Projects funded by the NCN

Genome-wide studies of double-strand DNA breaks in Saccharomyces cerevisiae

Call: SONATA 9 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Magdalena Skrzypczak

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Application of genetic markers to preservation of the biodiversity of the European huchen in Poland

Call: PRELUDIUM 8 , Panel: NZ9

Principal investigator: Marcin Kuciński

Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie, Wydział Nauk o Środowisku

Nuclear genes involved in mitochondrial diseases caused by mitochondrial DNA instability

Call: OPUS 8 , Panel: NZ5

Principal investigator: dr hab. Katarzyna Tońska

Uniwersytet Warszawski, Wydział Biologii

Studies of ectomycorrhizal fungal communities in protected and managed mixed coniferous forests - seeking for hot-spots ...

Call: OPUS 7 , Panel: NZ9

Principal investigator: prof. Maria Rudawska

Instytut Dendrologii PAN

Resolving genetic predisposition to clinical mastitis based on whole genome sequences of 32 cows

Call: OPUS 7 , Panel: NZ9

Principal investigator: prof. Joanna Szyda

Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu, Wydział Biologii i Hodowli Zwierząt

Aspekty taksonomiczne i mikroewolucyjne w rodzaju Batrachium

Call: OPUS 1 , Panel: NZ8

Principal investigator: dr hab. Joanna Zalewska-Gałosz

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biologii i Nauk o Ziemi

Exploring genetic bases of innate and adaptive immune responses in chickens with next generation targeted DNA sequencing...

Call: OPUS 7 , Panel: NZ9

Principal investigator: dr hab. Maria Siwek-Gapińska

Uniwersytet Technologiczno-Przyrodniczy im. Jana i Jędrzeja Śniadeckich w Bydgoszczy, Wydział Hodowli i Biologii Zwierząt

Dynasty and population of the Piast State in view of the integrated historical, anthropological and genomic studies

Call: SYMFONIA 2 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Marek Figlerowicz

Instytut Chemii Bioorganicznej PAN

A novel approach to de novo genome assembly problem based on UCT search strategy (Upper Confidence Bound applied to Tree...

Call: PRELUDIUM 6 , Panel: ST6

Principal investigator: Ewa Matczyńska

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Matematyki i Informatyki

The interactions between beetles and endosymbiotic bacterium Wolbachia: the role played by the ecological niche

Call: SONATA 6 , Panel: NZ8

Principal investigator: dr hab. Łukasz Kajtoch

Instytut Systematyki i Ewolucji Zwierząt Polskiej Akademii Nauk

Taxonomy and microevolution of the feather grasses (Poaceae: Stipa)

Call: OPUS 5 , Panel: NZ8

Principal investigator: dr hab. Marcin Nobis

Uniwersytet Jagielloński, Wydział Biologii i Nauk o Ziemi

Genetic background of aminoglycoside-induced hearing loss - mitochondrial and nuclear genes involvement

Call: SONATA 5 , Panel: NZ5

Principal investigator: dr Małgorzata Rydzanicz

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

Identyfication of new differentally methylated regions (DMRs) in swine targeted genes using methylome analysis (MeDIP) a...

Call: PRELUDIUM 4 , Panel: NZ9

Principal investigator: dr Maciej Grzybek

Instytut Genetyki i Hodowli Zwierząt PAN

The phylogeny of the genus Lamium L.

Call: PRELUDIUM 1 , Panel: NZ8

Principal investigator: Katarzyna Krawczyk

Uniwersytet Warmińsko-Mazurski w Olsztynie, Wydział Biologii i Biotechnologii

Searching for the mutations in whole mitochondrial DNA among patients with hearing loss using Next Generation Sequencing...

Call: PRELUDIUM 3 , Panel: NZ5

Principal investigator: dr Urszula Lechowicz

Instytut Fizjologii i Patologii Słuchu

Influence of nucleotide sequence on the yield of radio- and photodamage to double stranded DNA fragments labelled with t...

Call: OPUS 3 , Panel: ST5

Principal investigator: prof. Janusz Rak

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

Algorithms for the multiple sequence alignment problem and its variants

Call: PRELUDIUM 3 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Adam Gudyś

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

FANCA gene from FA/BRCA pathway and its potential role in laryngeal carcinoma

Call: PRELUDIUM 3 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Marcin Szaumkessel

Instytut Genetyki Człowieka PAN

The search of new biomarkers useful in differentiation of pancreatic cyst lesions with DNA sequencing and protein mass s...

Call: OPUS 3 , Panel: NZ5

Principal investigator: dr Agnieszka Paziewska

Centrum Medyczne Kształcenia Podyplomowego

Genomics of adaptation in oak and beech, as model forest tree species

Call: MAESTRO 2 , Panel: NZ9

Principal investigator: prof. Jarosław Burczyk

Uniwersytet Kazimierza Wielkiego, Wydział Nauk Przyrodniczych

Immune Surveillance in Pathogenesis and Clinical Outcome of Childhood Acute Lymphoblastic Leukemia - the Role of PRF1 Ge...

Call: PRELUDIUM 2 , Panel: NZ5

Principal investigator: Aleksandra Jasińska

Uniwersytet Medyczny w Łodzi, Wydział Lekarski z Oddziałem Stomatologicznym

Correlation between DNA sequence of selected genes of gypsy moth baculovirus (LdMNPV) and their virulence.

Call: PRELUDIUM 2 , Panel: NZ9

Principal investigator: dr Łukasz Rąbalski

Uniwersytet Gdański, Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii Uniwersytetu Gdańskiego i Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego

Targeted DNA Capture and Next Generation Sequencing to identify mutations responsible for hearing impairment

Call: SONATA 2 , Panel: NZ5

Principal investigator: dr Agnieszka Pollak

Instytut Fizjologii i Patologii Słuchu

In search for DNA methylation aberrations associated with susceptibility to ovarian cancer

Call: OPUS 26 , Panel: NZ5

Principal investigator: dr Malwina Suszyńska

Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk

New insight into the structure and function of the DNA segregation systems of alphaproteobacterial repABC plasmids and s...

Call: PRELUDIUM 22 , Panel: NZ2

Principal investigator: Elvira Krakowska

Uniwersytet Warszawski, Wydział Biologii

Molecular profiling of soft tissue sarcomas in tumor and peripheral blood in terms of response to treatment and early de...

Call: OPUS 25 , Panel: NZ5

Principal investigator: prof. Piotr Rutkowski

Narodowy Instytut Onkologii im. Marii Skłodowskiej-Curie - Państwowy Instytut Badawczy

Establishing a universal pangenome model

Call: OPUS 24 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Norbert Dojer

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

The impact of miniature inverted-repeat transposable elements (MITEs) on the chromatin organization in carrot (Daucus ca...

Call: PRELUDIUM BIS 4 , Panel: NZ9

Principal investigator: prof. Dariusz Grzebelus

Uniwersytet Rolniczy im. Hugona Kołłątaja w Krakowie, Wydział Biotechnologii i Ogrodnictwa

Algorithms for processing nucleotide and aminoacid sequences

Call: OPUS 23 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Sebastian Deorowicz

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Multi-omics characterization and detection of the emerging phytopathogenic fungus – Pilidium lythri

Call: PRELUDIUM 21 , Panel: NZ9

Principal investigator: Dominika Siegieda

Instytut Agrofizyki im. Bohdana Dobrzańskiego Polskiej Akademii Nauk

Novel anti-Stokes lanthanide-doped nanoparticles and multicolor FRET mechanisms for single-molecule DNA sequencing (Lant...

Call: WEAVE-UNISONO , Panel: ST5

Principal investigator: prof. Artur Bednarkiewicz

Instytut Niskich Temperatur i Badań Strukturalnych im. Włodzimierza Trzebiatowskiego Polskiej Akademii Nauk

cfDNA methylome analysis in Hodgkin lymphoma patients

Call: SONATA 17 , Panel: NZ5

Principal investigator: dr Kinga Bednarek

Instytut Genetyki Człowieka Polskiej Akademii Nauk

Evaluation of the brain microbiome and proteome as well as the role of fecal microbiota transplantation (FMT) in schizop...

Call: SONATA 17 , Panel: NZ5

Principal investigator: dr Dominika Salamon

Uniwersytet Jagielloński, Collegium Medicum

A novel probabilistic model for cell type identification in spatial transcriptomics and single-cell RNA sequencing data

Call: PRELUDIUM 20 , Panel: ST6

Principal investigator: Agnieszka Geras

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Testing the hypothesis of mitochondrial DNA evolution using hybrid zone of forest tree species and de novo sequence geno...

Call: PRELUDIUM 20 , Panel: NZ8

Principal investigator: Bartosz Łabiszak

Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, Wydział Biologii

High throughput microfluidic system for fast determination of the equilibrium constant for biomolecular complexes: appli...

Call: PRELUDIUM BIS 2 , Panel: ST4

Principal investigator: prof. Robert Hołyst

Instytut Chemii Fizycznej Polskiej Akademii Nauk

Reconstruction and calibration of genome-based phylogeny of the Microtus genus using the Middle Pleistocene genomes

Call: OPUS 20 , Panel: NZ8

Principal investigator: dr Mateusz Baca

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Phylogenetic models to infer cancer evolution

Call: SONATA 16 , Panel: ST6

Principal investigator: dr Jarosław Paszek

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Genomic profiling of circulating biomarkers and matched primary tumors from breast cancer patients

Call: OPUS 20 (LAP) , Panel: NZ5

Principal investigator: dr Aleksandra Markiewicz

Gdański Uniwersytet Medyczny, Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii Uniwersytetu Gdańskiego i Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego

Integrative analysis of single-cell genomics data

Call: SONATA 16 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Aleksander Jankowski

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

High-throughput DNA sequencing on historical collections of beetles: phylogenetic studies among Platynotini (Tenebrionid...

Call: OPUS 19 , Panel: NZ8

Principal investigator: dr hab. Marcin Kamiński

Muzeum i Instytut Zoologii Polskiej Akademii Nauk

Spatial network model of sequence and structure diversity of Human genome at a population scale

Call: PRELUDIUM BIS 1 , Panel: ST6

Principal investigator: dr hab. Dariusz Plewczyński

Politechnika Warszawska, Wydział Matematyki i Nauk Informacyjnych

Development of CNV detection methods based on depth of coverage

Call: PRELUDIUM 18 , Panel: ST6

Principal investigator: Wiktor Kuśmirek

Politechnika Warszawska

Exploring the sequence-structure relationship as a starting point for the design of DNA G-quadruplexes with a given topo...

Call: OPUS 18 , Panel: ST4

Principal investigator: dr hab. Jacek Czub

Politechnika Gdańska

High-resolution map of DNA double-stranded breaks in human genome

Call: MAESTRO 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr hab. Krzysztof Ginalski

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

Genome assembly algorithms for genetic disorders diagnosis

Call: PRELUDIUM 17 , Panel: ST6

Principal investigator: Barbara Poszewiecka

Uniwersytet Warszawski, Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki

Analysis and compression of data from the third generation of sequencing instruments

Call: OPUS 17 , Panel: ST6

Principal investigator: prof. Sebastian Deorowicz

Politechnika Śląska, Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki

Spatio-temporal dynamics of genome-wide diversity of Fagus sylvatica

Call: BEETHOVEN LIFE 1 , Panel: NZ2

Principal investigator: prof. Jarosław Burczyk

Uniwersytet Kazimierza Wielkiego, Wydział Nauk Biologicznych

Influenza virus A (IAV) on Polish pig farms: epidemiology, monitoring and genetic diversity

Call: OPUS 15 , Panel: NZ7

Principal investigator: prof. Tomasz Stadejek

Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie, Instytut Medycyny Weterynaryjnej

Development and application of interacting molecules prediction methods based on sequence coevolution.

Call: PRELUDIUM 15 , Panel: NZ2

Principal investigator: dr Aleksandra Jarmolińska

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego