Projekty finansowane przez NCN
Nowy mechanizm kontroli ekspresji genów u Eukaryota poprzez regulację długości ogonów poliadenozynowych kodujących transkryptów
2020/39/D/NZ2/02174
Słowa kluczowe:
regulacja ekspresji genów deadenylacja CCR4-NOT PAN2/3 białka wiążące ogon poliA
Deskryptory:
- NZ2_002: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ2_007: Bioinformatyka
Panel:
NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca:
Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej):
Liczba wykonawców projektu: 4
Konkurs: SONATA 16 - ogłoszony 2020-09-15
Przyznana kwota: 1 642 400 PLN
Rozpoczęcie projektu: 2021-10-01
Zakończenie projektu: 2025-09-30
Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)
Status projektu: Projekt w realizacji
Opis Projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Dane z raportu końcowego/rocznego
- Publikacje w czasopismach (2)
- Publikacje książkowe (2)
- Modeling of mRNA deadenylation rates reveal a complex relationship between mRNA deadenylation and decayAutorzy:Agnieszka Czarnocka-Cieciura, Jarosław Poznański, Matti Turtola, Rafał Tomecki, Paweł S Krawczyk, Seweryn Mroczek, Wiktoria Orzeł, Upasana Saha, Torben Heick Jensen, Andrzej Dziembowski, Agnieszka TudekCzasopismo:EMBO Journal (rok: 2024, tom: 43, strony: 6525-6554), Wydawca: Springer NatureStatus:OpublikowanaDoi:10.1038/s44318-024-00258-3 - link do publikacji
- A cap 0-dependent mRNA capture method to analyze the yeast transcriptome.Autorzy:Nowacka M, Latoch P, Izert MA, Karolak NK, Tomecki R, Koper M, Tudek A, Starosta AL, Górna MW.Czasopismo:Nucleic Acids Research (rok: 2022, tom: 2,09861111111111, strony: e132), Wydawca: Oxford AcademicStatus:OpublikowanaDoi:10.1093/nar/gkac903 - link do publikacji
- Transcriptome-Wide Analysis of mRNA Adenylation Status in Yeast Using Nanopore SequencingAutorzy:Paweł Krawczyk, Agnieszka Tudek, Seweryn Mroczek, Andrzej DziembowskiKsiążka:Methods in Molecular Biology (rok: 2023, tom: 2723, strony: 193-214), Wydawca: Springer (Humana Press)Status:OpublikowanaDoi:10.1007/978-1-0716-3481-3_12 - link do publikacji
- Purification of Enzymatically Active Xrn1 for Removal of Non-capped mRNAs from In Vitro Transcription Reactions and Evaluation of mRNA Decapping Status In VivoAutorzy:Karolina Drążkowska, Rafał Tomecki, Agnieszka TudekKsiążka:mRNA Decay (rok: 2024, tom: 2863, strony: 81-105), Wydawca: Springer NatureStatus:Opublikowana