Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

Toward understanding allosteric regulation of the proteasome activity

2011/01/B/ST5/06616

Keywords:

proteasome allostery inhibition/activation AFM ESI MS crystal structure

Descriptors:

  • ST5_16:
  • NZ5_7: Human disease treatment

Panel:

ST5 - Materials: materials synthesis, structure-properties relations, advanced and functional materials with designed properties, (macro)molecular architecture, material engineering

Host institution :

Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii

woj. pomorskie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

dr hab. Elżbieta Jankowska 

Number of co-investigators in the project: 6

Call: OPUS 1 - announced on 2011-03-15

Amount awarded: 672 200 PLN

Project start date (Y-m-d): 2011-12-01

Project end date (Y-m-d): 2015-03-31

Project duration:: 40 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Equipment purchased [PL]

  1. wytrząsarka typu vortex (1 000 PLN)
  2. komputer (6 000 PLN)
  3. semipreparatywny system HPLC (100 000 PLN)
  4. zasilacz do podtrzymywania pracy urządzeń w razie awarii zasilania (15 000 PLN)
  5. mikroskop polaryzacyjny (25 000 PLN)

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (4)
  • Articles in post-conference publications (21)
  1. DISSECTING A ROLE OF A CHARGE AND CONFORMATION OF TAT2 PEPTIDE IN ALLOSTERIC REGULATION OF 20S PROTEASOME
    Authors:
    Julia Witkowska, Przemysław Karpowicz, Maria Gaczynska, Pawel A. Osmulski and Elżbieta Jankowska
    Academic press:
    Journal of Peptide Science (rok: 2014, tom: 20, strony: 649-656), Wydawca: Wiley
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1002/psc.2642 - link to the publication
  2. Interplay between structure and charge as a key to allosteric modulation of human 20S proteasome by the basic fragment of HIV-1 Tat protein
    Authors:
    Przemysław Karpowicz, Paweł A. Osmulski, Julia Witkowska, Emilia Sikorska, Małgorzata Giżyńska, Agnieszka Belczyk-Ciesielska, Maria Gaczynska, Elżbieta Jankowska
    Academic press:
    PLOS One (rok: 2015, tom: 10, strony: 45316), Wydawca: PLOS
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1371/journal.pone.0143038 - link to the publication
  3. Oligomers and peptidomimetics consisting of methyl 3-amino-2,3- dideoxyhexopyranosiduronic acids
    Authors:
    Emilia Sikorska, Dorota Tuwalska, Przemyslaw Karpowicz, Elzzbieta Jankowska, Andrzej Nowacki, Beata Liberek
    Academic press:
    Tetrahedron (rok: 2015, tom: 71, strony: 2013-2024), Wydawca: Elsevier Ltd
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.tet.2015.02.009 - link to the publication
  4. The proteasome in health and disease
    Authors:
    Elżbieta Jankowska, Julia Stój, Przemysław Karpowicz, Paweł A. Osmulski, Maria Gaczynska
    Academic press:
    Current Pharmaceutical Design (rok: 2013, tom: 19, strony: 1010-1028), Wydawca: Bentham Science Publishers
    Status:
    Published
    DOI:
    1873-4286/13 - link to the publication
  1. Low molecular weight peptidomimetics based on HIV-1 Tat protein sequence alter degradation pattern of alpha-synuclein by 20S proteasome
    Authors:
    M. Gaczyńska, Z. Grzonka, E. Jankowska, P. Osmulski, P. Karpowicz
    Conference:
    International Conference on Molecular Biotechnology and Innovations for Healthy Life : Bioinnovation ScanBalt Forum 2013 (rok: 2013, ), Wydawca: Fundacja Centrum Transferu Technologii Synergy
    Data:
    konferencja 16-18 października
    Status:
    Published
  2. Noncompetitive inhibitors of the proteasome based on the sequence of the peptide PR39
    Authors:
    Małgorzata Giżyńska, Julia Witkowska, Przemysław Karpowicz, Elżbieta Jankowska
    Conference:
    22nd Young Research Fellows Meeting, Chemistry and biology: a permanent dialogue (rok: 2015, ), Wydawca: -
    Data:
    konferencja 04-06.02.2015
    Status:
    Published
  3. Yeast 20S proteasome in complex with low-molecular mass activators
    Authors:
    Julia Witkowska, Rafał Rostankowski, Przemysław Grudnik, Przemysław Golik, Przemysław Karpowicz, Małgorzata Giżyńska, Grzegorz Dubin, Elżbieta Jankowska
    Conference:
    22nd Young Research Fellows Meeting, Chemistry and biology: a permanent dialogue (rok: 2015, ), Wydawca: -
    Data:
    konferencja 04-06.02.2015
    Status:
    Published
  4. Allosteric interactions as a new target in modulation of proteasome activity
    Authors:
    E. Jankowska, P. Karpowicz, J. Stój, M. Gaczynska, P. Osmulski
    Conference:
    Bioinnovation International Summit (rok: 2012, ), Wydawca: Pro-Science Polska
    Data:
    konferencja 22-23/10/2012
    Status:
    Published
  5. Elaboration of effective method for native chemical ligation of Tat protein
    Authors:
    Julia Stój, Ewa Wieczerzak, Elżbieta Jankowska
    Conference:
    22nd Polish Peptide Symposium (rok: 2013, ), Wydawca: Department of Bioorganic Chemistry, Wrocław Uniwersity of Technology
    Data:
    konferencja 1-5 września
    Status:
    Published
  6. HIV-1 Tat-derived peptides as allosteric inhibitors of the proteasome activity
    Authors:
    J. Stój, P. Karpowicz, M. Gaczynska, P. Osmulski, E. Jankowska
    Conference:
    11th International Symposium on Molecular Basis of Pathology and Therapy in Neurological Disorders (rok: 2013, ), Wydawca: Polish Neuroscience Society, Nencki Institute of Experimental Biology
    Data:
    konferencja 22-23 11 2012
    Status:
    Published
  7. Noncompetitive inhibitors of the proteasome in anticancer therapy
    Authors:
    Małgorzata Giżyńska, Maciej Cieślak, Julia Witkowska, Przemysław Karpowicz, Elżbieta Jankowska
    Conference:
    International Conference on Molecular Biotechnology and Innovations for Healthy Life : Bioinnovation International Summit (rok: 2014, ), Wydawca: Fundacja Centrum Transferu Technologii Synergy
    Data:
    konferencja 20-21 października 2014
    Status:
    Published
  8. Peptidic inhibitors of the 20S proteasome with allosteric activity mode
    Authors:
    J. Stój, M. Sosnowska, P. Karpowicz, M. Gaczynska, P. Osmulski, E. Jankowska
    Conference:
    13th Naples Workshop on Bioactive Peptides (rok: 2012, ), Wydawca: Centro Interuniversitario di Ricerca sui Peptidi Bioattivi
    Data:
    konferencja 7-10 czerwca 2012
    Status:
    Published
  9. Crystallization of the 20S proteasome in the complex with allosteric modulators of its activity
    Authors:
    J. Witkowska, P. Grudnik, P. Golik, W. Kabala, M. Giżyńska, M. Gaczynska, P. Osmulski, G. Dubin, E. Jankowska
    Conference:
    EMBO Conference Series: Chemical Biology, Heidelberg 2014 (rok: 2014, ), Wydawca: -
    Data:
    konferencja 20-23 sierpnia 2014
    Status:
    Published
  10. Interplay between structure and charge: basic fragment of HIV-1 Tat protein as a key to future allosteric inhibitors of the 20S proteasome
    Authors:
    Przemysław Karpowicz, Julia Witkowska, Elżbieta Jankowska, Małgorzata Giżyńska, Pawel A. Osmulski, Maria Gaczynska
    Conference:
    1st International Congress: From Drug Discovery to Drug Delivery (rok: 2014, ), Wydawca: -
    Data:
    konferencja 13-15.10.2014
    Status:
    Published
  11. Where are localized the proteasome allosteric sites? : crystallographic approach
    Authors:
    Julia Witkowska, Rafał Rostankowski, Przemysław Golik, Przemysław Grudnik, Przemysław Karpowicz, Maria Gaczyńska, Paweł Osmulski, Grzegorz Dubin, Elżbieta Jankowska
    Conference:
    International Conference on Molecular Biotechnology and Innovations for Healthy Life : Bioinnovation International Summit (rok: 2014, ), Wydawca: Fundacja Centrum Transferu Technologii Synergy
    Data:
    konferencja 20-21 października 2014
    Status:
    Published
  12. Allosteric modulators derived from the HIV-1 Tat protein alter in vitro degradation of α-synuclein by the human 20S proteasome
    Authors:
    Przemysław Karpowicz, Paweł A. Osmulski, Elżbieta Jankowska, Zbigniew Grzonka, Maria E. Gaczynska
    Conference:
    22nd Polish Peptide Symposium (rok: 2013, ), Wydawca: Department of Bioorganic Chemistry, Wrocław Uniwersity of Technology
    Data:
    konferencja 1-5 września
    Status:
    Published
  13. Application of SAR and crystallographic studies in a search for efficient allosteric modulators of the proteasome activity
    Authors:
    Elżbieta Jankowska, Julia Witkowska, Przemysław Karpowicz, Rafał Rostankowski, Maria Gaczynska, Paweł Osmulski
    Conference:
    International Conference on Molecular Biotechnology and Innovations for Healthy Life : Bioinnovation ScanBalt Forum 2013 (rok: 2013, ), Wydawca: Fundacja Centrum Transferu Technologii Synergy
    Data:
    konferencja 16-18 października
    Status:
    Published
  14. Crystallization trials of proteasome-activator or proteasome-inhibitor complexes
    Authors:
    Julia Witkowska, Wojciech Kabala, Przemysław Golik, Przemysław Grudnik, Małgorzata Giżyńska, Maria Gaczynska, Pawel Osmulski, Grzegorz Dubin, Elżbieta Jankowska
    Conference:
    Biocrystallography for the high-throughput era (rok: 2014, ), Wydawca: -
    Data:
    konferencja 1-5 July 2014
    Status:
    Published
  15. In search for effective modulators of the proteasome activity
    Authors:
    P. Karpowicz, J. Stój, M. Gaczynska, P.A. Osmulski, E. Jankowska
    Conference:
    11th International Symposium on Molecular Basis of Pathology and Therapy in Neurological Disorders (rok: 2013, ), Wydawca: Polish Neuroscience Society, Nencki Institute of Experimental Biology
    Data:
    konferencja 22-23 11 2012
    Status:
    Published
  16. Microscale thermophoresis as a new tool for studying interactions of 20S proteasome with allosteric modulators
    Authors:
    Przemysław Karpowicz, Julia Witkowska, Małgorzata Giżyńska, Pawel A. Osmulski, Maria Gaczynska, Elżbieta Jankowska
    Conference:
    International Conference on Molecular Biotechnology and Innovations for Healthy Life : Bioinnovation International Summit (rok: 2014, ), Wydawca: Fundacja Transferu Technologii Synergy
    Data:
    konferencja 20-21 października 2014
    Status:
    Published
  17. The power of allostery - modulation of proteasome activity
    Authors:
    Elżbieta Jankowska, Przemysław Karpowicz, Julia Stój, Rafał Rostankowski, M. Gaczyńska, P. Osmulsk
    Conference:
    22nd Polish Peptide Symposium (rok: 2013, ), Wydawca: Department of Bioorganic Chemistry, Wrocław Uniwersity of Technology
    Data:
    konferencja 1-5 września
    Status:
    Published
  18. Allosteric HIV-1 Tat-based inhibitors of the proteasome activity
    Authors:
    J. Stój, P. Karpowicz, M. Gaczynska, P. Osmulski, E. Jankowska
    Conference:
    Bioinnovation International Summit (rok: 2012, ), Wydawca: Proscience Polska
    Data:
    konferencja 22-23/10/2012
    Status:
    Published
  19. Crystallographic approach to identification of the 20S proteasome non-covalent binding sites
    Authors:
    J. Witkowska, R. Rostankowski, P. Karpowicz, M. Giżyńska, P. Grudnik, P. Golik, G. Dubin, E. Jankowska
    Conference:
    Multi-Pole Approach to Structural Science Conference (rok: 2015, ), Wydawca: -
    Data:
    konferencja 10-13 maja 2015
    Status:
    Published
  20. PR-peptides as noncompetitive modulators of the proteasome activity
    Authors:
    E. Jankowska, J. Witkowska, P. Karpowicz, M. Giżyńska, M. Cieślak, M. Gaczynska, P.A. Osmulski
    Conference:
    50th International Conference on Medicinal Chemistry RICT Rouen 2014 (rok: 2014, ), Wydawca: LD Organisation
    Data:
    konferencja 2-4 lipca 2014
    Status:
    Published
  21. The mystery of allosteric inhibition of the 20S proteasome by basic fragment of HIV-I Tat protein: structure and charge as key factors to gain the control
    Authors:
    Przemvsław Karpowicz, Paweł. A. Osmulski, Maria Gaczynska, Paulina Czaplewska, Julia Witkowska, Małgorzata Giżyńska, Elżbieta Jankowska
    Conference:
    22nd Young Research Fellows Meeting, Chemistry and biology: a permanent dialogue (rok: 2015, ), Wydawca: -
    Data:
    konferencja 04-06.02.2015
    Status:
    Published

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy