Analiza wybranych procesów wpływających na architekturę genomów i skład proteomów u grzybów
2017/25/B/NZ2/01880
Słowa kluczowe
Deskryptory
- NZ2_2: Genomika, transkryptomika i epigenomika
- NZ6_7: Mykologia
Panel
NZ2 – Genetyka, genomika: Genetyka molekularna, genomika, proteomika, bioinformatyka, biologia systemowa, epidemiologia molekularna
Jednostka realizująca
Instytut Biochemii i Biofizyki PAN
woj. mazowieckie
Kierownik projektu (z jednostki realizującej)
Liczba wykonawców projektu: 5
Konkurs
OPUS 13 – ogłoszony 2017-03-15
- Przyznana kwota
- 403 840 PLN
- Rozpoczęcie projektu
- 2018-01-19
- Zakończenie projektu
- 2022-01-18
- Planowany czas trwania projektu
- 48 miesięcy (z wniosku)
- Status projektu
- Projekt rozliczony
Opis projektu
Pobierz opis projektu w formacie .pdf
Uwaga — opisy projektów zostały sporządzone przez samych autorów wniosków i w niezmienionej formie umieszczone w systemie.
Zakupiona aparatura
- laptop (2 szt.). Za kwotę 10 000 PLN
- serwer bioinformatyczny. Za kwotę 36 000 PLN
Dane z raportu końcowego/rocznego
Publikacje w czasopismach (8)
-
Locus-aware decomposition of gene trees with respect to polytomous species trees
- Autorzy:
- Ciach MA, Muszewska A, Górecki P
- Czasopismo:
- Algorithms for Molecular Biology (rok: 2018, tom: 0,549305555555556, strony: 18), Wydawca: Springer Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1186/s13015-018-0128-1 – link do publikacji
-
Transposable elements contribute to fungal genes and impact fungal lifestyle
- Autorzy:
- MUSZEWSKA A., STECZKIEWICZ K., STĘPNIEWSKA-DZIUBIŃSKA M.M., GINALSKI K.
- Czasopismo:
- Scientific Reports (rok: 2019, tom: 3,36597222222222, strony: -), Wydawca: Springer Nature
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1038/s41598-019-40965-0 – link do publikacji
-
Utilization of cobalamin is ubiquitous in early-branching fungal phyla
- Autorzy:
- Małgorzata Orłowska, Kamil Steczkiewicz and Anna Muszewska
- Czasopismo:
- Genome Biology and Evolution (rok: 2021, tom: brak, strony: brak), Wydawca: Oxford Journals
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.1093/gbe/evab043 – link do publikacji
-
Terpenoid Biosynthesis Dominates among Secondary Metabolite Clusters in Mucoromycotina Genomes
- Autorzy:
- Grzegorz Koczyk, Julia Pawłowska, Anna Muszewska
- Czasopismo:
- Journal of Fungi (rok: 2021, tom: 7, strony: -), Wydawca: MDPI
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3390/jof7040285 – link do publikacji
-
In Silico Predictions of Ecological Plasticity Mediated by Protein Family Expansions in Early-Diverging Fungi
- Autorzy:
- Małgorzata Orłowska, Anna Muszewska
- Czasopismo:
- Journal of Fungi (rok: 2022, tom: 8, strony: -), Wydawca: MDPI
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3390/jof8010067 – link do publikacji
-
Poly-Saturated Dolichols from Filamentous Fungi Modulate Activity of Dolichol-Dependent Glycosyltransferase and Physical Properties of Membranes
- Autorzy:
- Gryz E, Perlińska-Lenart U, Gawarecka K, Jozwiak A, Piłsyk S, Lipko A, Jemiola-Rzeminska M, Bernat P, Muszewska A, Steczkiewicz K, Ginalski K, Długoński J, Strzalka K, Swiezewska E, Kruszewska JS
- Czasopismo:
- International journal of molecular sciences (rok: 2019, tom: 20, strony: 3043), Wydawca: MDPI
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3390/ijms20123043 – link do publikacji
-
Analysis of transposable elements in Coccidioides species
- Autorzy:
- T Kirkland, A Muszewska, J Stajich
- Czasopismo:
- Journal of Fungi (rok: 2018, tom: 4(1), strony: 13), Wydawca: MDPI
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3390/jof4010013 – link do publikacji
-
Metabolic Potential, Ecology and Presence of Associated Bacteria Is Reflected in Genomic Diversity of Mucoromycotina
- Autorzy:
- Muszewska Anna, Okrasińska Alicja, Steczkiewicz Kamil, Drgas Olga, Orłowska Małgorzata, Perlińska-Lenart Urszula, Aleksandrzak-Piekarczyk Tamara, Szatraj Katarzyna, Zielenkiewicz Urszula, Piłsyk Sebastian, Malc Ewa, Mieczkowski Piotr, Kruszewska Joanna S., Bernat Przemysław, Pawłowska Julia
- Czasopismo:
- Frontiers in Microbiology (rok: 2021, tom: 12, strony: 239), Wydawca: Frontiers
- Status:
- Opublikowana
- DOI:
- 10.3389/fmicb.2021.636986 – link do publikacji