Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Badania struktury drugorzędowej RNA in vivo z zastosowaniem metod wysokowydajnego sekwencjonowania

2011/03/D/NZ2/03304

Słowa kluczowe:

transkryptomika RNA struktura drugorzędowa RNA wysokowydajne sekwencjonowanie siRNA

Deskryptory:

  • NZ2_1: Genetyka molekularna
  • NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
  • NZ2_7: Bioinformatyka

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Wydział Biologii UAM

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Marek Żywicki 

Liczba wykonawców projektu: 5

Konkurs: SONATA 2 - ogłoszony 2011-09-15

Przyznana kwota: 994 324 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2012-09-17

Zakończenie projektu: 2018-03-16

Planowany czas trwania projektu: 66 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (3)
  1. AGouTI - flexible Annotation of Genomic and Transcriptomic Intervals
    Autorzy:
    Jan G. Kosiński, Marek Żywicki
    Czasopismo:
    PLOS Computational Biology (rok: 2023, tom: 19, strony: e1011527), Wydawca: Public Library of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1371/journal.pcbi.1011527 - link do publikacji
  2. The Evaluation of SHAPE-MaP RNA Structure Probing Protocols Reveals a Novel Role of Mn2+ in the Detection of 2′-OH Adducts
    Autorzy:
    Kamilla Grzywacz, Agnieszka Chełkowska-Pauszek, Marianna Plucinska-Jankowska, Marek Żywicki
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2023, tom: 24, strony: 7890), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms24097890 - link do publikacji
  3. Suitability of high-throughput DMS-probing data for constraining the secondary structure prediction of small RNAs
    Autorzy:
    Marianna Plucinska, Kamilla Bąkowska-Żywicka, Marek Żywicki
    Czasopismo:
    BioTechnologia (rok: 2016, tom: 97(3), strony: 161-167), Wydawca: Termedia Publishing House
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.5114/bta.2016.62353 - link do publikacji