca: AMER CHEMICAL SOC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs,joc.5b00337 - link do publikacji
  10. A novel route for preparing 5′ cap mimics and capped RNAs: phosphate-modified cap analogues obtained via click chemistry
    Autorzy:
    Sylwia Walczak, Anna Nowicka, Dorota Kubacka, Kaja Fac, Przemyslaw Wanat, Seweryn Mroczek, Joanna Kowalska, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Chemical Science (rok: 2017, tom: 8, strony: 260-267), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c6sc02437h - link do publikacji
  11. Clickable trimethylguanosine cap analogs modified within the triphosphate bridge: synthesis, conjugation to RNA and susceptibility to degradation
    Autorzy:
    Blazej A. Wojtczak, Marcin Warminski, Joanna Kowalska, Malgorzata Honcharenko, C. I. Edvard Smith, Roger Stromberg, Edward Darzynkiewicz, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2016, tom: 6, strony: 8317-8328), Wydawca: ROYAL SOC CHEMISTRY
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c5ra25684d - link do publikacji
  12. Ethynyl, 2-Propynyl, and 3-Butynyl C-Phosphonate Analogues of Nucleoside Di- and Triphosphates: Synthesis and Reactivity in CuAAC
    Autorzy:
    Przemyslaw Wanat, Sylwia Walczak, Blazej A. Wojtczak, Monika Nowakowska, Jacek Jemielity, Joanna Kowalska
    Czasopismo:
    Organic Letters (rok: 2015, tom: 17, strony: 3062-3065), Wydawca: AMER CHEMICAL SOC
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.orglett.5b01346 - link do publikacji
  13. Structural basis of mRNA-cap recognition by Dcp1–Dcp2
    Autorzy:
    Jeffrey S. Mugridge, Marcin Ziemniak, Jacek Jemielity, John D. Gross
    Czasopismo:
    Nature Structural & Molecular Biology (rok: 2016, tom: 23, strony: 987-994), Wydawca: NATURE PUBLISHING GROUP
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/nsmb.3301 - link do publikacji
  14. mRNA cap analogues substituted in the tetraphosphate chain with CX2: identification of O-to-CCl2 as the first bridging modification that confers resistance to decapping without impairing translation
    Autorzy:
    Anna M. Rydzik, Marcin Warminski, Pawel J. Sikorski, Marek R. Baranowski, Sylwia Walczak, Joanna Kowalska, Joanna Zuberek, Maciej Lukaszewicz, Elzbieta Nowak, Timothy D. W. Claridge, Edward Darzynkiewicz, Marcin Nowotny, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2017, tom: 45, strony: 8661-8675), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkx569 - link do publikacji
  15. Cap analogs containing 6-thioguanosine – reagents for the synthesis of mRNAs selectively photo-crosslinkable with cap-binding biomolecules
    Autorzy:
    Monika Nowakowska, Joanna Kowalska, Franck Martin, Arnaud d'Orchymont, Joanna Zuberek, Maciej Lukaszewicz, Edward Darzynkiewicza and Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Org. Biomol. Chem. (rok: 2014, tom: 12, strony: 4841–4847), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/c4ob00059e - link do publikacji
  16. Synthetic m3G-CAP attachment necessitates a minimum trinucleotide constituent to be recognised as a nuclear import signal
    Autorzy:
    Malgorzata Honcharenko, Burcu Bestas, Martina Jezowska, Blazej A Wojtczak, Pedro Moreno, Joanna Romanowska, Susanna M Bächle, Edward Darzynkiewicz, Jacek Jemielity, C. I. Edvard Smith, Roger Stromberg
    Czasopismo:
    RSC Advances (rok: 2016, tom: 6, strony: 51367-51373), Wydawca: The Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C6RA09568B - link do publikacji
  17. The synthesis of isopropylidene mRNA cap analogs modified with phosphorothioate moiety and their evaluation as promoters of mRNA translation
    Autorzy:
    Marcin Warminski, Joanna Kowalska, Janina Buck, Joanna Zuberek, Maciej Lukaszewicz, Corina Nicola, Andreas N. Kuhn , Ugur Sahin, Edward Darzynkiewicz, Jacek Jemielity
    Czasopismo:
    Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters (rok: 2013, tom: 23, strony: 3753-3758), Wydawca: PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD, THE BOULEVARD, LANGFORD LANE, KIDLINGTON, OXFORD OX5 1GB, ENGLAND
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.bmcl.2013.05.001 - link do publikacji
  1. Synthetic Capped mRNAs for Cap-Specific Photo-Cross-Linking Experiments
    Autorzy:
    Joanna Kowalska, Franck Martin, Jacek Jemielity
    Książka:
    Synthetic mRNA: Production, Introduction Into Cells, and Physiological Consequences (rok: 2016, tom: 1428, strony: 31-43), Wydawca: Springer Science+Business Media
    Status:
    Opublikowana

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy