Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

New regioselective chemical and biochemical strategies for proteins labeling

2019/33/B/ST4/02428

Keywords:

protein peptide labeling conjugation ligation ligase sortase biarsenical probes fluorescence modification tag metal binding site chemical biology affinity

Descriptors:

  • NZ1_002:
  • NZ1_003:
  • ST4_009:

Panel:

ST4 - Chemistry: physical chemistry/chemical physics, theoretical chemistry, analytical chemistry, inorganic chemistry, organic chemistry, method development

Host institution :

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Biotechnologii

woj. dolnośląskie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

prof. Artur Krężel 

Number of co-investigators in the project: 8

Call: OPUS 17 - announced on 2019-03-15

Amount awarded: 2 237 000 PLN

Project start date (Y-m-d): 2020-01-30

Project end date (Y-m-d): 2024-04-29

Project duration:: 51 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Project description

Download the project description in a pdf file

Note - project descriptions were prepared by the authors of the applications themselves and placed in the system in an unchanged form.

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (8)
  • Articles in post-conference publications (13)
  1. A combined biochemical and cellular approach reveals Zn2+-dependent hetero- and homodimeric CD4 and Lck assemblies in T cells
    Authors:
    Anna M. Kocyła, Aleksander Czogalla, Inga Wessels, Lothar Rink, Artur Krężel
    Academic press:
    Structure (rok: 2024, tom: 32, strony: 292-303), Wydawca: Cell Press
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.str.2023.11.013 - link to the publication
  2. Calcium-assisted sortase A cleavage of SUMOylated metallothionein constructs leads to high-yield production of human MT3
    Authors:
    Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Academic press:
    Microbial Cell Factories (rok: 2023, tom: 22, strony: 125), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1186/s12934-023-02134-x - link to the publication
  3. OaAEP1 ligase-assisted chemoenzymatic synthesis of full cysteine-rich metal-binding cyanobacterial metallothionein SmtA
    Authors:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Karolina Mosna, Artur Krężel
    Academic press:
    Bioconjugate Chemistry (rok: 2023, tom: nd, strony: nd), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1021/acs.bioconjchem.3c00037 - link to the publication
  4. Biarsenical fluorescent probes for multifunctional site-specific modification of proteins applicable in life sciences: An overview and future outlook
    Authors:
    Adam Pomorski, Artur Krężel
    Academic press:
    Metallomics (rok: 2020, tom: 12, strony: 1179-1207), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1039/D0MT00093K - link to the publication
  5. A combined biochemical and cellular approach reveals Zn2+-dependent hetero- and homodimeric CD4 and Lck assemblies in T cells
    Authors:
    Anna M. Kocyła, Aleksander Czogalla, Inga Wessels, Lothar Rink, Artur Krężel
    Academic press:
    Structure (rok: 2024, tom: 32, strony: 292-303), Wydawca: Cell Press
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.str.2023.11.013 - link to the publication
  6. A guide to good practice in chemometric methods for vibrational spectroscopy, electrochemistry, and hyphenated mass spectrometry
    Authors:
    Manuel David Peris-Díaz, Artur Krężel
    Academic press:
    Trends in Analytical Chemistry (rok: 2021, tom: 135, strony: 116157), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1016/j.trac.2020.116157 - link to the publication
  7. One-Step Sortase-Mediated Chemoenzymatic Semisynthesis of Deubiquitinase-Resistant Ub-Peptide Conjugates
    Authors:
    Avinash Kumar Singh, Sumit Murmu, Artur Krężel
    Academic press:
    ACS Omega (rok: 2022, tom: 7, strony: 46693–46701), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1021/acsomega.2c05652 - link to the publication
  8. Structures of Silver Fingers and a Pathway to Their Genotoxicity
    Authors:
    Katarzyna Kluska, Giulia Veronesi, Aurélien Deniaud, Bálint Hajdu, Béla Gyurcsik, Wojciech Bal Artur Krężel
    Academic press:
    Angewandte Chemie (rok: 2022, tom: 61, strony: e202116621), Wydawca: Wiley
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1002/ange.202116621 - link to the publication
  1. Wiązanie jonów Cu(I) i Zn(II) przez ludzką metalotioneinę-3 (MT3) i jej ubikwitynylowaną formę
    Authors:
    Alicja Orzeł, Manuel Peris Diaz, Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Conference:
    Książka Abstraktów (rok: 2023, tom: 65. Zjazd Naukowy PTChem, strony: 160), Wydawca: Polskie Towarzystwo Chemiczne
    Data:
    konferencja 19-22.09.2023
    Status:
    Published
  2. Oddziaływania izoform ludzkich metalotionein z jednowartościowymi jonami miedzi
    Authors:
    Alicja Misiaszek, Artur Krężel
    Conference:
    Książka Abstraktów 2022. 64. Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2022, tom: 64. Zjazd Naukowy PTChem, strony: 156), Wydawca: PTChem
    Data:
    konferencja 11-16 września 2022
    Status:
    Published
  3. Highly efficient sortase-A and Ulp1-mediated purification method for the expression and purification of recombinant human MT3 in bacterial system
    Authors:
    Avinash Kumar Singh, Artur Krezel
    Conference:
    Abstracts of papers presented at the EMBO Workshop: Chemical biology 2022 (rok: 2022, tom: EMBO Workshop: Chemical biology 2022 EMBL Advanced Training Centre and virtual, strony: 173), Wydawca: EMBL Advanced Training Centre, Heidelberg
    Data:
    konferencja 5-8 września 2022
    Status:
    Published
  4. CHEMICAL OXIDATION OF P53 MONITORED BY MASS SPECTROMETRY
    Authors:
    Manuel Peris Diaz, Perdita Barran, Artur Krężel
    Conference:
    IMSC 2022 Abstract Book (rok: 2022, tom: 24th IMSC 2022: International Mass Spectrometry Conference, strony: 1028-1029), Wydawca: International Mass Spectrometry Foundation (IMSF)
    Data:
    konferencja 27 sierpnia - 2 września 2022
    Status:
    Published
  5. REGULACJA I DEREGULACJA FUNKCJI BIAŁEK CYNKOWYCH – WALKA DOBREGO Z DOBRYM I ZŁYM
    Authors:
    Artur Krężel
    Conference:
    Książka Abstraktów 2022. 64. Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2022, tom: 64. Zjazd Naukowy PTChem, strony: 113), Wydawca: PTChem
    Data:
    konferencja 11-16 września 2022
    Status:
    Published
  6. New chemoenzymatic approach for the semisynthesis and site-specifically ubiquitination of alpha-synuclein and its influence on its aggregation
    Authors:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Conference:
    EFMC-ISCB Book of Abstracts (rok: 2023, tom: International Symposium on Chemical Biology, strony: 128), Wydawca: EFMC
    Data:
    konferencja 16-18.11.2023
    Status:
    Published
  7. Semisynthesis of SmtA metallothionein using a highly efficient OaAEP1 ligase – comparison of metal binding properties of synthetic and E. coli-produced protein
    Authors:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Conference:
    EuroBIC16 Abstract Book (rok: 2022, tom: EuroBIC16: 16th European Biological Inorganic Chemistry Conference, strony: brak danych), Wydawca: University Grenoble Alpes
    Data:
    konferencja 17-21 lipca 2022
    Status:
    Published
  8. Zinc to silver swap in zinc finger domains disrupts their native structures and DNA recognition
    Authors:
    Artur Krężel
    Conference:
    ICTEM 2022 Program and Abstract Book (rok: 2022, tom: ICTEM 2022: International Conference of Trace Elements and Minerals, strony: 67), Wydawca: Uniklinik RWTH Aachen
    Data:
    konferencja 5 czerwca - 10 czerwca 2022
    Status:
    Published
  9. Ligaza OaAEP1 jako narzędzie molekularne do tworzenia wiązania peptydowego
    Authors:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Conference:
    Książka Abstraktów 2020/2021 63. Zjazd naukowy Polskiego Toważystwa Chemicznego (rok: 2021, tom: 63. Zjazd naukowy PTCHEM, strony: 438), Wydawca: PTCHEM
    Data:
    konferencja 13-17 Września 2021
    Status:
    Published
  10. Site-Specific sortase-mediated ubiquitination and sumoylation of proteins using fluorescent biarsenical probes
    Authors:
    Anastasiia Antonenko, Adam Pomorski, Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Conference:
    EFMC-ISCB Book of Abstracts (rok: 2023, tom: EFMC International Symposium on Chemical Biology, strony: 129), Wydawca: EFMC
    Data:
    konferencja 16-18.11.2023
    Status:
    Published
  11. New efficient enzymatic strategy for the semisynthesis of metallothionein
    Authors:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Artur Krezel
    Conference:
    Abstracts of papers presented at the EMBO Workshop: Chemical biology 2022 (rok: 2022, tom: EMBO Workshop: Chemical biology 2022, EMBL Advanced Training Centre and virtual, strony: 66), Wydawca: EMBL Advanced Training Centre, Heidelberg
    Data:
    konferencja 5-8 września 2022
    Status:
    Published
  12. Specificity factors that govern zinc-dependent assembly of CD4 coreceptor and Lck tyrosine kinase
    Authors:
    Anna Kocyla, Aleksander Czogalla, and Artur Krężel
    Conference:
    BioMetals 2020 (rok: 2020, tom: 12th International BioMetals, strony: ), Wydawca: Université Grenoble Alpes
    Data:
    konferencja 6-10 lipca 2020
    Status:
    Published
  13. WYKORZYSTANIE WYSOKOEFEKTYWNEJ LIGAZY ASPARAGINOWEJ DO SEMISYNTEZY BIAŁEK
    Authors:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Conference:
    Książka Abstraktów. 64. Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2022, tom: 64. Zjazd Naukowy PTChem, strony: 155), Wydawca: PTChem
    Data:
    konferencja 11-16 września
    Status:
    Published

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy