MOLEKULARNE DETERMINANTY PROPAGACJI SYGNALU W RECEPTORACH DELTA I MU OPIOIDOWYCH - W POSZUKIWANIU ANALGETYKOW O MNIEJSZEJ ILOSCI OBJAWOW UBOCZNYCH
2017/27/N/NZ2/02571
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ2_10: Modelowanie i symulacje biologiczne
- NZ2_8: Biologia obliczeniowa
- NZ2_7: Bioinformatyka
Panel
NZ2 – Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca
Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 2
Konkurs
PRELUDIUM 14 – ogłoszony 2017-09-15
- Przyznana kwota
- 156 520 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2018-06-29
- Zakończenie projektu
- 2025-06-28
- Planowany czas trwania projektu
- 84 miesiące (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Opis projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga — opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (16)
-
A highly conserved δ‐opioid receptor region determines RGS4 interaction
- Autorzy:
- Christos Karoussiotis, Maria Marti‐Solano, Tomasz Maciej Stepniewski, Alexandra Symeonof, Jana Selent, Zafiroula Georgoussi
- Czasopismo:
- The FEBS Journal (rok: 2019, tom: wydanie on-line, strony: wydanie on-line), Wydawca: Wiley
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1111/febs.15033 – link do publikacji
-
Molecular insights into atypical modes of β-arrestin interaction with seven transmembrane receptors
- Autorzy:
- Jagannath Maharana, Fumiya K Sano, Parishmita Sarma, Manish K Yadav, Longhan Duan, Tomasz M Stepniewski, Madhu Chaturvedi, Ashutosh Ranjan, Vinay Singh, Sayantan Saha, Gargi Mahajan, Mohamed Chami, Wataru Shihoya, Jana Selent, Ka Young Chung, Ramanuj Banerjee, Osamu Nureki, Arun K Shukla
- Czasopismo:
- Science (rok: 2024, tom: 383, strony: 101-108), Wydawca: American Association for the Advancement of Science
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1126/science.adj3347 – link do publikacji
-
Phosphorylation barcodes direct biased chemokine signaling at CXCR3
- Autorzy:
- Dylan S Eiger, Jeffrey S Smith, Tujin Shi, Tomasz Maciej Stepniewski, Chia-Feng Tsai, Christopher Honeycutt, Noelia Boldizsar, Julia Gardner, Carrie D Nicora, Ahmed M Moghieb, Kouki Kawakami, Issac Choi, Chloe Hicks, Kevin Zheng, Anmol Warman, Priya Alagesan, Nicole M Knape, Ouwen Huang, Justin D Silverman, Richard D Smith, Asuka Inoue, Jana Selent, Jon M Jacobs, Sudarshan Rajagopal
- Czasopismo:
- Cell Chemical Biology (rok: 2023, tom: 30, strony: 362-382), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.chembiol.2023.03.006 – link do publikacji
-
An arginine switch drives the stepwise activation of β-arrestin by CXCR7
- Autorzy:
- Jeong Seok Ji, Yaejin Yun, Tomasz Maciej Stepniewski, Hye-Jin Yoon, Kyungjin Min, Ji Young Park, Chiwoon Chung, Miguel Dieguez Eceolaza, Ka Young Chung, Jana Selent, Hyung Ho Lee
- Czasopismo:
- Plos biology (rok: 2025, tom: NA, strony: NA), Wydawca: Public Library of Science
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1371/journal.pbio.3003312 – link do publikacji
-
How Do Molecular Dynamics Data Complement Static Structural Data of GPCRs
- Autorzy:
- Mariona Torrens-Fontanals, Tomasz Maciej Stepniewski, David Aranda-García, Adrián Morales-Pastor, Brian Medel-Lacruz, Jana Selent
- Czasopismo:
- International Journal of Molecular Sciences (rok: 2020, tom: 21, strony: 5933), Wydawca: MDPI
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3390/ijms21165933 – link do publikacji
-
Distinct phosphorylation sites in a prototypical GPCR differently orchestrate β-arrestin interaction, trafficking, and signaling
- Autorzy:
- Hemlata Dwivedi Agnihori, Madhu Chaturvedi, Mithu Baidya, Tomasz Maciej Stepniewski Shubhi Pandy, Jagannath Maharana, Ashish Srivastava, NAtarin Caengprasath, Aylin C Hanyaloglu, Jana Selent, Arun Shukla
- Czasopismo:
- Science Advances (rok: 2020, tom: 6, strony: eabb8368), Wydawca: American Association for the Advancement of Science
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1126/sciadv.abb8368 – link do publikacji
-
Conformational sensors and domain swapping reveal structural and functional differences between β-arrestin isoforms
- Autorzy:
- Eshan Ghosh, Hemlata Dwivedi, Mithu Baidya, Ashish Srivastava, Punita Kumari, Tomek Stepniewski, Hee Ryung Kim, Mi-Hye Lee, Jaana van Gastel, Madhu Chaturvedi, Debarati Roy, Shubhi Pandey, Jagannath Maharana, Ramon Guixà-Gonzàlez, Louis M Luttrell, Ka Young Chung, Somnath Dutta, Jana Selent, Arun K Shukla
- Czasopismo:
- Cell reports (rok: 2019, tom: 28, strony: 32873299), Wydawca: Cell Press
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.celrep.2019.08.053 – link do publikacji
-
Ligand with Two Modes of Interaction with the Dopamine D2 Receptor–An Induced-Fit Mechanism of Insurmountable Antagonism
- Autorzy:
- Richard Agren, Hugo Zeberg, Tomasz Maciej Stepniewski, R. Benjamin Free, Sean W. Reilly, Robert R. Luedtka, Peter Arhem, Francisco Ciruela, David R. Sibley, Robert H. Mach, Jana Selent, Johanna Nilsson, Kristogger Sahlholm
- Czasopismo:
- ACS Chemical Neuroscience (rok: 2020, tom: 11, strony: 3130 - 3143), Wydawca: ACS Publications
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1021/acschemneuro.0c00477 – link do publikacji
-
Key phosphorylation sites in GPCRs orchestrate the contribution of β‐Arrestin 1 in ERK1/2 activation
- Autorzy:
- Mithu Baidya, Punita Kumari, Hemlata Dwivedi‐Agnihotri, Shubhi Pandey, Madhu Chaturvedi, Tomasz Maciej Stepniewski, Kouki Kawakami, Yubo Cao, Stéphane A Laporte, Jana Selent, Asuka Inoue, Arun K Shukla
- Czasopismo:
- EMBO reports (rok: 2020, tom: 21, strony: e49886), Wydawca: EMBO press
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.15252/embr.201949886 – link do publikacji
-
GPCRmd uncovers the dynamics of the 3D-GPCRome
- Autorzy:
- Ismael Rodríguez-Espigares, Mariona Torrens-Fontanals, Johanna KS Tiemann, David Aranda-García, Juan Manuel Ramírez-Anguita, Tomasz Maciej Stepniewski, Nathalie Worp, Alejandro Varela-Rial, Adrián Morales-Pastor, Brian Medel-Lacruz, Gáspár Pándy-Szekeres, Eduardo Mayol, Toni Giorgino, Jens Carlsson, Xavier Deupi, Slawomir Filipek, Marta Filizola, José Carlos Gómez-Tamayo, Angel Gonzalez, Hugo Gutierrez-de-Teran, Mireia Jiménez-Rosés, Willem Jespers, Jon Kapla, George Khelashvili, Peter Kolb, Dorota Latek, Maria Marti-Solano, Pierre Matricon, Minos-Timotheos Matsoukas, Przemyslaw Miszta, Mireia Olivella, Laura Perez-Benito, Davide Provasi, Santiago Ríos, Iván R Torrecillas, Jessica Sallander, Agnieszka Sztyler, Silvana Vasile, Harel Weinstein, Ulrich Zachariae, Peter W Hildebrand, Gianni De Fabritiis, Ferran Sanz, David E Gloriam, Arnau Cordomi, Ramon Guixà-González, Jana Selent
- Czasopismo:
- Nature Methods (rok: 2020, tom: 17, strony: 777-787), Wydawca: Nature Research
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/s41592-020-0884-y – link do publikacji
-
Mechanistic insights into dopaminergic and serotonergic neurotransmission–concerted interactions with helices 5 and 6 drive the functional outcome
- Autorzy:
- Tomasz Maciej Stepniewski, Arturo Mancini, Richard Ågren, Mariona Torrens-Fontanals, Meriem Semache, Michel Bouvier, Kristoffer Sahlholm, Billy Breton, Jana Selent
- Czasopismo:
- Chemical science (rok: 2021, tom: 12, strony: 10990-11003), Wydawca: Royal Society of Chemistry
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1039/D1SC00749A – link do publikacji
-
Allosteric modulation of GPCR-induced β-arrestin trafficking and signaling by a synthetic intrabody
- Autorzy:
- Mithu Baidya, Madhu Chaturvedi, Hemlata Dwivedi-Agnihotri, Ashutosh Ranjan, Dominic Devost, Yoon Namkung, Tomasz Maciej Stepniewski, Shubhi Pandey, Minakshi Baruah, Bhanupriya Panigrahi, Parishmita Sarma, Manish K Yadav, Jagannath Maharana, Ramanuj Banerjee, Kouki Kawakami, Asuka Inoue, Jana Selent, Stéphane A Laporte, Terence E Hébert, Arun K Shukla
- Czasopismo:
- Nature Communications (rok: 2022, tom: 13, strony: 4634), Wydawca: Nature Portfolio
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/s41467-022-32386-x – link do publikacji
-
Ligand entry pathways control the chemical space recognized by GPR183
- Autorzy:
- Tomasz Maciej Stępniewski, Viktoria Madeline Skovgaard Kjær, Brian Medel-Lacruz, Lisa Reinmuth, Marija Ciba, Elisabeth Rexen Ulven, Massimiliano Bonomi, Jana Selent, Mette Marie Rosenkilde
- Czasopismo:
- Chemical Science (rok: 2023, tom: 14, strony: 10671 - 10683,), Wydawca: Royal Society of Chemistry
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1039/D2SC05962B – link do publikacji
-
Discovery of a dual Ras and ARF6 inhibitor from a GPCR endocytosis screen
- Autorzy:
- Jenna Giubilaro, Doris A. Schuetz, Tomasz M. Stepniewski, Yoon Namkung, Etienne Khoury, Mónica Lara-Márquez, Shirley Campbell, Alexandre Beautrait, Sylvain Armando, Olivier Radresa, Jean Duchaine, Nathalie Lamarche-Vane, Audrey Claing, Jana Selent, Michel Bouvier, Anne Marinier, Stéphane A. Laporte
- Czasopismo:
- Nature Communication (rok: 2021, tom: 12, strony: 46038), Wydawca: Nature Communications
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/s41467-021-249 – link do publikacji
-
Structural dynamics bridge the gap between the genetic and functional levels of GPCRs
- Autorzy:
- Mariona Torrens-Fontanals, Tomasz M. Stepniewski, David E. Gloriam, Jana Selent
- Czasopismo:
- Current Opinion in Structural Biology (rok: 2021, tom: 69, strony: 150-159), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.sbi.2021.04.005 – link do publikacji
-
A molecular sensor for cholesterol in the human serotonin1A receptor
- Autorzy:
- Tomasz Maciej Stepniewski, G. Aditya Kumar, Parijat Sarkar, Md. Jafurulla, Shishu Pal Singh, Jana Selent, Amitabha Chattopadhyay
- Czasopismo:
- Science Advances (rok: 2021, tom: 7, strony: eabh2922), Wydawca: American Association for the Advancement of Science
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1126/sciadv.abh2922 – link do publikacji
Publikacje książkowe (1)
-
Application of Biomolecular Simulations to G Protein–Coupled Receptors (GPCRs)
- Autorzy:
- M Torrens-Fontanals, TM Stepniewski, I Rodríguez-Espigares, J Selent
- Książka:
- Biomolecular Simulations in Structure‐Based Drug Discovery (rok: 2018, tom: 1, strony: 205-223), Wydawca: Wiley‐VCH Verlag GmbH & Co. KGaA
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- link do publikacji