Projects funded by the NCN

Information on the principal investigator and host institution

Information of the project and the call

Keywords

Equipment

Delete all

2-oxoglutarate dependent oxygenases catalyzing atypical oxidative transformations - structural and mechanistic studies.

2014/15/B/NZ1/03331

Keywords:

oxygenase metalloenzyme ethylene formation deamination endoperoxidation protein crystallography molecular modelling reaction mechanism

Descriptors:

  • ST4_15: Colloid chemistry
  • NZ1_4: Structural biology

Panel:

NZ1 - Molecular biology, structural biology, biotechnology: molecular biology, structural biology, biotechnology

Host institution :

Instytut Katalizy i Fizykochemii Powierzchni im. Jerzego Habera PAN

woj. małopolskie

Other projects carried out by the institution 

Principal investigator (from the host institution):

prof. Tomasz Borowski 

Number of co-investigators in the project: 6

Call: OPUS 8 - announced on 2014-09-15

Amount awarded: 1 498 904 PLN

Project start date (Y-m-d): 2015-09-01

Project end date (Y-m-d): 2019-08-31

Project duration:: 48 months (the same as in the proposal)

Project status: Project settled

Equipment purchased [PL]

  1. Komputery stacjonarne typu desktop (3 szt.) (7 500 PLN)
  2. Serwer obliczeniowo-dyskowy wraz z zasilaczem awaryjnym oraz wyposażeniem do szafy serwerowej (25 000 PLN)
  3. Spektrofotometr do pomiarów mikrolitrowych próbek (40 000 PLN)
  4. Dewar do przechowywania próbek (8 000 PLN)
  5. Mikroskop stereoskopowy.
  6. Wolnostojąca wirówka z możliwością chłodzenia (100 000 PLN)
  7. Chromatograf FPLC.
  8. Dewar do przechowywania ciekłego azotu.
  9. Lodówka/lodówko-zamrażarka/zamrażarka laboratoryjna (5 000 PLN)
  10. Uchwyty na próbki kompatybilne z robotem do automatycznego montowania kryształów. (15 000 PLN)
  11. Sonifikator (22 000 PLN)
  12. Termocykler do monitorowania reakcji PCR w czasie rzeczywistym (90 000 PLN)
  13. Wytrząsarka z funkcją chłodzenia (40 000 PLN)
  14. Zestaw pipet.
  15. Autoklaw.
  16. Kolumna do FPLC.
  17. Zamrażarka głębokiego mrożenia (40 000 PLN)

Information in the final report

  • Publication in academic press/journals (2)
  • Book publications / chapters in book publications (1)
  1. A study on the structure, mechanism, and biochemistry of kanamycin B dioxygenase (KanJ)—an enzyme with a broad range of substrates
    Authors:
    Beata Mrugała, Anna Miłaczewska, Przemyslaw J. Porebski, Ewa Niedzialkowska, Maciej Guzik, Wladek Minor, Tomasz Borowski
    Academic press:
    The FEBS Journal (rok: 2021, tom: 288, strony: 1366-1386), Wydawca: FEBS PRESS
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1111/febs.15462 - link to the publication
  2. On the reaction mechanism of an endoperoxide ring formation by fumitremorgin B endoperoxidase. The right arrangement makes a difference
    Authors:
    Anna Miłaczewska, Tomasz Borowski
    Academic press:
    Dalton Transactions (rok: 2019, tom: 48, strony: 16211-16221), Wydawca: RSC
    Status:
    Published
    DOI:
    10.1039/C9DT02581B - link to the publication
  1. Model Setup and Procedures for Prediction of Enzyme Reaction Kinetics with QM-Only and QM:MM Approaches
    Authors:
    Michał Glanowski, Sangita Kachhap, Tomasz Borowski, Maciej Szaleniec
    Book:
    Methods Molecular Biology, Vol. 2385, Quentin Vanhaelen (Eds): Computational Methods for Estimating the Kinetic Parameters of Biological Systems , Wydawca: SpringerNature
    Status:
    Accepted for publication

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy