Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Aktywność opiekuńcza białek Gag i nukleokapsydu wobec RNA HIV-2: implikacje dla projektowania nowych inhibitorów retrowirusowych

2011/01/D/NZ1/03478

Słowa kluczowe:

HIV genomowy RNA dimeryzacja białka opiekuńcze kwasów nukleinowych Gag NC MA inhibitory retrowirusowe

Deskryptory:

  • NZ1_1: Biologia molekularna

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Instytut Chemii Bioorganicznej PAN

woj. wielkopolskie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Katarzyna Pachulska-Wieczorek 

Liczba wykonawców projektu: 4

Konkurs: SONATA 1 - ogłoszony 2011-03-15

Przyznana kwota: 390 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2011-12-07

Zakończenie projektu: 2015-06-06

Planowany czas trwania projektu: 42 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Zakupiona aparatura

  1. Aparat do sekwencyjnej elektroforezy pionowej. Za kwotę 10 000 PLN
  2. Inkubator z wytrząsaniem do prowadzenia hodowli bakteryjnych. Za kwotę 35 000 PLN
  3. Lampa UV 254/365nm. Za kwotę 3 000 PLN
  4. szafa chłodnicza.
  5. Aparat do elektroforezy poziomej w żelu agarozowym. Za kwotę 1 000 PLN
  6. komputer z oprogramowaniem.
  7. pompa olejowa. Za kwotę 11 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (7)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (3)
  1. Ty1 retrovirus-like element Gag contains overlapping restriction factor and nucleic acid chaperone functions
    Autorzy:
    Nishida Y, Pachulska-Wieczorek K, Błaszczyk L, Saha A, Gumna J, Garfinkel DJ, Purzycka KJ
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2015, tom: nie dotyczy, strony: nie dotyczy), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkv695 - link do publikacji
  2. A self-encoded capsid derivative restricts Ty1 retrotransposition in Saccharomyces
    Autorzy:
    Garfinkel DJ, Tucker JM, Saha A, Nishida Y, Pachulska-Wieczorek K, Błaszczyk L, Purzycka KJ.
    Czasopismo:
    Current Genetics (rok: 2015, tom: 62, strony: 321-329), Wydawca: Springer Link
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1007/s00294-015-0550-6 - link do publikacji
  3. Determinants of Genomic RNA Encapsidation in the Saccharomyces cerevisiae Long Terminal Repeat Retrotransposons Ty1 and Ty3
    Autorzy:
    Pachulska-Wieczorek K, Le Grice SF, Purzycka KJ.
    Czasopismo:
    Viruses (rok: 2016, tom: 8, strony: 45307), Wydawca: MPDI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/v8070193 - link do publikacji
  4. The matrix domain contributes to the nucleic acid chaperone activity of HIV-2 Gag
    Autorzy:
    Katarzyna Pachulska-Wieczorek, Leszek Błaszczyk, Marcin Biesiada, Ryszard W. Adamiak and Katarzyna J. Purzycka
    Czasopismo:
    Retrovirology (rok: 2016, tom: 0,554166666666667, strony: 45306), Wydawca: Springer Bio Med Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12977-016-0245-1 - link do publikacji
  5. Complex RNA Post-transcriptional Element of a Simple Retrovirus
    Autorzy:
    Katarzyna J. Purzycka1, Guy R. Pilkington, Barbara K. Felber and Stuart F.J. Le Grice
    Czasopismo:
    Mobile Genetic Elements (rok: 2015, tom: 5, strony: 45295), Wydawca: Bioscience; Taylor & Francis
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1080/2159256X.2015.1017085 - link do publikacji
  6. Similarities and differences in the nucleic acid chaperone activity of HIV-2 and HIV-1 nucleocapsid proteins in vitro
    Autorzy:
    K. Pachulska-Wieczorek, A.K. Stefaniak, K.J. Purzycka
    Czasopismo:
    Retrovirology (rok: 2014, tom: 0,495833333333333, strony: 45304), Wydawca: Springer Bio Med Central
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/1742-4690-11-54 - link do publikacji
  7. Characterizing the functions of Ty1 Gag and the Gag-derived restriction factor p22/p18
    Autorzy:
    Pachulska-Wieczorek K, Błaszczyk L, Gumna J, Nishida Y, Saha A, Biesiada M, Garfinkel DJ, Purzycka KJ
    Czasopismo:
    Mobile Genetic Elements (rok: 2016, tom: 6, strony: nie dotyczy), Wydawca: Taylor Francis Online
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1080/2159256X.2016.1154637 - link do publikacji
  1. Insight into thebiological functions of retroelement's RNA through the predictions and analyses of their RNA 3D structures
    Autorzy:
    Marcin Biesiada, Katarzyna Pachulska-Wieczorek, Leszek Blaszczyk, Julita Gumna, Ryszard W. Adamiak, Katarzyna J. Purzycka
    Konferencja:
    The 20th Annual Meeting of the RNA Society, Madison, Wisconsin USA (rok: 2015, ), Wydawca: RNA Society
    Data:
    konferencja 26 - 31.05
    Status:
    Opublikowana
  2. Nucleic acid chaperone activity of retroviral proteins
    Autorzy:
    Pachulska-Wieczorek K., Stefaniak A.K., Purzycka K.J., L. Błaszczyk, M. Biesiada and Adamiak R.W
    Konferencja:
    BIO 2014 (rok: 2014, ), Wydawca: Acta Biochimica Polonica
    Data:
    konferencja 9 - 12.09.2015 Warszawa
    Status:
    Opublikowana
  3. Strukturalne i funkcjonalne aspekty oddziaływania poliproteiny Gag z RNA u retrowirusó w
    Autorzy:
    Pachulska-Wieczorek K., Purzycka K.J., Biesiada M., Błaszczyk L.,Adamiak R.W.
    Konferencja:
    58 Zjazd Naukowy PTChem (rok: 2015, ), Wydawca: PTChem
    Data:
    konferencja 21-25.09
    Status:
    Opublikowana