Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Nowe regioselektywne strategie w chemicznej i biochemicznej modyfikacji białek

2019/33/B/ST4/02428

Słowa kluczowe:

białko peptyd modyfikacja koniugacja ligacja ligaza sortaza barwniki biarsenowe fluorescencja metka miejsce wiązania metalu chemia biologiczna powinowactwo

Deskryptory:

  • NZ1_2: Biochemia
  • NZ1_3: Biofizyka
  • ST4_9: Chemia biologiczna

Panel:

ST4 - Chemia analityczna i fizyczna: chemia analityczna, metody teoretyczne w chemii, chemia fizyczna/fizyka chemiczna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Biotechnologii

woj.

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

prof. Artur Krężel 

Liczba wykonawców projektu: 8

Konkurs: OPUS 17 - ogłoszony 2019-03-15

Przyznana kwota: 2 237 000 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2020-01-01

Zakończenie projektu: 2024-04-29

Planowany czas trwania projektu: 51 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (19)
  • Teksty w publikacjach pokonferencyjnych (25)
  1. Biarsenical fluorescent probes for multifunctional site-specific modification of proteins applicable in life sciences: An overview and future outlook
    Autorzy:
    Adam Pomorski, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Metallomics (rok: 2020, tom: 12, strony: 1179-1207), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/D0MT00093K - link do publikacji
  2. Site-specific and fluorescently-enhanced installation of post-translational protein modifications via bifunctional biarsenical probe
    Autorzy:
    Anastasiia Antonenko, Adam Pomorski, Avinash Kumar Singh, Katarzyna Kapczyńska, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Bioconjugate Chemistry (rok: 2024, tom: nie dotyczy, strony: nie dotyczy), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Złożona
  3. Structures of Silver Fingers and a Pathway to Their Genotoxicity
    Autorzy:
    Katarzyna Kluska, Giulia Veronesi, Aurélien Deniaud, Bálint Hajdu, Béla Gyurcsik, Wojciech Bal Artur Krężel
    Czasopismo:
    Angewandte Chemie (rok: 2022, tom: 61, strony: e202116621), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/ange.202116621 - link do publikacji
  4. Structures of Silver Fingers and a Pathway to Their Genotoxicity
    Autorzy:
    Katarzyna Kluska, Giulia Veronesi, Aurélien Deniaud, Bálint Hajdu, Béla Gyurcsik, Wojciech Bal Artur Krężel
    Czasopismo:
    Angewandte Chemie (rok: 2022, tom: 61, strony: e202116621), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/ange.202116621 - link do publikacji
  5. Biarsenical fluorescent probes for multifunctional site-specific modification of proteins applicable in life sciences: An overview and future outlook
    Autorzy:
    Adam Pomorski, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Metallomics (rok: 2020, tom: 12, strony: 1179-1207), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/D0MT00093K - link do publikacji
  6. A combined biochemical and cellular approach reveals Zn2+-dependent hetero- and homodimeric CD4 and Lck assemblies in T cells
    Autorzy:
    Anna M. Kocyła, Aleksander Czogalla, Inga Wessels, Lothar Rink, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Structure (rok: 2024, tom: 32, strony: 292-303), Wydawca: Cell Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.str.2023.11.013 - link do publikacji
  7. Structures of Silver Fingers and a Pathway to Their Genotoxicity
    Autorzy:
    Katarzyna Kluska, Giulia Veronesi, Aurélien Deniaud, Bálint Hajdu, Béla Gyurcsik, Wojciech Bal Artur Krężel
    Czasopismo:
    Angewandte Chemie (rok: 2022, tom: 61, strony: e202116621), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/ange.202116621 - link do publikacji
  8. Deciphering the safeguarding role of cysteine residues in p53 against H2O2-induced oxidation using high-resolution native mass spectrometry
    Autorzy:
    Manuel David Peris-Díaz, Artur Krężel, Perdita Barran
    Czasopismo:
    Nature Communications (rok: 2024, tom: nie dotyczy, strony: nie dotyczy), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Złożona
  9. Biarsenical-based fluorescent labeling of metallothioneins as a method for ultrasensitive quantification of poly-Cys targets
    Autorzy:
    Adam Pomorski, Sylwia Wu, Michał Tracz, Jaroslava Bezdekova, Agata Brambor, Aleksandra Suszyńska, Katarzyna Piekarowicz, Marketa Vaculovičová, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Analytical Chemistry (rok: 2024, tom: nie dotyczy, strony: nie dotyczy), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Złożona
  10. OaAEP1 ligase-assisted chemoenzymatic synthesis of full cysteine-rich metal-binding cyanobacterial metallothionein SmtA
    Autorzy:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Karolina Mosna, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Bioconjugate Chemistry (rok: 2023, tom: nd, strony: nd), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.bioconjchem.3c00037 - link do publikacji
  11. OaAEP1 ligase-assisted chemoenzymatic synthesis of full cysteine-rich metal-binding cyanobacterial metallothionein SmtA
    Autorzy:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Karolina Mosna, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Bioconjugate Chemistry (rok: 2023, tom: nd, strony: nd), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.bioconjchem.3c00037 - link do publikacji
  12. Biarsenical fluorescent probes for multifunctional site-specific modification of proteins applicable in life sciences: An overview and future outlook
    Autorzy:
    Adam Pomorski, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Metallomics (rok: 2020, tom: 12, strony: 1179-1207), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/D0MT00093K - link do publikacji
  13. A guide to good practice in chemometric methods for vibrational spectroscopy, electrochemistry, and hyphenated mass spectrometry
    Autorzy:
    Manuel David Peris-Díaz, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Trends in Analytical Chemistry (rok: 2021, tom: 135, strony: 116157), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.trac.2020.116157 - link do publikacji
  14. Antioxidant-related enzymes and peptides as biomarkers of metallic nanoparticles (eco)toxicity in the aquatic environment
    Autorzy:
    Tomas Do, Silvia Vaculciakova, Katarzyna Kluska, Manuel David Peris-Díaz, Jan Priborsky, Roman Guran, Artur Krężel, Vojtech Adam, Ondrej Zitka
    Czasopismo:
    Chemosphere (rok: 2024, tom: nie dotyczy, strony: nie dotyczy), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Złożona
  15. One-Step Sortase-Mediated Chemoenzymatic Semisynthesis of Deubiquitinase-Resistant Ub-Peptide Conjugates
    Autorzy:
    Avinash Kumar Singh, Sumit Murmu, Artur Krężel
    Czasopismo:
    ACS Omega (rok: 2022, tom: 7, strony: 46693–46701), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acsomega.2c05652 - link do publikacji
  16. A guide to good practice in chemometric methods for vibrational spectroscopy, electrochemistry, and hyphenated mass spectrometry
    Autorzy:
    Manuel David Peris-Díaz, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Trends in Analytical Chemistry (rok: 2021, tom: 135, strony: 116157), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.trac.2020.116157 - link do publikacji
  17. A guide to good practice in chemometric methods for vibrational spectroscopy, electrochemistry, and hyphenated mass spectrometry
    Autorzy:
    Manuel David Peris-Díaz, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Trends in Analytical Chemistry (rok: 2021, tom: 135, strony: 116157), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.trac.2020.116157 - link do publikacji
  18. One-Step Sortase-Mediated Chemoenzymatic Semisynthesis of Deubiquitinase-Resistant Ub-Peptide Conjugates
    Autorzy:
    Avinash Kumar Singh, Sumit Murmu, Artur Krężel
    Czasopismo:
    ACS Omega (rok: 2022, tom: 7, strony: 46693–46701), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acsomega.2c05652 - link do publikacji
  19. Calcium-assisted sortase A cleavage of SUMOylated metallothionein constructs leads to high-yield production of human MT3
    Autorzy:
    Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Czasopismo:
    Microbial Cell Factories (rok: 2023, tom: 22, strony: 125), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1186/s12934-023-02134-x - link do publikacji
  1. New chemoenzymatic approach for the semisynthesis and site-specifically ubiquitination of alpha-synuclein and its influence on its aggregation
    Autorzy:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Konferencja:
    EFMC-ISCB Book of Abstracts (rok: 2023, tom: International Symposium on Chemical Biology, strony: 128), Wydawca: EFMC
    Data:
    konferencja 16-18.11.2023
    Status:
    Opublikowana
  2. WYKORZYSTANIE WYSOKOEFEKTYWNEJ LIGAZY ASPARAGINOWEJ DO SEMISYNTEZY BIAŁEK
    Autorzy:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Konferencja:
    Książka Abstraktów. 64. Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2022, tom: 64. Zjazd Naukowy PTChem, strony: 155), Wydawca: PTChem
    Data:
    konferencja 11-16 września
    Status:
    Opublikowana
  3. REGULACJA I DEREGULACJA FUNKCJI BIAŁEK CYNKOWYCH – WALKA DOBREGO Z DOBRYM I ZŁYM
    Autorzy:
    Artur Krężel
    Konferencja:
    Książka Abstraktów 2022. 64. Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2022, tom: 64. Zjazd Naukowy PTChem, strony: 113), Wydawca: PTChem
    Data:
    konferencja 11-16 września 2022
    Status:
    Opublikowana
  4. Semisynthesis of SmtA metallothionein using a highly efficient OaAEP1 ligase – comparison of metal binding properties of synthetic and E. coli-produced protein
    Autorzy:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Konferencja:
    EuroBIC16 Abstract Book (rok: 2022, tom: EuroBIC16: 16th European Biological Inorganic Chemistry Conference, strony: brak danych), Wydawca: University Grenoble Alpes
    Data:
    konferencja 17-21 lipca 2022
    Status:
    Opublikowana
  5. New efficient enzymatic strategy for the semisynthesis of metallothionein
    Autorzy:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Artur Krezel
    Konferencja:
    Abstracts of papers presented at the EMBO Workshop: Chemical biology 2022 (rok: 2022, tom: EMBO Workshop: Chemical biology 2022, EMBL Advanced Training Centre and virtual, strony: 66), Wydawca: EMBL Advanced Training Centre, Heidelberg
    Data:
    konferencja 5-8 września 2022
    Status:
    Opublikowana
  6. Specificity factors that govern zinc-dependent assembly of CD4 coreceptor and Lck tyrosine kinase
    Autorzy:
    Anna Kocyla, Aleksander Czogalla, and Artur Krężel
    Konferencja:
    BioMetals 2020 (rok: 2020, tom: 12th International BioMetals, strony: ), Wydawca: Université Grenoble Alpes
    Data:
    konferencja 6-10 lipca 2020
    Status:
    Opublikowana
  7. Ligaza OaAEP1 jako narzędzie molekularne do tworzenia wiązania peptydowego
    Autorzy:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Konferencja:
    Książka Abstraktów 2020/2021 63. Zjazd naukowy Polskiego Toważystwa Chemicznego (rok: 2021, tom: 63. Zjazd naukowy PTCHEM, strony: 438), Wydawca: PTCHEM
    Data:
    konferencja 13-17 Września 2021
    Status:
    Opublikowana
  8. Wiązanie jonów Cu(I) i Zn(II) przez ludzką metalotioneinę-3 (MT3) i jej ubikwitynylowaną formę
    Autorzy:
    Alicja Orzeł, Manuel Peris Diaz, Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Konferencja:
    Książka Abstraktów (rok: 2023, tom: 65. Zjazd Naukowy PTChem, strony: 160), Wydawca: Polskie Towarzystwo Chemiczne
    Data:
    konferencja 19-22.09.2023
    Status:
    Opublikowana
  9. Oddziaływania izoform ludzkich metalotionein z jednowartościowymi jonami miedzi
    Autorzy:
    Alicja Misiaszek, Artur Krężel
    Konferencja:
    Książka Abstraktów 2022. 64. Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2022, tom: 64. Zjazd Naukowy PTChem, strony: 156), Wydawca: PTChem
    Data:
    konferencja 11-16 września 2022
    Status:
    Opublikowana
  10. Highly efficient sortase-A and Ulp1-mediated purification method for the expression and purification of recombinant human MT3 in bacterial system
    Autorzy:
    Avinash Kumar Singh, Artur Krezel
    Konferencja:
    Abstracts of papers presented at the EMBO Workshop: Chemical biology 2022 (rok: 2022, tom: EMBO Workshop: Chemical biology 2022 EMBL Advanced Training Centre and virtual, strony: 173), Wydawca: EMBL Advanced Training Centre, Heidelberg
    Data:
    konferencja 5-8 września 2022
    Status:
    Opublikowana
  11. CHEMICAL OXIDATION OF P53 MONITORED BY MASS SPECTROMETRY
    Autorzy:
    Manuel Peris Diaz, Perdita Barran, Artur Krężel
    Konferencja:
    IMSC 2022 Abstract Book (rok: 2022, tom: 24th IMSC 2022: International Mass Spectrometry Conference, strony: 1028-1029), Wydawca: International Mass Spectrometry Foundation (IMSF)
    Data:
    konferencja 27 sierpnia - 2 września 2022
    Status:
    Opublikowana
  12. Oddziaływania izoform ludzkich metalotionein z jednowartościowymi jonami miedzi
    Autorzy:
    Alicja Misiaszek, Artur Krężel
    Konferencja:
    Książka Abstraktów 2022. 64. Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2022, tom: 64. Zjazd Naukowy PTChem, strony: 156), Wydawca: PTChem
    Data:
    konferencja 11-16 września 2022
    Status:
    Opublikowana
  13. Zinc to silver swap in zinc finger domains disrupts their native structures and DNA recognition
    Autorzy:
    Artur Krężel
    Konferencja:
    ICTEM 2022 Program and Abstract Book (rok: 2022, tom: ICTEM 2022: International Conference of Trace Elements and Minerals, strony: 67), Wydawca: Uniklinik RWTH Aachen
    Data:
    konferencja 5 czerwca - 10 czerwca 2022
    Status:
    Opublikowana
  14. Specificity factors that govern zinc-dependent assembly of CD4 coreceptor and Lck tyrosine kinase
    Autorzy:
    Anna Kocyla, Aleksander Czogalla, and Artur Krężel
    Konferencja:
    BioMetals 2020 (rok: 2020, tom: 12th International BioMetals, strony: ), Wydawca: Université Grenoble Alpes
    Data:
    konferencja 6-10 lipca 2020
    Status:
    Opublikowana
  15. WYKORZYSTANIE WYSOKOEFEKTYWNEJ LIGAZY ASPARAGINOWEJ DO SEMISYNTEZY BIAŁEK
    Autorzy:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Konferencja:
    Książka Abstraktów. 64. Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2022, tom: 64. Zjazd Naukowy PTChem, strony: 155), Wydawca: PTChem
    Data:
    konferencja 11-16 września
    Status:
    Opublikowana
  16. Highly efficient sortase-A and Ulp1-mediated purification method for the expression and purification of recombinant human MT3 in bacterial system
    Autorzy:
    Avinash Kumar Singh, Artur Krezel
    Konferencja:
    Abstracts of papers presented at the EMBO Workshop: Chemical biology 2022 (rok: 2022, tom: EMBO Workshop: Chemical biology 2022 EMBL Advanced Training Centre and virtual, strony: 173), Wydawca: EMBL Advanced Training Centre, Heidelberg
    Data:
    konferencja 5-8 września 2022
    Status:
    Opublikowana
  17. Semisynthesis of SmtA metallothionein using a highly efficient OaAEP1 ligase – comparison of metal binding properties of synthetic and E. coli-produced protein
    Autorzy:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Konferencja:
    EuroBIC16 Abstract Book (rok: 2022, tom: EuroBIC16: 16th European Biological Inorganic Chemistry Conference, strony: brak danych), Wydawca: University Grenoble Alpes
    Data:
    konferencja 17-21 lipca 2022
    Status:
    Opublikowana
  18. New efficient enzymatic strategy for the semisynthesis of metallothionein
    Autorzy:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Artur Krezel
    Konferencja:
    Abstracts of papers presented at the EMBO Workshop: Chemical biology 2022 (rok: 2022, tom: EMBO Workshop: Chemical biology 2022, EMBL Advanced Training Centre and virtual, strony: 66), Wydawca: EMBL Advanced Training Centre, Heidelberg
    Data:
    konferencja 5-8 września 2022
    Status:
    Opublikowana
  19. Ligaza OaAEP1 jako narzędzie molekularne do tworzenia wiązania peptydowego
    Autorzy:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Konferencja:
    Książka Abstraktów 2020/2021 63. Zjazd naukowy Polskiego Toważystwa Chemicznego (rok: 2021, tom: 63. Zjazd naukowy PTCHEM, strony: 438), Wydawca: PTCHEM
    Data:
    konferencja 13-17 Września 2021
    Status:
    Opublikowana
  20. Specificity factors that govern zinc-dependent assembly of CD4 coreceptor and Lck tyrosine kinase
    Autorzy:
    Anna Kocyla, Aleksander Czogalla, and Artur Krężel
    Konferencja:
    BioMetals 2020 (rok: 2020, tom: 12th International BioMetals, strony: ), Wydawca: Université Grenoble Alpes
    Data:
    konferencja 6-10 lipca 2020
    Status:
    Opublikowana
  21. Site-Specific sortase-mediated ubiquitination and sumoylation of proteins using fluorescent biarsenical probes
    Autorzy:
    Anastasiia Antonenko, Adam Pomorski, Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Konferencja:
    EFMC-ISCB Book of Abstracts (rok: 2023, tom: EFMC International Symposium on Chemical Biology, strony: 129), Wydawca: EFMC
    Data:
    konferencja 16-18.11.2023
    Status:
    Opublikowana
  22. Ligaza OaAEP1 jako narzędzie molekularne do tworzenia wiązania peptydowego
    Autorzy:
    Anastasiia Antonenko, Avinash Kumar Singh, Artur Krężel
    Konferencja:
    Książka Abstraktów 2020/2021 63. Zjazd naukowy Polskiego Toważystwa Chemicznego (rok: 2021, tom: 63. Zjazd naukowy PTCHEM, strony: 438), Wydawca: PTCHEM
    Data:
    konferencja 13-17 Września 2021
    Status:
    Opublikowana
  23. CHEMICAL OXIDATION OF P53 MONITORED BY MASS SPECTROMETRY
    Autorzy:
    Manuel Peris Diaz, Perdita Barran, Artur Krężel
    Konferencja:
    IMSC 2022 Abstract Book (rok: 2022, tom: 24th IMSC 2022: International Mass Spectrometry Conference, strony: 1028-1029), Wydawca: International Mass Spectrometry Foundation (IMSF)
    Data:
    konferencja 27 sierpnia - 2 września 2022
    Status:
    Opublikowana
  24. Zinc to silver swap in zinc finger domains disrupts their native structures and DNA recognition
    Autorzy:
    Artur Krężel
    Konferencja:
    ICTEM 2022 Program and Abstract Book (rok: 2022, tom: ICTEM 2022: International Conference of Trace Elements and Minerals, strony: 67), Wydawca: Uniklinik RWTH Aachen
    Data:
    konferencja 5 czerwca - 10 czerwca 2022
    Status:
    Opublikowana
  25. REGULACJA I DEREGULACJA FUNKCJI BIAŁEK CYNKOWYCH – WALKA DOBREGO Z DOBRYM I ZŁYM
    Autorzy:
    Artur Krężel
    Konferencja:
    Książka Abstraktów 2022. 64. Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Chemicznego (rok: 2022, tom: 64. Zjazd Naukowy PTChem, strony: 113), Wydawca: PTChem
    Data:
    konferencja 11-16 września 2022
    Status:
    Opublikowana