Projects funded by the NCN

Exploring the Mutual Interactions between RNA Enantiomers

Call: PRELUDIUM 6 , Panel: NZ1

Principal investigator: Marta Dudek

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Automated, high-throughput modeling of RNA three-dimensional structures

Call: MAESTRO 3 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Ryszard Adamiak

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki

Modeling of charge transport in RNA structural motifs

Call: PRELUDIUM 3 , Panel: NZ1

Principal investigator: Juliusz Stasiewicz

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Exploring multiple loop motifs in RNA structures

Call: SONATA 19 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Tomasz Żok

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki i Telekomunikacji

Design and synthesis of new rifampicin analogs as a source of effective bacterial RNA polymerase inhibitors

Call: OPUS 2 , Panel: ST5

Principal investigator: dr hab. Piotr Przybylski

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza, Wydział Chemii

Mathematical modeling of micro-RNA control of transcript levels and translation efficiency in irradiated cells

Call: OPUS 23 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Marek Kimmel

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

A framework for de novo modeling of RNA structures using restraints derived from experimental data

Call: SONATA 17 , Panel: NZ1

Principal investigator: dr Sunandan Mukherjee

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie

Coarse-grained molecular dynamics of RNA thermometers at elevated temperatures

Call: PRELUDIUM 2 , Panel: NZ2

Principal investigator: Filip Leonarski

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Functional framework for viral RNA-dependent RNA polymerase, a major target in COVID19 treatment

Call: Polskie Powroty NAWA 2020 COVID-19 , Panel: NZ1

Principal investigator: dr Tomasz Wojciech Turowski

Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk

Predicting 3D RNA structures using Generative Adversarial Networks

Call: PRELUDIUM BIS 2 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Marta Szachniuk

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki i Telekomunikacji

3D Structure determination of key regulatory regions at the 5' and 3' termini of pathogenic Flaviviruses RNA

Call: SONATA 16 , Panel: NZ6

Principal investigator: dr Tales Rocha de Moura

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie

The new methodology for better understanding of ligand-RNA interactions.

Call: OPUS 20 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Filip Stefaniak

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie

Unraveling the influence of posttranscriptional modifications on RNA 3D structure formation and its dynamics, with the i...

Call: OPUS 19 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Janusz Bujnicki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie

The role and cooperation of AidB dehydrogenase and AlkB dioxygenase in repair of adducts to DNA and RNA bases

Call: OPUS 15 , Panel: NZ3

Principal investigator: dr hab. Agnieszka Maciejewska

Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk

Integrative modeling and structure determination of macromolecular complexes comprising RNA and proteins

Call: MAESTRO 9 , Panel: NZ1

Principal investigator: prof. Janusz Bujnicki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

Developement of new methods for designing RNA molecules that fold into desired spatial structures and their use for deve...

Call: OPUS 13 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Janusz Bujnicki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

A coarse-grained method for RNA 3D structure modeling, with emphasis on non-canonical base pairing.

Call: OPUS 12 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Michał Boniecki

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej

RNApolis - methods and algorithms to model and analyse the RNA structure

Call: OPUS 12 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Marta Szachniuk

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki i Telekomunikacji

Computational study of conformational and thermodynamic properties of human ribosomal A-site and its interactions with a...

Call: PRELUDIUM 1 , Panel: NZ1

Principal investigator: Joanna Panecka

Uniwersytet Warszawski, Interdyscyplinarne Centrum Modelowania Matematycznego i Komputerowego

Oddziaływanie syntetycznych oligomerów z rybosomowym RNA.

Call: ETIUDA 4 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Maciej Jasiński

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Bioinformatyczne metody modelowania i weryfikacji hipotezy Świata RNA.

Call: ETIUDA 4 , Panel: ST6

Principal investigator: Natalia Szóstak

Politechnika Poznańska, Wydział Informatyki

Modeling and experimental studies to understand the effects of irradiation on RNA interference

Call: OPUS 10 , Panel: ST7

Principal investigator: prof. Marek Kimmel

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Uncovering the mechanisms, transcriptome and metabolome signatures of ketone-prone diabetes using induced pluripotent st...

Call: POLONEZ 1 , Panel: NZ3

Principal investigator: dr hab. Małgorzata Borowiak

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Modeling 3D structures and dynamics of RNA complexes with metal ions, with particular emphasis on the formation of non-c...

Call: SONATA 9 , Panel: NZ1

Principal investigator: dr Dorota Niedziałek

Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk

RNA structure prediction based on modeling the target sequence and homologous sequences

Call: PRELUDIUM 9 , Panel: NZ2

Principal investigator: Marcin Magnus

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej