Projekty finansowane przez NCN


Dane kierownika projektu i jednostki realizującej

Szczegółowe informacje o projekcie i konkursie

Słowa kluczowe

Aparatura

Wyczyść formularz

Dyfuzja w zatłoczonym środowisku żywych komórek: Wpływ właściwości makrocząsteczek i metabolizmu komórkowego

2017/25/B/ST3/02456

Słowa kluczowe:

dyfuzja makrocząsteczki żywy komórki zatłoczone środowiskowo metabolizmy

Deskryptory:

  • NZ1_3: Biofizyka
  • ST3_4: Transport w materii skondensowanej

Panel:

ST3 - Fizyka fazy skondensowanej: struktura, własności elektronowe, płyny, nano-nauka

Jednostka realizująca:

Instytut Chemii Fizycznej Polskiej Akademii Nauk

woj. mazowieckie

Inne projekty tej jednostki 

Kierownik projektu (z jednostki realizującej):

dr Svyatoslav Kondrat 

Liczba wykonawców projektu: 3

Konkurs: OPUS 13 - ogłoszony 2017-03-15

Przyznana kwota: 852 680 PLN

Rozpoczęcie projektu: 2018-02-01

Zakończenie projektu: 2023-02-13

Planowany czas trwania projektu: 60 miesięcy (z wniosku)

Status projektu: Projekt rozliczony

Opis Projektu

Pobierz opis projektu w formacie .pdf

Uwaga - opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.

Zakupiona aparatura

  1. maly kluster komputerowy. Za kwotę 60 000 PLN
  2. QNAP file server. Za kwotę 19 985 PLN

Dane z raportu końcowego/rocznego

  • Publikacje w czasopismach (9)
  • Publikacje książkowe (1)
  1. A minimal coarse-grained model for Immunoglobulin G (IgG): Diffusion and binding under crowding
    Autorzy:
    Edyta Slyk, Tomasz Skóra, and Svyatoslav Kondrat
    Czasopismo:
    Journal of Physical Chemistry B (rok: 2023, tom: 127, strony: 7442-7448), Wydawca: ACS
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.3c02383 - link do publikacji
  2. Can enzyme proximity accelerate cascade reactions?
    Autorzy:
    Andrij Kuzmak, Sheiliza Carmali, Eric von Lieres, Alan J Russell, Svyatoslav Kondrat
    Czasopismo:
    Scientific Reports (rok: 2019, tom: 9, strony: 455), Wydawca: Nature Publishing Group
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1038/s41598-018-37034-3 - link do publikacji
  3. Crowding-regulated binding of divalent biomolecules
    Autorzy:
    Tomasz Skóra, Mathijs Janssen, Andreas Carlson, and Svyatoslav Kondrat
    Czasopismo:
    Physical Review Letters (rok: 2023, tom: 130, strony: 258401), Wydawca: American Physical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1103/PhysRevLett.130.258401 - link do publikacji
  4. Macromolecular Crowding: How Shape and Interactions Affect Diffusion
    Autorzy:
    Tomasz Skóra, Farzaneh Vaghefikia, Jörg Fitter, Svyatoslav Kondrat
    Czasopismo:
    The Journal of Physical Chemistry B (rok: 2020, tom: 124, strony: 7537-7543), Wydawca: American Chemical Society
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1021/acs.jpcb.0c04846 - link do publikacji
  5. Size Sensitivity of Metabolite Diffusion in Macromolecular Crowds
    Autorzy:
    Edyta Słyk, Dariusz Gołowicz, Tomasz Skóra, Krzysztof Kazimierczuk, and Svyatoslav Kondrat
    Czasopismo:
    Nano Letters (rok: 2024, tom: na, strony: na), Wydawca: ACS
    Status:
    Złożona
  6. Brownian dynamics assessment of enhanced diffusion exhibited by 'fluctuating-dumbbell enzymes'
    Autorzy:
    Svyatoslav Kondrat and Mihail N. Popescu
    Czasopismo:
    Phys. Chem. Chem. Phys. (rok: 2019, tom: 21, strony: 18811-18815), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/C9CP02842K - link do publikacji
  7. Conformation-changing enzymes and macromolecular crowding
    Autorzy:
    Tomasz Skóra, Mihail N. Popescu, and Svyatoslav Kondrat
    Czasopismo:
    Physical Chemistry Chemical Physics (rok: 2021, tom: 23, strony: 9065-9069), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    0.1039/D0CP06631A - link do publikacji
  8. Enzyme co-localisation: Mechanisms and benefits
    Autorzy:
    Svyatoslav Kondrat, Ulrich Krauss, Eric von Lieres
    Czasopismo:
    Current research in chemical biology (rok: 2022, tom: 2, strony: 100031), Wydawca: Elsevier
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1016/j.crchbi.2022.100031 - link do publikacji
  9. How macromolecules softness affects diffusion under crowding
    Autorzy:
    Edyta Słyk, Tomasz Skóra, Svyatoslav Kondrat
    Czasopismo:
    Soft Matter (rok: 2022, tom: 18, strony: 5366-5370), Wydawca: Royal Society of Chemistry
    Status:
    Opublikowana
    Doi:
    10.1039/D2SM00357K - link do publikacji
  1. Mechanisms and Effects of Substrate Channelling in Enzymatic Cascades
    Autorzy:
    Svyatoslav Kondrat, Eric von Lieres
    Książka:
    Multienzymatic Assemblies (rok: 2021, tom: 3, strony: 27-50), Wydawca: Springer US
    Status:
    Opublikowana