Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Model ewolucji plastydów uwzględniający rolę peptydów antydrobnoustrojowych

2019/35/N/NZ8/03366

Słowa kluczowe:

endosymbioza organellum komórkowe plastyd peptydy antydrobnoustrojowe sekwencje kierujące transport białek

Deskryptory:

  • NZ8_1: Biologia ewolucyjna
  • NZ8_11: Botanika

Panel:

NZ8 - Podstawy wiedzy o życiu na poziomie środowiskowym: biologia ewolucyjna, biologia populacyjna, biologia środowiskowa, systematyka

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Wrocławski, Wydział Biotechnologii

woj.

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

Filip Pietluch 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: PRELUDIUM 18 - ogłoszony 2019-09-16

Przyznana kwota: 147 600 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2020-06-18

Zakończenie projektu: 2024-06-17

Planowany czas trwania projektu: 48 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (16)
  1. Testing Antimicrobial Properties of Human Lactoferrin-Derived Fragments
    Autorzy:
    Michał Ostrówka, Anna Duda-Madej. Filip Pietluch, Paweł Mackiewicz, Przemysław Gagat
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2023, tom: 24, strony: 10529), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms241310529 - link do publikacji
  2. Benchmarks in antimicrobial peptide prediction are biased due to the selection of negative data
    Autorzy:
    Katarzyna Sidorczuk, Przemysław Gagat, Filip Pietluch, Jakub Kała, Dominik Rafacz, Laura Bąkała, Jadwiga Słowik, Rafał Kolenda, Stefan Rödiger, Legana CHW Fingerhut, Ira R Cooke, Paweł Mackiewicz, Michał Burdukiewicz
    Czasopismo:
    Briefings in Bioinformatics (rok: 2022, tom: 23, strony: bbac343), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bib/bbac343 - link do publikacji
  3. Testing Antimicrobial Properties of Selected Short Amyloids
    Autorzy:
    Przemysław Gagat, Anna Duda-Madej, Michał Ostrówka, Filip Pietluch, Alicja Seniuk, Paweł Mackiewicz, Michał Burdukiewicz
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2023, tom: 24, strony: 804), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms24010804 - link do publikacji
  4. Characterization of signal and transit peptides based on motif composition and taxon-specific patterns
    Autorzy:
    Katarzyna Sidorczuk, Paweł Mackiewicz, Filip Pietluch, Przemysław Gagat
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2023, tom: 13, strony: 15751), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-023-42987-1 - link do publikacji
  5. Prediction of protein subplastid localization and origin with PlastoGram
    Autorzy:
    Katarzyna Sidorczuk, Przemysław Gagat, Jakub Kała, Henrik Nielsen, Filip Pietluch, Paweł Mackiewicz, Michał Burdukiewicz
    Czasopismo:
    Prediction of protein subplastid localization and origin with PlastoGram (rok: 2023, tom: 13, strony: 8365), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-023-35296-0 - link do publikacji
  6. CancerGram: An Effective Classifier for Differentiating Anticancer from Antimicrobial Peptides
    Autorzy:
    Burdukiewicz, Michał; Sidorczuk, Katarzyna; Rafacz, Dominik; Pietluch, Filip; Bąkała, Mateusz; Słowik, Jadwiga; Gagat, Przemysław
    Czasopismo:
    Pharmaceutics (rok: 2020, tom: 12(11), strony: 1045), Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/pharmaceutics12 - link do publikacji
  7. Testing Antimicrobial Properties of Human Lactoferrin-Derived Fragments
    Autorzy:
    Michał Ostrówka, Anna Duda-Madej. Filip Pietluch, Paweł Mackiewicz, Przemysław Gagat
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2023, tom: 24, strony: 10529), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms241310529 - link do publikacji
  8. CancerGram: An Effective Classifier for Differentiating Anticancer from Antimicrobial Peptides
    Autorzy:
    Burdukiewicz, Michał; Sidorczuk, Katarzyna; Rafacz, Dominik; Pietluch, Filip; Bąkała, Mateusz; Słowik, Jadwiga; Gagat, Przemysław
    Czasopismo:
    Pharmaceutics (rok: 2020, tom: 12(11), strony: 1045), Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/pharmaceutics12 - link do publikacji
  9. Characterization of signal and transit peptides based on motif composition and taxon-specific patterns
    Autorzy:
    Katarzyna Sidorczuk, Paweł Mackiewicz, Filip Pietluch, Przemysław Gagat
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2023, tom: 13, strony: 15751), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-023-42987-1 - link do publikacji
  10. Benchmarks in antimicrobial peptide prediction are biased due to the selection of negative data
    Autorzy:
    Katarzyna Sidorczuk, Przemysław Gagat, Filip Pietluch, Jakub Kała, Dominik Rafacz, Laura Bąkała, Jadwiga Słowik, Rafał Kolenda, Stefan Rödiger, Legana CHW Fingerhut, Ira R Cooke, Paweł Mackiewicz, Michał Burdukiewicz
    Czasopismo:
    Briefings in Bioinformatics (rok: 2022, tom: 23, strony: bbac343), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bib/bbac343 - link do publikacji
  11. CancerGram: An Effective Classifier for Differentiating Anticancer from Antimicrobial Peptides
    Autorzy:
    Burdukiewicz, Michał; Sidorczuk, Katarzyna; Rafacz, Dominik; Pietluch, Filip; Bąkała, Mateusz; Słowik, Jadwiga; Gagat, Przemysław
    Czasopismo:
    Pharmaceutics (rok: 2020, tom: 12(11), strony: 1045), Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/pharmaceutics12 - link do publikacji
  12. Testing Antimicrobial Properties of Selected Short Amyloids
    Autorzy:
    Przemysław Gagat, Anna Duda-Madej, Michał Ostrówka, Filip Pietluch, Alicja Seniuk, Paweł Mackiewicz, Michał Burdukiewicz
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2023, tom: 24, strony: 804), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms24010804 - link do publikacji
  13. CancerGram: An Effective Classifier for Differentiating Anticancer from Antimicrobial Peptides
    Autorzy:
    Burdukiewicz, Michał; Sidorczuk, Katarzyna; Rafacz, Dominik; Pietluch, Filip; Bąkała, Mateusz; Słowik, Jadwiga; Gagat, Przemysław
    Czasopismo:
    Pharmaceutics (rok: 2020, tom: 12(11), strony: 1045), Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/pharmaceutics12 - link do publikacji
  14. Testing Antimicrobial Properties of Selected Short Amyloids
    Autorzy:
    Przemysław Gagat, Anna Duda-Madej, Michał Ostrówka, Filip Pietluch, Alicja Seniuk, Paweł Mackiewicz, Michał Burdukiewicz
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2023, tom: 24, strony: 804), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms24010804 - link do publikacji
  15. Prediction of protein subplastid localization and origin with PlastoGram
    Autorzy:
    Katarzyna Sidorczuk, Przemysław Gagat, Jakub Kała, Henrik Nielsen, Filip Pietluch, Paweł Mackiewicz, Michał Burdukiewicz
    Czasopismo:
    Prediction of protein subplastid localization and origin with PlastoGram (rok: 2023, tom: 13, strony: 8365), Wydawca: Springer Nature
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-023-35296-0 - link do publikacji
  16. Benchmarks in antimicrobial peptide prediction are biased due to the selection of negative data
    Autorzy:
    Katarzyna Sidorczuk, Przemysław Gagat, Filip Pietluch, Jakub Kała, Dominik Rafacz, Laura Bąkała, Jadwiga Słowik, Rafał Kolenda, Stefan Rödiger, Legana CHW Fingerhut, Ira R Cooke, Paweł Mackiewicz, Michał Burdukiewicz
    Czasopismo:
    Briefings in Bioinformatics (rok: 2022, tom: 23, strony: bbac343), Wydawca: Oxford University Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/bib/bbac343 - link do publikacji