Dyfuzja w zatłoczonym środowisku żywych komórek: Wpływ właściwości makrocząsteczek i metabolizmu komórkowego
2017/25/B/ST3/02456
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ1_3: Biofizyka
- ST3_4: Transport w materii skondensowanej
Panel
ST3 – Fizyka fazy skondensowanej: struktura, własności elektronowe, płyny, nano-nauka
Jednostka realizująca
Instytut Chemii Fizycznej Polskiej Akademii Nauk
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 3
Konkurs
OPUS 13 – ogłoszony 2017-03-15
- Przyznana kwota
- 852 680 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2018-02-14
- Zakończenie projektu
- 2023-02-13
- Planowany czas trwania projektu
- 60 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Opis projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga — opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- QNAP file server. Za kwotę 19 985 PLN
- maly kluster komputerowy. Za kwotę 60 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (8)
-
Crowding-regulated binding of divalent biomolecules
- Autorzy:
- Tomasz Skóra, Mathijs Janssen, Andreas Carlson, and Svyatoslav Kondrat
- Czasopismo:
- Physical Review Letters (rok: 2023, tom: 130, strony: 258401), Wydawca: American Physical Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1103/PhysRevLett.130.258401 – link do publikacji
-
Can enzyme proximity accelerate cascade reactions?
- Autorzy:
- Andrij Kuzmak, Sheiliza Carmali, Eric von Lieres, Alan J Russell, Svyatoslav Kondrat
- Czasopismo:
- Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 455), Wydawca: Nature Publishing Group
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/s41598-018-37034-3 – link do publikacji
-
A minimal coarse-grained model for Immunoglobulin G (IgG): Diffusion and binding under crowding
- Autorzy:
- Edyta Slyk, Tomasz Skóra, and Svyatoslav Kondrat
- Czasopismo:
- Journal of Physical Chemistry B (rok: 2023, tom: 127, strony: 7442-7448), Wydawca: ACS
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1021/acs.jpcb.3c02383 – link do publikacji
-
Enzyme co-localisation: Mechanisms and benefits
- Autorzy:
- Svyatoslav Kondrat, Ulrich Krauss, Eric von Lieres
- Czasopismo:
- Current research in chemical biology (rok: 2022, tom: 2, strony: 100031), Wydawca: Elsevier
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1016/j.crchbi.2022.100031 – link do publikacji
-
Conformation-changing enzymes and macromolecular crowding
- Autorzy:
- Tomasz Skóra, Mihail N. Popescu, and Svyatoslav Kondrat
- Czasopismo:
- Physical Chemistry Chemical Physics (rok: 2021, tom: 23, strony: 9065-9069), Wydawca: Royal Society of Chemistry
- Status:
- Opublikowana
-
How macromolecules softness affects diffusion under crowding
- Autorzy:
- Edyta Słyk, Tomasz Skóra, Svyatoslav Kondrat
- Czasopismo:
- Soft Matter (rok: 2022, tom: 18, strony: 5366-5370), Wydawca: Royal Society of Chemistry
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1039/D2SM00357K – link do publikacji
-
Macromolecular Crowding: How Shape and Interactions Affect Diffusion
- Autorzy:
- Tomasz Skóra, Farzaneh Vaghefikia, Jörg Fitter, Svyatoslav Kondrat
- Czasopismo:
- The Journal of Physical Chemistry B (rok: 2020, tom: 124, strony: 7537-7543), Wydawca: American Chemical Society
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1021/acs.jpcb.0c04846 – link do publikacji
-
Brownian dynamics assessment of enhanced diffusion exhibited by 'fluctuating-dumbbell enzymes'
- Autorzy:
- Svyatoslav Kondrat and Mihail N. Popescu
- Czasopismo:
- Phys. Chem. Chem. Phys. (rok: 2019, tom: 21, strony: 18811-18815), Wydawca: Royal Society of Chemistry
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1039/C9CP02842K – link do publikacji
Publikacje książkowe (1)
-
Mechanisms and Effects of Substrate Channelling in Enzymatic Cascades
- Autorzy:
- Svyatoslav Kondrat, Eric von Lieres
- Książka:
- Multienzymatic Assemblies (rok: 2021, tom: 3, strony: 27-50), Wydawca: Springer US
- Status:
- Opublikowana