Projekty finansowane przez NCN
Metody wykrywania rearanżacji genów (transkryptów fuzyjnych) w raku brodawkowatym tarczycy, przy użyciu masywnie równoległego sekwencjonowania transkryptomu.
2011/03/N/NZ2/03495
Słowa kluczowe:
rak tarczycy sekwencjonowanie transkryptom rearanżacje
Deskryptory:
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ2_7: Bioinformatyka
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Narodowy lnstytut Onkologii im. Marii Skłodowskiej-Curie - Państwowy lnstytut Badawczy, Oddział w Gliwicach
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 3
Konkurs: PRELUDIUM 2 - ogłoszony 2011-09-15
Przyznana kwota: 227 105 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2012-09-21
Zakończenie projektu: 2016-04-20
Planowany czas trwania projektu: 43 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- komputer przenośny. Za kwotę 5 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (1)
- Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (3)
- Somatic mutation profiling of follicular thyroid cancer by next generation sequencing.Autorzy:Swierniak M, Pfeifer A, Stokowy T, Rusinek D, Chekan M, Lange D, Krajewska J, Oczko-Wojciechowska M, Czarniecka A, Jarzab M, Jarzab B, Wojtas B.Czasopismo:Molecular and Cellular Endocrinology (rok: 2016, tom: 433, strony: 130–137), Wydawca: ElsevierStatus:OpublikowanaDoi:10.1016/j.mce.2016.06.007 - link do publikacji
- Algorithms for fusion transcripts detection in RNA-seq data - comparison and improvement (streszczenie prezentacji plakatowej)Autorzy:Pfeifer Aleksandra, Jarzab Barbara, Polanska JoannaKonferencja:13th European Conference on Computational Biology (ECCB) (rok: 2014, ), Wydawca: -Data:konferencja 7-10.09.2014Status:Opublikowana
- Detekcja rearanżacji genów w raku brodawkowatym tarczycy, przy użyciu masywnie równoległego sekwencjonowania transkryptomu (Detection of gene rearrangments in papillary thyroid carcinoma using RNA-seq).Autorzy:Aleksandra Pfeifer, Dagmara Rusinek, Jadwiga Żebracka-Gala, Tomasz Tyszkiewicz, Joanna Polańska, Barbara Jarząb.Konferencja:V Konferencja Rak Tarczycy i inne nowotwory złośliwe układu wydzielania wewnętrznego (rok: 2015, ), Wydawca: Via MedicaData:konferencja 14-17.11.2015Status:Opublikowana
- Detection of genome rearrangements in papillary thyroid cancerAutorzy:Pfeifer A, Rusinek D, Zebracka-Gala J, Tyszkiewicz T, Polanska J, Jarzab BKonferencja:23rd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology / 14th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB) (rok: 2015, ), Wydawca: -Data:konferencja 10-14 lipca 2015Status:Opublikowana