Modelowanie i ewolucja sekwencji kierujących do organelli pochodzenia endosymbiotycznego.
2018/31/N/NZ2/01338
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ2_3: Proteomika
- NZ2_7: Bioinformatyka
Panel
NZ2 – Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca
Uniwersytet Wrocławski, Wydział Biotechnologii
woj. dolnośląskie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 2
Konkurs
PRELUDIUM 16 – ogłoszony 2018-09-14
- Przyznana kwota
- 198 600 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2019-07-16
- Zakończenie projektu
- 2023-07-15
- Planowany czas trwania projektu
- 48 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Opis projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga — opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- Monitor komputerowy. Za kwotę 2 000 PLN
- Przenośny komputer osobisty. Za kwotę 9 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (6)
-
The dynamic landscape of peptide activity prediction
- Autorzy:
- Bárcenas, Oriol; Pintado-Grima, Carlos; Sidorczuk, Katarzyna; Teufel, Felix; Nielsen, Henrik; Ventura, Salvador; Burdukiewicz, Michał
- Czasopismo:
- Computational and Structural Biotechnology Journal (rok: 2022, tom: 20, strony: 6526-6533), Wydawca: ELSEVIER
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.csbj.2022.11.043 – link do publikacji
-
Benchmarks in antimicrobial peptide prediction are biased due to the selection of negative data
- Autorzy:
- Sidorczuk, Katarzyna; Gagat, Przemysław; Pietluch, Filip; Kała, Jakub; Rafacz, Dominik; Bąkała, Laura; Słowik, Jadwiga; Kolenda, Rafał; Rödiger, Stefan; Fingerhut, Legana C H W; Cooke, Ira R; Mackiewicz, Paweł; Burdukiewicz, Michał
- Czasopismo:
- Briefings in Bioinformatics (rok: 2022, tom: 23, strony: bbac343), Wydawca: Oxford Academic
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/bib/bbac343 – link do publikacji
-
CancerGram: An Effective Classifier for Differentiating Anticancer from Antimicrobial Peptides
- Autorzy:
- Burdukiewicz, Michał; Sidorczuk, Katarzyna; Rafacz, Dominik; Pietluch, Filip; Bąkała, Mateusz; Słowik, Jadwiga; Gagat, Przemysław
- Czasopismo:
- Pharmaceutics (rok: 2020, tom: 12(11), strony: 1045), Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3390/pharmaceutics12111045 – link do publikacji
-
Proteomic Screening for Prediction and Design of Antimicrobial Peptides with AmpGram
- Autorzy:
- Burdukiewicz, Michał; Sidorczuk, Katarzyna; Rafacz, Dominik; Pietluch, Filip; Chilimoniuk, Jarosław; Rödiger, Stefan; Gagat, Przemysław.
- Czasopismo:
- International Journal of Molecular Sciences (rok: 2020, tom: 21(12), strony: 4310), Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3390/ijms21124310 – link do publikacji
-
Prediction of protein subplastid localization and origin with PlastoGram
- Autorzy:
- Sidorczuk, Katarzyna; Gagat, Przemysław; Kała, Jakub; Nielsen, Henrik; Pietluch, Filip; Mackiewicz, Paweł; Burdukiewicz, Michał
- Czasopismo:
- Scientific Reports (rok: 2023, tom: 13, strony: 8365), Wydawca: Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/s41598-023-35296-0 – link do publikacji
-
Characterization of signal and transit peptides based on motif composition and taxon-specific patterns
- Autorzy:
- Sidorczuk, Katarzyna; Mackiewicz, Paweł; Pietluch, Filip; Gagat, Przemysław
- Czasopismo:
- Scientific Reports (rok: 2023, tom: 13, strony: 15751), Wydawca: Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/s41598-023-42987-1 – link do publikacji
Publikacje książkowe (1)
-
The Photosynthetic Adventure of Paulinella Spp.
- Autorzy:
- Gagat, Przemysław; Sidorczuk, Katarzyna; Pietluch, Filip; Mackiewicz, Paweł
- Książka:
- Symbiosis: Cellular, Molecular, Medical and Evolutionary Aspects (rok: 2020, tom: 69, strony: 353-386), Wydawca: Springer
- Status:
- Opublikowana