Projekty finansowane przez NCN
Architektura i ewolucja sieci białek i niekodującego RNA oraz ich znaczenie w patogenezie bakterii
2011/03/D/NZ8/03011
Słowa kluczowe:
ewolucja wirulencja bakterie biologia systemowa białka niekodujące RNA bioinformatyka
Deskryptory:
- NZ8_1: Biologia ewolucyjna
Panel:
NZ8 - Podstawy wiedzy o życiu na poziomie środowiskowym: biologia ewolucyjna, biologia populacyjna, biologia środowiskowa, systematyka
Jednostka realizująca:
Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 3
Konkurs: SONATA 2 - ogłoszony 2011-09-15
Przyznana kwota: 720 000 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2012-09-07
Zakończenie projektu: 2016-09-06
Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt rozliczony
Zakupiona aparatura
- Komputer stacjonarny. Za kwotę 4 000 PLN
- SERWER HP DL380p G8 Z MACIERZĄ SSD I INTERFEJSEM INFINIBAND. Za kwotę 50 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (6)
- Computational modeling of protein-RNA complex structuresAutorzy:Irina Tuszynska, Dorota Matelska, Marcin Magnus, Grzegorz Chojnowski, Joanna M Kasprzak, Lukasz P Kozlowski, Stanislaw Dunin-Horkawicz, Janusz M BujnickiCzasopismo:Methods (rok: 2014, tom: 65(3), strony: 310–319), Wydawca: Academic PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1016/j.ymeth.2013.09.014 - link do publikacji
- Functional and Bioinformatics Analysis of Two Campylobacter jejuni Homologs of the Thiol-Disulfide Oxidoreductase, DsbAAutorzy:Anna D Grabowska, Ewa Wywiał, Stanislaw Dunin-Horkawicz, Anna M Łasica, Marc MSM Wösten, Anna Nagy-Staroń, Renata Godlewska, Katarzyna Bocian-Ostrzycka, Katarzyna Pieńkowska, Paweł Łaniewski, Janusz M Bujnicki, Jos PM van Putten, E Katarzyna Jagusztyn-KrynickaCzasopismo:PLOS ONE (rok: 2014, tom: 2;9(9), strony: e106247), Wydawca: Public Library of ScienceStatus:OpublikowanaDoi:10.1371/journal.pone.0106247 - link do publikacji
- Loss of conserved non-coding RNAs in genomes of bacterial endosymbiontsAutorzy:Dorota Matelska, Malgorzata Kurkowska, Elzbieta Purta, Janusz M. Bujnicki, Stanislaw Dunin-HorkawiczCzasopismo:Genome Biol. Evol. (rok: 2016, tom: 8(2), strony: 426-438), Wydawca: Oxford University PressStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/gbe/evw007 - link do publikacji
- Phylogenomics and sequence-structure-function relationships in the GmrSD family of Type IV restriction enzymesAutorzy:Magdalena A. Machnicka, Katarzyna H. Kaminska, Stanislaw Dunin-Horkawicz, Janusz BujnickiCzasopismo:BMC Bioinformatics (rok: 2015, tom: 23;16, strony: 336), Wydawca: BioMed CentralStatus:OpublikowanaDoi:10.1186/s12859-015-0773-z - link do publikacji
- tRNAmodpred: a computational method for predicting posttranscriptional modifications in tRNAsAutorzy:Magdalena A. Machnicka, Stanislaw Dunin-Horkawicz, Valerie de Crécy-Lagard, Janusz M. BujnickiCzasopismo:Methods (rok: 2016, tom: 107, strony: 34-41), Wydawca: ElsevierStatus:OpublikowanaDoi:10.1016/j.ymeth.2016.03.013 - link do publikacji
- Functional and evolutionary analyses of Helicobacter pylori HP0231 (DsbK) protein with strong oxidative and chaperone activity characterized by a highly diverged dimerization domainAutorzy:Katarzyna M. Bocian-Ostrzycka, Anna M. Lasica, Stanisław Dunin-Horkawicz, Magdalena J. Grzeszczuk, Karolina Drabik, Aneta M. Dobosz, Renata Godlewska, Elżbieta Nowak, Jean-Francois Collet, Elżbieta K. Jagusztyn-KrynickaCzasopismo:Frontiers in Microbiology (rok: 2015, tom: 8;6, strony: 1065), Wydawca: Frontiers MediaStatus:OpublikowanaDoi:10.3389/fmicb.2015.01065 - link do publikacji