Projekty finansowane przez NCN

Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

MOLEKULARNE DETERMINANTY PROPAGACJI SYGNALU W RECEPTORACH DELTA I MU OPIOIDOWYCH - W POSZUKIWANIU ANALGETYKOW O MNIEJSZEJ ILOSCI OBJAWOW UBOCZNYCH

2017/27/N/NZ2/02571

Słowa kluczowe:

RECEPTOR OPIOIDOWY GPCR ANALGEZJA DYNAMIKI MOLEKULARNE

Deskryptory:

  • NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
  • NZ2_8: Biologia obliczeniowa
  • NZ2_7: Bioinformatyka

Panel:

NZ2 - Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna

Jednostka realizująca:

Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

Tomasz Stepniewski 

Liczba wykonawców projektu: 2

Konkurs: PRELUDIUM 14 - ogłoszony 2017-09-15

Przyznana kwota: 156 520 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2018-06-29

Zakończenie projektu: 2025-06-28

Planowany czas trwania projektu: 36 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt w realizacji

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (15)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. Ligand entry pathways control the chemical space recognized by GPR183
    Autorzy:
    Tomasz Maciej Stępniewski, Viktoria Madeline Skovgaard Kjær, Brian Medel-Lacruz, Lisa Reinmuth, Marija Ciba, Elisabeth Rexen Ulven, Massimiliano Bonomi, Jana Selent, Mette Marie Rosenkilde
    Czasopismo:
    Chemical Science (rok: 2023, tom: 14, strony: 10671 - 10683,), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/D2SC05962B - link do publikacji
  2. Phosphorylation barcodes direct biased chemokine signaling at CXCR3
    Autorzy:
    Dylan S Eiger, Jeffrey S Smith, Tujin Shi, Tomasz Maciej Stepniewski, Chia-Feng Tsai, Christopher Honeycutt, Noelia Boldizsar, Julia Gardner, Carrie D Nicora, Ahmed M Moghieb, Kouki Kawakami, Issac Choi, Chloe Hicks, Kevin Zheng, Anmol Warman, Priya Alagesan, Nicole M Knape, Ouwen Huang, Justin D Silverman, Richard D Smith, Asuka Inoue, Jana Selent, Jon M Jacobs, Sudarshan Rajagopal
    Czasopismo:
    Cell Chemical Biology (rok: 2023, tom: 30, strony: 362-382), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.chembiol.2023.03.006 - link do publikacji
  3. Structural dynamics bridge the gap between the genetic and functional levels of GPCRs
    Autorzy:
    Mariona Torrens-Fontanals, Tomasz M. Stepniewski, David E. Gloriam, Jana Selent
    Czasopismo:
    Current Opinion in Structural Biology (rok: 2021, tom: 69, strony: 150-159), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.sbi.2021.04.005 - link do publikacji
  4. Discovery of a dual Ras and ARF6 inhibitor from a GPCR endocytosis screen
    Autorzy:
    Jenna Giubilaro, Doris A. Schuetz, Tomasz M. Stepniewski, Yoon Namkung, Etienne Khoury, Mónica Lara-Márquez, Shirley Campbell, Alexandre Beautrait, Sylvain Armando, Olivier Radresa, Jean Duchaine, Nathalie Lamarche-Vane, Audrey Claing, Jana Selent, Michel Bouvier, Anne Marinier, Stéphane A. Laporte
    Czasopismo:
    Nature Communication (rok: 2021, tom: 12, strony: 45307), Wydawca: Nature Communications
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41467-021-249 - link do publikacji
  5. Ligand with Two Modes of Interaction with the Dopamine D2 Receptor–An Induced-Fit Mechanism of Insurmountable Antagonism
    Autorzy:
    Richard Agren, Hugo Zeberg, Tomasz Maciej Stepniewski, R. Benjamin Free, Sean W. Reilly, Robert R. Luedtka, Peter Arhem, Francisco Ciruela, David R. Sibley, Robert H. Mach, Jana Selent, Johanna Nilsson, Kristogger Sahlholm
    Czasopismo:
    ACS Chemical Neuroscience (rok: 2020, tom: 11, strony: 3130 - 3143), Wydawca: ACS Publications
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acschemneuro.0c00477 - link do publikacji
  6. Distinct phosphorylation sites in a prototypical GPCR differently orchestrate β-arrestin interaction, trafficking, and signaling
    Autorzy:
    Hemlata Dwivedi Agnihori, Madhu Chaturvedi, Mithu Baidya, Tomasz Maciej Stepniewski Shubhi Pandy, Jagannath Maharana, Ashish Srivastava, NAtarin Caengprasath, Aylin C Hanyaloglu, Jana Selent, Arun Shukla
    Czasopismo:
    Science Advances (rok: 2020, tom: 6, strony: eabb8368), Wydawca: American Association for the Advancement of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1126/sciadv.abb8368 - link do publikacji
  7. GPCRmd uncovers the dynamics of the 3D-GPCRome
    Autorzy:
    Ismael Rodríguez-Espigares, Mariona Torrens-Fontanals, Johanna KS Tiemann, David Aranda-García, Juan Manuel Ramírez-Anguita, Tomasz Maciej Stepniewski, Nathalie Worp, Alejandro Varela-Rial, Adrián Morales-Pastor, Brian Medel-Lacruz, Gáspár Pándy-Szekeres, Eduardo Mayol, Toni Giorgino, Jens Carlsson, Xavier Deupi, Slawomir Filipek, Marta Filizola, José Carlos Gómez-Tamayo, Angel Gonzalez, Hugo Gutierrez-de-Teran, Mireia Jiménez-Rosés, Willem Jespers, Jon Kapla, George Khelashvili, Peter Kolb, Dorota Latek, Maria Marti-Solano, Pierre Matricon, Minos-Timotheos Matsoukas, Przemyslaw Miszta, Mireia Olivella, Laura Perez-Benito, Davide Provasi, Santiago Ríos, Iván R Torrecillas, Jessica Sallander, Agnieszka Sztyler, Silvana Vasile, Harel Weinstein, Ulrich Zachariae, Peter W Hildebrand, Gianni De Fabritiis, Ferran Sanz, David E Gloriam, Arnau Cordomi, Ramon Guixà-González, Jana Selent
    Czasopismo:
    Nature Methods (rok: 2020, tom: 17, strony: 777-787), Wydawca: Nature Research
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41592-020-0884-y - link do publikacji
  8. Key phosphorylation sites in GPCRs orchestrate the contribution of β‐Arrestin 1 in ERK1/2 activation
    Autorzy:
    Mithu Baidya, Punita Kumari, Hemlata Dwivedi‐Agnihotri, Shubhi Pandey, Madhu Chaturvedi, Tomasz Maciej Stepniewski, Kouki Kawakami, Yubo Cao, Stéphane A Laporte, Jana Selent, Asuka Inoue, Arun K Shukla
    Czasopismo:
    EMBO reports (rok: 2020, tom: 21, strony: e49886), Wydawca: EMBO press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.15252/embr.201949886 - link do publikacji
  9. Mechanistic insights into dopaminergic and serotonergic neurotransmission–concerted interactions with helices 5 and 6 drive the functional outcome
    Autorzy:
    Tomasz Maciej Stepniewski, Arturo Mancini, Richard Ågren, Mariona Torrens-Fontanals, Meriem Semache, Michel Bouvier, Kristoffer Sahlholm, Billy Breton, Jana Selent
    Czasopismo:
    Chemical science (rok: 2021, tom: 12, strony: 10990-11003), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/D1SC00749A - link do publikacji
  10. A highly conserved δ‐opioid receptor region determines RGS4 interaction
    Autorzy:
    Christos Karoussiotis, Maria Marti‐Solano, Tomasz Maciej Stepniewski, Alexandra Symeonof, Jana Selent, Zafiroula Georgoussi
    Czasopismo:
    The FEBS Journal (rok: 2019, tom: wydanie on-line, strony: wydanie on-line), Wydawca: Wiley
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1111/febs.15033 - link do publikacji
  11. A molecular sensor for cholesterol in the human serotonin1A receptor
    Autorzy:
    Tomasz Maciej Stepniewski, G. Aditya Kumar, Parijat Sarkar, Md. Jafurulla, Shishu Pal Singh, Jana Selent, Amitabha Chattopadhyay
    Czasopismo:
    Science Advances (rok: 2021, tom: 7, strony: eabh2922), Wydawca: American Association for the Advancement of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1126/sciadv.abh2922 - link do publikacji
  12. Allosteric modulation of GPCR-induced β-arrestin trafficking and signaling by a synthetic intrabody
    Autorzy:
    Mithu Baidya, Madhu Chaturvedi, Hemlata Dwivedi-Agnihotri, Ashutosh Ranjan, Dominic Devost, Yoon Namkung, Tomasz Maciej Stepniewski, Shubhi Pandey, Minakshi Baruah, Bhanupriya Panigrahi, Parishmita Sarma, Manish K Yadav, Jagannath Maharana, Ramanuj Banerjee, Kouki Kawakami, Asuka Inoue, Jana Selent, Stéphane A Laporte, Terence E Hébert, Arun K Shukla
    Czasopismo:
    Nature Communications (rok: 2022, tom: 13, strony: 4634), Wydawca: Nature Portfolio
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41467-022-32386-x - link do publikacji
  13. Conformational sensors and domain swapping reveal structural and functional differences between β-arrestin isoforms
    Autorzy:
    Eshan Ghosh, Hemlata Dwivedi, Mithu Baidya, Ashish Srivastava, Punita Kumari, Tomek Stepniewski, Hee Ryung Kim, Mi-Hye Lee, Jaana van Gastel, Madhu Chaturvedi, Debarati Roy, Shubhi Pandey, Jagannath Maharana, Ramon Guixà-Gonzàlez, Louis M Luttrell, Ka Young Chung, Somnath Dutta, Jana Selent, Arun K Shukla
    Czasopismo:
    Cell reports (rok: 2019, tom: 28, strony: 32873299), Wydawca: Cell Press
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.celrep.2019.08.053 - link do publikacji
  14. How Do Molecular Dynamics Data Complement Static Structural Data of GPCRs
    Autorzy:
    Mariona Torrens-Fontanals, Tomasz Maciej Stepniewski, David Aranda-García, Adrián Morales-Pastor, Brian Medel-Lacruz, Jana Selent
    Czasopismo:
    International Journal of Molecular Sciences (rok: 2020, tom: 21, strony: 5933), Wydawca: MDPI
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.3390/ijms21165933 - link do publikacji
  15. Molecular insights into atypical modes of β-arrestin interaction with seven transmembrane receptors
    Autorzy:
    Jagannath Maharana, Fumiya K Sano, Parishmita Sarma, Manish K Yadav, Longhan Duan, Tomasz M Stepniewski, Madhu Chaturvedi, Ashutosh Ranjan, Vinay Singh, Sayantan Saha, Gargi Mahajan, Mohamed Chami, Wataru Shihoya, Jana Selent, Ka Young Chung, Ramanuj Banerjee, Osamu Nureki, Arun K Shukla
    Czasopismo:
    Science (rok: 2024, tom: 383, strony: 101-108), Wydawca: American Association for the Advancement of Science
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1126/science.adj3347 - link do publikacji
  1. Application of Biomolecular Simulations to G Protein–Coupled Receptors (GPCRs)
    Autorzy:
    M Torrens-Fontanals, TM Stepniewski, I Rodríguez-Espigares, J Selent
    Książka:
    Biomolecular Simulations in Structure‐Based Drug Discovery (rok: 2018, tom: 1, strony: 205-223), Wydawca: Wiley‐VCH Verlag GmbH & Co. KGaA
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    link do publikacji

O Narodowym Centrum Nauki

Finansowanie nauki

Współpraca zagraniczna

Centrum prasowe

Deklaracja dostępności
Przetwarzanie danych osobowych
Polityka cookies

Partnerzy