Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Kataliza DNA: w poszukiwaniu odpowiedzi

2018/31/D/NZ2/01883

Słowa kluczowe:

DNAzym biologia strukturalna baza danych krystalografia modelowanie molekularne analiza porównawcza

Deskryptory:

  • NZ2_7: Bioinformatyka
  • NZ1_1: Biologia molekularna
  • NZ1_4: Biologia strukturalna

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Maria Ponce Salvatierra 

Liczba wykonawców projektu: 3

Konkurs: SONATA 14 - ogłoszony 2018-09-14

Przyznana kwota: 1 247 150 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2019-07-01

Zakończenie projektu: 2022-12-31

Planowany czas trwania projektu: 42 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. Laptop. Za kwotę 6 000 PLN
  2. Pakiet office. Za kwotę 500 PLN
  3. Stacja dokująca. Za kwotę 500 PLN
  4. Monitor 27'' (2 szt.). Za kwotę 5 000 PLN
  5. Pamięć dyskowa. Za kwotę 2 000 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (4)
  1. Computational Pipeline for Reference-Free Comparative Analysis of RNA 3D Structures Applied to SARS-CoV-2 UTR Models
    Autorzy:
    Gumna J, Antczak M, Adamiak RW, Bujnicki JM, Chen SJ, Ding F, Ghosh P, Li J, Mukherjee S, Nithin C, Pachulska-Wieczorek K, Ponce-Salvatierra A, Popenda M, Sarzynska J, Wirecki T, Zhang D, Zhang S, Zok T, Westhof E, Miao Z, Szachniuk M, Rybarczyk A.
    Czasopismo:
    International journal of molecular sciences (rok: 2022, tom: 23, strony: 9630), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms23179630 - link do publikacji
  2. Genome-wide mapping of SARS-CoV-2 RNA structures identifies therapeutically-relevant elements
    Autorzy:
    Ilaria Manfredonia, Chandran Nithin, Almudena Ponce-Salvatierra, Pritha Ghosh, Tomasz K Wirecki, Tycho Marinus, Natacha S Ogando, Eric J Snijder, Martijn J van Hemert, Janusz M Bujnicki, and Danny Incarnato
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2020, tom: 48(22), strony: 12436-12452), Wydawca: Oxford Academic
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkaa1053 - link do publikacji
  3. DNAzymeBuilder, a web application for in situ generation of RNA/DNA-cleaving deoxyribozymes
    Autorzy:
    Razieh Mohammadi-Arani, Fatemeh Javadi-Zarnaghi, Pietro Boccaletto, Janusz M. Bujnicki, and Almudena Ponce-Salvatierra
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2022, tom: 50, strony: W261–W265), Wydawca: Oxford Academic
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkac269 - link do publikacji
  4. DNAmoreDB, a database of DNAzymes
    Autorzy:
    Almudena Ponce-Salvatierra, Pietro Boccaletto, Janusz M Bujnicki
    Czasopismo:
    Nucleic Acids Research (rok: 2021, tom: 49, strony: D76-D81), Wydawca: Oxford Academic
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1093/nar/gkaa867 - link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy