Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Biologiczny kod zawęźlenia - identyfikacja wzoru zawęźlenia w biomolekułach na postawie metod AI

2021/43/I/NZ1/03341

Słowa kluczowe:

biologia strukturalna teoria węzłów przewidywanie struktury zwijanie węzły lassa theta-krzywe

Deskryptory:

  • NZ2_8: Biologia obliczeniowa
  • NZ1_3: Biofizyka
  • ST1_6: Topologia

Panel:

NZ1 - Podstawowe procesy życiowe na poziomie molekularnym: biologia molekularna, biologia strukturalna, biotechnologia

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego

woj.

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr hab. Joanna Ida Sułkowska 

Liczba wykonawców projektu: 5

Konkurs: OPUS 22 (LAP) - ogłoszony 2021-09-15

Przyznana kwota: 1 279 475 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2022-09-23

Zakończenie projektu: 2025-09-22

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt w realizacji

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (3)
  1. AlphaFold predicts novel human proteins with knots
    Autorzy:
    AP Perlinska, WH Niemyska, BA Gren, M Bukowicki, S Nowakowski, P Rubach, JI Sulkowska
    Czasopismo:
    Protein Science (rok: 2023, tom: 32(5), strony: 45667), Wydawca: Wiley-Blackwell
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/pro.4631 - link do publikacji
  2. Knot or not? Identifying unknotted proteins in knotted families with sequence-based Machine Learning model
    Autorzy:
    D Šrámková, M Sikora, D Uchal, E Klimentová, AP Perlinska, ML Nguyen, M Korpacz, R Malinowska, P Rubach, P Šimeček, JI Sulkowska
    Czasopismo:
    Protein Science (rok: 2023, tom: 1, strony: 45678), Wydawca: Wiley-Blackwell
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1002/pro.4998 - link do publikacji
  3. Conservation of knotted and slipknotted topology in transmembrane transporters
    Autorzy:
    V Zayats, M Sikora, AP Perlinska, A Stasiulewicz, B Gren, JI Sulkowska
    Czasopismo:
    Biophysical Journal (rok: 2023, tom: 122(23), strony: 45667), Wydawca: Cell Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi: